一种奶牛全基因组中高密度SNP芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117431324A

    公开(公告)日:2024-01-23

    申请号:CN202311218327.1

    申请日:2023-09-20

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12Q1/6874

    摘要: 本发明提供一种中高密度奶牛全基因组126K SNP芯片,其包含检测120,155个SNP位点的试剂,所述SNP位点来自:第一类,发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点,包含5,363个SNP位点;第二类,奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点,包含223个SNP个位点;第三类,基于我国的大规模奶牛群体,根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布,从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点,包含114,569个SNP位点。本发明的芯片,可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

    一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒

    公开(公告)号:CN108913788B

    公开(公告)日:2021-08-10

    申请号:CN201810884102.2

    申请日:2018-08-06

    摘要: 本发明公开了一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒。本发明提供了引物组甲,由序列1至20所示的20种引物组成。本发明还提供了引物组乙,由扩增引物组和延伸引物组组成;扩增引物组为引物组甲;延伸引物组由序列21至30所示的10种引物组成。本发明还保护引物组甲或引物组乙在制备试剂盒中的应用;试剂盒的功能为鉴定待测牛是否为多种牛遗传缺陷的携带者。本发明建立了一种高通量、快速的检测牛主要遗传缺陷的分型方法,为牛遗传缺陷的分子筛查提供一种新方法,提高了检测效率,有助于成果的转化应用,为在今后的育种工作中有计划地降低遗传缺陷基因频率提供了技术支撑,为奶牛场进行科学的选种选配提供了依据。

    一种筛选CD18基因正常的优良种牛的方法及其专用引物

    公开(公告)号:CN1970793A

    公开(公告)日:2007-05-30

    申请号:CN200610144259.9

    申请日:2006-11-30

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11 C12P19/34

    摘要: 本发明公开了一种筛选CD18基因正常的优良种牛的方法及其专用引物。该引物是由序列表中序列1和序列2的核苷酸序列组成的引物对。该方法是以待测牛的基因组DNA为模板,在由序列表中序列1和序列2的核苷酸序列组成的引物对的引导下进行PCR扩增,检测扩增片段自5’端第32位碱基为A、G还是N,扩增片段自5’端第32位碱基为A的种牛为CD18基因正常的优良种牛;所述N为A和G的杂合体。本发明的筛选方法操作简单,快捷,费用低廉,准确度高(可达99%),并可实现自动化的直接检测。此外,可根据本发明的方法开发出相应的检测试剂盒,用于筛选携带有利等位基因(AA)的个体,为种牛的育种工作提供便利。

    一种牛场牛群肢蹄护理信息处理方法

    公开(公告)号:CN113609205A

    公开(公告)日:2021-11-05

    申请号:CN202110803075.3

    申请日:2021-07-15

    IPC分类号: G06F16/26 G06F16/22 G06Q50/02

    摘要: 本发明公开了一种牛场牛群肢蹄护理信息处理方法,包括通过系统采集数据,修蹄负责人在系统移动端中获取到任务数据,进行修蹄作业、盘点使用药品信息,汇总作业和药品数据情况;采集到作业数据和药品使用数据后,将数据实时录入传输至云端的数据库;在数据库中通过大数据分析技术对数据进行汇总分析和挖掘数据潜在价值;将分析和挖掘的信息生成每日业务报告和总体业务报告。本发明通过即时将牛肢蹄护理数据输入系统,实现数据采集功能和对个体牛只的全生命周期肢蹄保健情况跟踪,以及对已服务牧场的历史各次修蹄数据的管理,为牧场提供个性化的牛群肢蹄保健方案和服务报告;通过本发明实现使用者对修蹄业务信息的全面数字化和智能化管理。

    一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒

    公开(公告)号:CN108913788A

    公开(公告)日:2018-11-30

    申请号:CN201810884102.2

    申请日:2018-08-06

    摘要: 本发明公开了一种高通量检测牛常见遗传缺陷的引物组及试剂盒。本发明提供了引物组甲,由序列1至20所示的20种引物组成。本发明还提供了引物组乙,由扩增引物组和延伸引物组组成;扩增引物组为引物组甲;延伸引物组由序列21至30所示的10种引物组成。本发明还保护引物组甲或引物组乙在制备试剂盒中的应用;试剂盒的功能为鉴定待测牛是否为多种牛遗传缺陷的携带者。本发明建立了一种高通量、快速的检测牛主要遗传缺陷的分型方法,为牛遗传缺陷的分子筛查提供一种新方法,提高了检测效率,有助于成果的转化应用,为在今后的育种工作中有计划地降低遗传缺陷基因频率提供了技术支撑,为奶牛场进行科学的选种选配提供了依据。

    一种检测牛HH5单倍型的专用试剂盒及其检测方法

    公开(公告)号:CN106319088A

    公开(公告)日:2017-01-11

    申请号:CN201611029923.5

    申请日:2016-11-15

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    CPC分类号: C12Q1/6858 C12Q2531/113

    摘要: 本发明公开了一种检测牛HH5单倍型的专用试剂盒及其检测方法。本发明的试剂盒由引物1、引物2和引物3组成;所述引物1为序列1所示的单链DNA分子;所述引物2为序列2所示的单链DNA分子;所述引物3为序列3所示的单链DNA分子。通过实验证明:本发明建立的检测奶牛是否携带HH5单倍型的方法快速、准确,为奶牛HH5单倍型的分子筛查提供一种方法和思路,为在今后的育种工作中有计划地降低HH5单倍型频率提供了技术支撑,为奶牛场进行科学的选种选配提供了依据。

    母牛群体HH型遗传缺陷基因的检测方法及其用途

    公开(公告)号:CN109055566A

    公开(公告)日:2018-12-21

    申请号:CN201810762088.9

    申请日:2018-07-11

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种母牛群体HH型遗传缺陷基因的检测方法,包括如下步骤:S1:获取待检测母牛群体的血液样品,采用DNA提取试剂盒,从血液样品中提取DNA样本;S2:采用设计好的KASP引物,对DNA样本进行PCR扩增;其中,KASP引物包括三条,分别为上游正常基因引物、上游突变基因引物以及下游引物,并且,上游正常基因引物及上游突变基因引物中,其5,端分别设计有HEX荧光标签序列及FAM荧光标签序列;S3:根据扩增后的DNA样品的荧光强度,判断对应的母牛群体中的HH型基因的基因型。本发明首次建立了采用KASP分型方法检测影响奶牛繁殖力的遗传缺陷基因,该方法快速、高效、经济,可对样本进行高通量的检测。