与烟草主流烟气中焦油释放量基因qTAR紧密连锁的共显性SSR标记及应用

    公开(公告)号:CN118460772A

    公开(公告)日:2024-08-09

    申请号:CN202410633229.2

    申请日:2024-05-21

    IPC分类号: C12Q1/6895 C12N15/11

    摘要: 本发明提供了与烟草主流烟气中焦油释放量基因qTAR紧密连锁的共显性SSR标记及应用方法。所述的与烟草主流烟气中焦油释放量基因qTAR紧密连锁的共显性SSR标记的编号为TMy81049和TMy85286,其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。所述的应用为所述的与焦油释放量基因qTAR紧密连锁的共显性SSR标记在检测烟草基因组DNA中是否存在焦油释放量基因qTAR中的应用。与现有技术方法相比,本发明所述的共显性SSR标记具有精准、高效、稳定、便捷、低成本且无检测时机限制的特点,因此该分子标记可以作为低危害烟草育种中焦油释放量基因qTAR分子标记辅助选择的应用。

    一种烟草钙依赖蛋白激酶基因的应用

    公开(公告)号:CN118207240A

    公开(公告)日:2024-06-18

    申请号:CN202410341721.2

    申请日:2024-03-25

    摘要: 本发明属于遗传工程技术领域,具体涉及一种烟草钙依赖蛋白激酶基因的应用。所述烟草钙依赖蛋白激酶基因用于调控烟草烟碱含量的转基因烟草植株中;所述烟草钙依赖蛋白激酶基因包括烟草钙依赖蛋白激酶基因NtCDPK9‑1和烟草钙依赖蛋白激酶基因NtCDPK9‑2,所述NtCDPK9‑1的核苷酸序列如SEQ ID:NO.1所示,所述NtCDPK9‑2的核苷酸序列如SEQ ID:NO.2所示;利用CRISPR/CAS9编辑技术对烟草钙依赖蛋白激酶基因NtCDPK9‑1和NtCDPK9‑2进行功能验证,结果表明烟草钙依赖蛋白激酶基因NtCDPK9‑1和NtCDPK9‑2具有调控烟碱在烟叶中累积的功能,为调控烟草烟碱含量提供了靶标基因,解决目前通过调控钙依赖蛋白激酶基因的表达来调控烟叶中烟碱含量未见报道的问题。

    一种异源四倍体烟草染色体级别基因组组装的方法

    公开(公告)号:CN117352060A

    公开(公告)日:2024-01-05

    申请号:CN202311530873.9

    申请日:2023-11-16

    IPC分类号: G16B30/20 G16B30/10

    摘要: 本发明公开了一种异源四倍体烟草染色体级别基因组组装的方法,所述的方法包括以下步骤:步骤1)选择Falcon、Verkko和HiFiasm三种软件对烟草基因组进行Contig初始组装,并选择最优结果作为初步组装结果Contig_asm;步骤2)利用Pilon、Racon和Merfin软件,结合二代、三代测序数据对初步组装结果Contig_asm进行打磨、矫正;步骤3)利用3D‑DNA和ALLHiC软件并结合HiC测序数据对打磨、矫正后的初步组装结果Contig_asm进行染色体挂载;步骤4)获得异源四倍体烟草的基因组数据。本发明所述的基因组组装方法具有科学、精准和异源四倍体烟草特异性的特点,因此该方法既填补了目前针对异源四倍体烟草基因组组装方法空白,也可在具有高重复、高复杂度的烟草属内所有烟草种类染色体级别基因组组装中的应用。