一种基于BFGS算法的计算机药物筛选方法

    公开(公告)号:CN110459263A

    公开(公告)日:2019-11-15

    申请号:CN201910569102.8

    申请日:2019-06-27

    IPC分类号: G16B15/30

    摘要: 本发明公开了一种基于BFGS算法的计算机药物筛选方法。本发明包括以下步骤:1)建立数据库,由30000-40000个海洋小分子的数据集群,循环遍历匹配,形成相似度为0-1的小分子库;2)数据库预处理,删除步骤1)中所得的小分子库中相似度为1的小分子构象;3)分子对接,将配体置于受体的活性位置点处,使多个配体与一个受体进行分子对接;4)构象搜索,使用BFGS算法进行构象搜索,当新生成的构象与初始构象相同或者两者预设差值不超过0.0001时,停止构象的搜索。本发明通过优化算法使其缩短寻找配体与受体结合在受体活性位点处的低能构象的时间,增加了小分子数据库的基于该方法的虚拟筛选的效果和效率。