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公开(公告)号：CN111855982B
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN201910339303.9
申请日：2019-04-25
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： G01N33/487 , G01N33/53
摘要： 一种检测核酸片段长度的方法，包括：将待检测核酸稀释至预定浓度；分别取等量体积的核酸与梯度倍数用量的磁珠结合；通过磁力装置吸附结合了核酸的磁珠，并去除上清；使用等量体积的洗脱缓冲液回溶磁珠上结合的核酸，并检测回溶核酸浓度；计算核酸与磁珠结合前后的浓度差异，并形成浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的曲线关系；将曲线关系与标准品曲线进行比对得到待检测核酸的片段长度，其中标准品曲线包括预定浓度的不同片段长度的核酸标准品与梯度倍数用量的磁珠结合前后的浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的对应关系。本发明的方法基于同种磁珠不同浓度倍数对核酸片段偏向性筛选的特性，结合数据分析对核酸片段的长度进行简易高效的检测。
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公开(公告)号：CN111855982A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN201910339303.9
申请日：2019-04-25
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： G01N33/487 , G01N33/53
摘要： 一种检测核酸片段长度的方法，包括：将待检测核酸稀释至预定浓度；分别取等量体积的核酸与梯度倍数用量的磁珠结合；通过磁力装置吸附结合了核酸的磁珠，并去除上清；使用等量体积的洗脱缓冲液回溶磁珠上结合的核酸，并检测回溶核酸浓度；计算核酸与磁珠结合前后的浓度差异，并形成浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的曲线关系；将曲线关系与标准品曲线进行比对得到待检测核酸的片段长度，其中标准品曲线包括预定浓度的不同片段长度的核酸标准品与梯度倍数用量的磁珠结合前后的浓度差异与磁珠梯度倍数用量之间的对应关系。本发明的方法基于同种磁珠不同浓度倍数对核酸片段偏向性筛选的特性，结合数据分析对核酸片段的长度进行简易高效的检测。
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公开(公告)号：CN111462818A
公开(公告)日：2020-07-28
申请号：CN201910058957.4
申请日：2019-01-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
摘要： 一种测序产量预测方法和建立测序产量预测模型的方法及装置，测序产量预测方法包括：获取测序过程中的测序数据，包括BIC、ESR和ACCGRR，或BIC、FIT、ESR和光强；根据测序数据和测序产量预测模型公式，预测测序完成时的测序产量；和输出预测出的测序完成时的测序产量。本发明能够有效预测测序平台的测序产量，通过实时监控测序过程中的测序仪参数变化，实现测序产量早预测、测序异常早发现，从而缩短生产交付周期，并及时向前端反馈测序进展。
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公开(公告)号：CN111073960A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN201811231237.5
申请日：2018-10-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12M1/34
摘要： 本申请公开了一种测序仪激光扩束器的调试方法及装置，调试方法，检测激光扩束器发射激光的同一个焦面上若干位置的激光光强值；根据若干个位置的激光光强值计算出扩束器的偏离系数，并计算出调节角度值；根据计算出的调节角度值调节激光扩束器上的调节旋钮，进行对焦调试。由于检测发射激光在同一焦面上的不同位置的光强大小，再通过进行计算分析得到激光光强的均一性，并且计算出调节的角度值，调试人员可根据计算出的调节角度值对测序仪激光扩束器进行对焦调节，实现测序仪激光扩束器的均一性调试，本调试方法及装置借助设备完成，调试的精度高和效率高。
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公开(公告)号：CN111462818B
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN201910058957.4
申请日：2019-01-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
摘要： 一种测序产量预测方法和建立测序产量预测模型的方法及装置，测序产量预测方法包括：获取测序过程中的测序数据，包括BIC、ESR和ACCGRR，或BIC、FIT、ESR和光强；根据测序数据和测序产量预测模型公式，预测测序完成时的测序产量；和输出预测出的测序完成时的测序产量。本发明能够有效预测测序平台的测序产量，通过实时监控测序过程中的测序仪参数变化，实现测序产量早预测、测序异常早发现，从而缩短生产交付周期，并及时向前端反馈测序进展。
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公开(公告)号：CN113646471A
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN201980087605.X
申请日：2019-09-20
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
摘要： 提供了一种测序文库的构建方法、测序方法及试剂盒和应用。该测序文库的构建方法包括将线性双链DNA样本进行损伤修复和末端修复，以便获得经修复的DNA样本；将所述经修复的DNA样本进行同源重组，以便获得环状双链DNA分子；以环状双链DNA分子变性的环状单链DNA分子为模板，进行滚环扩增，以便获得RCA扩增产物；RCA扩增产物与测序接头连接，以便获得所述测序文库。还提供了测序方法、试剂盒、制备环状双链DNA分子的方法以及同源重组在RCA扩增中的应用。
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公开(公告)号：CN111073960B
公开(公告)日：2024-01-12
申请号：CN201811231237.5
申请日：2018-10-22
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12M1/34
摘要： 本申请公开了一种测序仪激光扩束器的调试方法及装置，调试方法，检测激光扩束器发射激光的同一个焦面上若干位置的激光光强值；根据若干个位置的激光光强值计算出扩束器的偏离系数，并计算出调节角度值；根据计算出的调节角度值调节激光扩束器上的调节旋钮，进行对焦调试。由于检测发射激光在同一焦面上的不同位置的光强大小，再通过进行计算分析得到激光光强的均一性，并且计算出调节的角度值，调试人员可根据计算出的调节角度值对测序仪激光扩束器进行对焦调节，实现测序仪激光扩束器的均一性调试，本调试方法及装置借助设备完成，调试的精度高和效率高。
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公开(公告)号：CN113667714A
公开(公告)日：2021-11-19
申请号：CN202010414217.2
申请日：2020-05-15
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本申请公开了一种目标区域捕获方法、试剂盒及测序方法。本申请的目标区域捕获方法，包括根据目标区域核酸序列设计向导核酸序列，将向导核酸序列与CAS9酶组合，采用向导核酸序列与CAS9酶的复合物对待处理核酸样品进行酶切消化，根据片段大小回收获得目标区域。本申请的目标区域捕获方法，流程短、操作简单，节省了交付周期和人力成本；并且，捕获效率高，增加了有效数据利用率，节约测序成本。本申请利用CRISPR/Cas9系统进行目标区域捕获，整个捕获过程无需采用PCR扩增，能够保留目标区域基因的甲基化等原始修饰信息。
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公开(公告)号：CN108913376B
公开(公告)日：2020-11-24
申请号：CN201810542121.7
申请日：2018-05-30
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
摘要： 本申请公开了一种用于测序芯片清洗的试剂及其制备方法和应用。本申请用于测序芯片清洗的试剂，包含柠檬醇、皂角提取液、氢氧化钾、EDTA、环氧大豆油、聚醚改性硅油、乙醇和纯水。本申请的测序芯片清洗试剂，针对测序芯片的油污等污染源设计其组分，并采用多种植物提取物作为活性去污剂，试剂中各组分相配合能有效的对测序芯片进行清洗，去除其表面油污等杂质，清洗后不留斑，不起雾，清洗效果好。并且，本申请的试剂，不含氯化物和低芳香烃，主要活性成份为植物提取物，环保、安全、稳定，不含任何卤素成份，因此不会破坏臭氧层；为测序芯片提供了一种专用的清洗试剂。
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公开(公告)号：CN110827920A
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201810921895.0
申请日：2018-08-14
申请人： 武汉华大医学检验所有限公司
IPC分类号： G16B30/00 , C12Q1/6869
摘要： 本发明涉及基因测序领域，具体涉及一种测序数据分析方法和设备及一种高通量测序方法。所述测序数据包括疑似污染测序读段，所述疑似污染测序读段含有接头匹配区，所述方法包括：基于所述疑似污染测序读段的序列，确定分析窗口序列，所述分析窗口序列包括：接头匹配区以及接头毗邻区；基于所述疑似污染测序读段的对应测序读段的序列，确定接头毗邻区对应序列；基于所述接头毗邻区对应序列与所述接头毗邻区的匹配水平，确定所述疑似污染测序读段是否被接头污染。利用本发明的方法和装置，可以有效且全面去除接头污染的测序读段，保证接头污染过滤后数据的碱基平衡性，而且能够提高数据的准确度。
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