人源LRRK2蛋白小分子抑制剂及其应用

    公开(公告)号:CN112843067B

    公开(公告)日:2023-01-06

    申请号:CN201911175850.4

    申请日:2019-11-26

    申请人: 兰州大学

    摘要: 本发明提供了一种以人源LRRK2蛋白为靶点的小分子抑制剂及其应用,属于制药技术领域。本发明将LRRK2的激酶结构域作为靶点,利用同源模建的方法构建了LRRK2激酶结构域的三维结构,选取其Ⅰ型抑制剂结合口袋,利用Glide程序进行分子对接,从160多万个化合物中虚拟筛选得到靶向人源LRRK2蛋白的小分子抑制剂LY2019‑005,并进行激酶活性抑制实验,验证了化合物LY2019‑005对LRRK2激酶活性的抑制作用,并进行了分子动力学模拟研究,在分子水平上阐明了化合物LY2019‑005与靶蛋白的作用机制。所发现的小分子及其药用盐可以为治疗LRRK2有关的疾病,例如帕金森病、阿尔兹海默病、炎症性肠病或麻疯病的新药研发提供基础。本发明的先导化合物可进行进一步的结构优化,具有较好的应用前景。

    人源LRRK2蛋白小分子抑制剂及其应用

    公开(公告)号:CN113773258B

    公开(公告)日:2023-08-25

    申请号:CN202010515395.4

    申请日:2020-06-09

    申请人: 兰州大学

    摘要: 本发明提供了一种以人源LRRK2蛋白为靶点的小分子抑制剂及其应用,属于制药技术领域。本发明将LRRK2的激酶结构域作为靶点,利用同源模建的方法构建了LRRK2激酶结构域的三维结构,选取其Ⅰ型抑制剂结合口袋,利用Glide程序进行分子对接,从160多万个化合物中虚拟筛选得到靶向人源LRRK2蛋白的小分子抑制剂LY2019‑006,并进行激酶活性抑制实验,验证了化合物LY2019‑006对LRRK2激酶活性的抑制作用,并进行了分子动力学模拟研究,在分子水平上阐明了化合物LY2019‑006与靶蛋白的作用机制。所发现的小分子及其药用盐可以为治疗LRRK2有关的疾病,例如帕金森病、阿尔兹海默病、炎症性肠病或麻疯病的新药研发提供基础。本发明的先导化合物可进行进一步的结构优化,具有较好的应用前景。

    M2型丙酮酸激酶小分子激活剂及其应用

    公开(公告)号:CN112156095A

    公开(公告)日:2021-01-01

    申请号:CN202011166333.3

    申请日:2020-10-27

    申请人: 兰州大学

    摘要: 本发明提供了一种以人源M2型丙酮酸激酶(M2 type pyruvate kinase,PKM2)为靶点的小分子激活剂及其应用,属于制药技术领域。本发明以PKM2为靶点,利用基于对接的虚拟筛选和体外生物活性评价相结合进行小分子激活剂的筛选。体外活性测试结果表明,筛选的化合物中有两个具有较好的PKM2激活活性,并且具有较好的癌细胞抑制活性,所发现的小分子可以为治疗PKM2有关的疾病,例如宫颈癌、乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、肝癌、肺癌、胰腺癌、结肠直肠癌、血癌、黑色素瘤以及多发性骨髓瘤的新药研发提供基础。本发明的先导化合物可进一步的结构优化,具有较好的应用前景。

    一种检测溶液中MMP9蛋白的方法

    公开(公告)号:CN103940784B

    公开(公告)日:2016-07-06

    申请号:CN201410180514.X

    申请日:2014-04-30

    申请人: 兰州大学

    IPC分类号: G01N21/552

    摘要: 本发明涉及一种检测溶液中MMP9蛋白的方法,该方法包括以下步骤:⑴设计MMP9特异性小分子配体;⑵小分子配体的化学合成:①制备KF-CaF2熔融物:②制备对甲基苯磺酰氟;③采用催化剂LDA进行反应得化合物Ⅰ;④HCL气体脱去反应物上Boc基团,得化合物Ⅱ;⑤采用催化剂三乙胺进行反应得化合物Ⅲ;⑥化合物Ⅱ与化合物Ⅲ反应得化合物Ⅳ;⑦化合物Ⅳ与NaOH溶液进行反应得化合物Ⅴ;⑧采用催化剂为O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟基胺、NMM、HOBT和EDC进行反应得化合物Ⅵ;⑨化合物Ⅵ脱去保护基团得MMP9小分子配体;⑶SPR法检测溶液中的MMP9:ⅰ裸金膜芯片的修饰;ⅱ小分子配体的固定;ⅲ非特异性小分子吸附的排除;ⅳ检测溶液中的MMP9蛋白;ⅴMMP9非特异性蛋白吸附的排除。本发明方法灵敏度高。

    一种基于人工智能进行靶向受体的3D药物设计方法

    公开(公告)号:CN110706756B

    公开(公告)日:2023-06-27

    申请号:CN201910825654.0

    申请日:2019-09-03

    申请人: 兰州大学

    发明人: 白启峰 姚小军

    摘要: 本发明涉及一种基于人工智能进行靶向受体的3D药物设计方法,主要针对目前人工智能训练的模型只能生长成1D或2D的药物分子片段和不能直接靶向受体3D活性口袋的问题,通过利用MMFF94力场转化1D或2D药物片段分子,在受体的3D活性口袋中随机指定或特别指定起始片段作为药物分子的生长起始点,并以药物分子的可旋转键作为分割点,通过遗传算法针对受体靶点的3D活性口袋进行3D药物设计,进而解决人工智能训练的药物模型不能直接应用于受体靶点活性口袋进行3D药物分子设计的问题。

    人源LRRK2蛋白小分子抑制剂及其应用

    公开(公告)号:CN113773258A

    公开(公告)日:2021-12-10

    申请号:CN202010515395.4

    申请日:2020-06-09

    申请人: 兰州大学

    摘要: 本发明提供了一种以人源LRRK2蛋白为靶点的小分子抑制剂及其应用,属于制药技术领域。本发明将LRRK2的激酶结构域作为靶点,利用同源模建的方法构建了LRRK2激酶结构域的三维结构,选取其Ⅰ型抑制剂结合口袋,利用Glide程序进行分子对接,从160多万个化合物中虚拟筛选得到靶向人源LRRK2蛋白的小分子抑制剂LY2019‑006,并进行激酶活性抑制实验,验证了化合物LY2019‑006对LRRK2激酶活性的抑制作用,并进行了分子动力学模拟研究,在分子水平上阐明了化合物LY2019‑006与靶蛋白的作用机制。所发现的小分子及其药用盐可以为治疗LRRK2有关的疾病,例如帕金森病、阿尔兹海默病、炎症性肠病或麻疯病的新药研发提供基础。本发明的先导化合物可进行进一步的结构优化,具有较好的应用前景。

    人源LRRK2蛋白小分子抑制剂及其应用

    公开(公告)号:CN112843067A

    公开(公告)日:2021-05-28

    申请号:CN201911175850.4

    申请日:2019-11-26

    申请人: 兰州大学

    摘要: 本发明提供了一种以人源LRRK2蛋白为靶点的小分子抑制剂及其应用,属于制药技术领域。本发明将LRRK2的激酶结构域作为靶点,利用同源模建的方法构建了LRRK2激酶结构域的三维结构,选取其Ⅰ型抑制剂结合口袋,利用Glide程序进行分子对接,从160多万个化合物中虚拟筛选得到靶向人源LRRK2蛋白的小分子抑制剂LY2019‑005,并进行激酶活性抑制实验,验证了化合物LY2019‑005对LRRK2激酶活性的抑制作用,并进行了分子动力学模拟研究,在分子水平上阐明了化合物LY2019‑005与靶蛋白的作用机制。所发现的小分子及其药用盐可以为治疗LRRK2有关的疾病,例如帕金森病、阿尔兹海默病、炎症性肠病或麻疯病的新药研发提供基础。本发明的先导化合物可进行进一步的结构优化,具有较好的应用前景。