一种奶牛全基因组中高密度SNP芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117431324A

    公开(公告)日:2024-01-23

    申请号:CN202311218327.1

    申请日:2023-09-20

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12Q1/6874

    摘要: 本发明提供一种中高密度奶牛全基因组126K SNP芯片,其包含检测120,155个SNP位点的试剂,所述SNP位点来自:第一类,发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点,包含5,363个SNP位点;第二类,奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点,包含223个SNP个位点;第三类,基于我国的大规模奶牛群体,根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布,从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点,包含114,569个SNP位点。本发明的芯片,可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

    一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒

    公开(公告)号:CN108913788B

    公开(公告)日:2021-08-10

    申请号:CN201810884102.2

    申请日:2018-08-06

    摘要: 本发明公开了一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒。本发明提供了引物组甲,由序列1至20所示的20种引物组成。本发明还提供了引物组乙,由扩增引物组和延伸引物组组成;扩增引物组为引物组甲;延伸引物组由序列21至30所示的10种引物组成。本发明还保护引物组甲或引物组乙在制备试剂盒中的应用;试剂盒的功能为鉴定待测牛是否为多种牛遗传缺陷的携带者。本发明建立了一种高通量、快速的检测牛主要遗传缺陷的分型方法,为牛遗传缺陷的分子筛查提供一种新方法,提高了检测效率,有助于成果的转化应用,为在今后的育种工作中有计划地降低遗传缺陷基因频率提供了技术支撑,为奶牛场进行科学的选种选配提供了依据。

    基于高效液相色谱对β乳球蛋白进行分型的方法

    公开(公告)号:CN109613139A

    公开(公告)日:2019-04-12

    申请号:CN201910004121.6

    申请日:2019-01-03

    IPC分类号: G01N30/02

    摘要: 本发明涉及一种基于高效液相色谱对β乳球蛋白进行分型的方法,包括如下步骤:步骤S1:利用冷冻奶样制备分型样品;步骤S2:向高效液相色谱柱进样;步骤S3:分别在不同时间点以不同体积的洗脱液洗脱样品;步骤S4:根据分型样品洗脱后出峰的保留时间和峰面积参数将β-乳球蛋白分型为A-β乳球蛋白和B-β乳球蛋白。本发明提供的基于高效液相色谱对β乳球蛋白进行分型的方法,重现性好,准确度高,能够实现对样品的批量检测,大大减少分析时间,而且方法简单易行,方便可靠。

    基于KASP技术检测β-乳球蛋白基因型的方法

    公开(公告)号:CN109402265A

    公开(公告)日:2019-03-01

    申请号:CN201811182098.1

    申请日:2018-10-10

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12Q1/686

    摘要: 本发明涉及一种基于KASP技术检测β-乳球蛋白基因型的方法,包括如下步骤:制备DNA样品;制备好PCR扩增体系;进行PCR扩增;PCR扩增体系中的混合引物包括三种KASP引物:上游未突变基因引物、上游突变基因引物以及下游引物,并且,上游未突变基因引物及上游突变基因引物中分别设计有HEX荧光标签序列及FAM突变荧光标签序列;根据PCR扩增后DNA样品的荧光强度,进行基因分型。本发明实现了对奶牛中BLG基因两种常见变异体的全面筛选,可充分利用基因检测等领域的资源与技术优势培育优质种牛,发掘奶牛特色种质资源,为牧场选择合适的奶牛,提高产奶性状,从种源解决相关领域的技术瓶颈,对奶牛良种产业健康发展具有重要意义。

    一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒

    公开(公告)号:CN108913788A

    公开(公告)日:2018-11-30

    申请号:CN201810884102.2

    申请日:2018-08-06

    摘要: 本发明公开了一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒。本发明提供了引物组甲,由序列1至20所示的20种引物组成。本发明还提供了引物组乙,由扩增引物组和延伸引物组组成;扩增引物组为引物组甲;延伸引物组由序列21至30所示的10种引物组成。本发明还保护引物组甲或引物组乙在制备试剂盒中的应用;试剂盒的功能为鉴定待测牛是否为多种牛遗传缺陷的携带者。本发明建立了一种高通量、快速的检测牛主要遗传缺陷的分型方法,为牛遗传缺陷的分子筛查提供一种新方法,提高了检测效率,有助于成果的转化应用,为在今后的育种工作中有计划地降低遗传缺陷基因频率提供了技术支撑,为奶牛场进行科学的选种选配提供了依据。

    基于KASP技术检测κ-酪蛋白基因型的方法

    公开(公告)号:CN109321639A

    公开(公告)日:2019-02-12

    申请号:CN201811181116.4

    申请日:2018-10-10

    IPC分类号: C12Q1/6858

    摘要: 本发明涉及一种基于KASP技术检测κ-酪蛋白基因型的方法,包括如下步骤:制备DNA样品;制备好PCR扩增体系;进行PCR扩增;PCR扩增体系中的混合引物包括三种KASP引物:上游突变基因引物、上游未突变基因引物以及下游引物,并且,上游突变基因引物及上游未突变基因引物中,一条设计有HEX荧光标签序列,另一条设计有FAM荧光标签序列;根据PCR扩增后DNA样品的荧光强度,进行基因分型。本发明实现了对奶牛中CSN3三种常见变异体的全面筛选,可充分利用基因检测等领域的资源与技术优势培育优质种牛,发掘奶牛特色种质资源,为牧场选择合适的奶牛,提高乳蛋白率,从种源解决相关领域的技术瓶颈,对奶牛良种产业健康发展具有重要意义。

    母牛群体HH型遗传缺陷基因的检测方法及其用途

    公开(公告)号:CN109055566A

    公开(公告)日:2018-12-21

    申请号:CN201810762088.9

    申请日:2018-07-11

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种母牛群体HH型遗传缺陷基因的检测方法,包括如下步骤:S1:获取待检测母牛群体的血液样品,采用DNA提取试剂盒,从血液样品中提取DNA样本;S2:采用设计好的KASP引物,对DNA样本进行PCR扩增;其中,KASP引物包括三条,分别为上游正常基因引物、上游突变基因引物以及下游引物,并且,上游正常基因引物及上游突变基因引物中,其5,端分别设计有HEX荧光标签序列及FAM荧光标签序列;S3:根据扩增后的DNA样品的荧光强度,判断对应的母牛群体中的HH型基因的基因型。本发明首次建立了采用KASP分型方法检测影响奶牛繁殖力的遗传缺陷基因,该方法快速、高效、经济,可对样本进行高通量的检测。