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公开(公告)号:CN110490450A
公开(公告)日:2019-11-22
申请号:CN201910753688.3
申请日:2019-08-15
摘要: 公开了一种基于混合云的生物信息管理系统。该基于混合云的生物信息管理系统包括:基础设施层,包括经由物理链路联通的至少一个本地互联网数据中心和公有云;平台层,包括调度服务平台和容器服务平台;以及,软件层,用于将下层的数据和应用通过生物信息管理服务经由统一接口提供给用户,并接收用户提交的数据。这样,通过混合云向用户提供包括数据和应用的生物信息管理服务,并与用户进行数据交互,可以实现高性能的生物信息管理系统。
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公开(公告)号:CN110607352A
公开(公告)日:2019-12-24
申请号:CN201910740285.5
申请日:2019-08-12
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
摘要: 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中,该构建DNA文库的方法包括:提供嵌合标记物的DNA,其中,所述嵌合标记物的DNA具有三维结构信息;将所述嵌合标记物的DNA进行转座处理,以便得到转座产物;对所述转座产物进行捕获处理,以便得到捕获后的DNA;以及将所述捕获后的DNA进行扩增处理,以便获得所述DNA文库。该建库方法步骤简单,耗时短,尤其适用于痕量DNA样本的文库构建,并且测序的有效数据比例高,噪音单末端悬挂值低。
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公开(公告)号:CN111383713B
公开(公告)日:2023-08-01
申请号:CN201811642911.9
申请日:2018-12-29
申请人: 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/00 , G16B50/30 , G16H50/20 , G16H70/40 , C12Q1/6886
摘要: 本发明涉及一种ctDNA检测分析装置,其包括:数据处理模块、体细胞变异获取模块、体细胞变异筛选模块。
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公开(公告)号:CN111383713A
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201811642911.9
申请日:2018-12-29
申请人: 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/00 , G16B50/30 , G16H50/20 , G16H70/40 , C12Q1/6886
摘要: 本发明涉及一种ctDNA检测分析装置,其包括:数据处理模块、体细胞变异获取模块、体细胞变异筛选模块。
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公开(公告)号:CN110659252A
公开(公告)日:2020-01-07
申请号:CN201910739964.0
申请日:2019-08-12
摘要: 公开了一种基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备。该基于云的生物信息数据交付方法包括:获取生物信息数据;将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据;以及,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台,所述云平台上存储的所述生物信息数据用于通过响应于用户的请求由用户访问和/或下载而交付给用户。这样,提高了数据交付的便利度和安全性,并降低了数据交付的成本。
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公开(公告)号:CN211578386U
公开(公告)日:2020-09-25
申请号:CN201921468717.3
申请日:2019-09-05
摘要: 本实用新型涉及一种宏基因组分析装置,其包括:测序组件,用于获取两组以上核酸样本的核酸序列;数据库比对组件,其设置在测序组件的下游,用于将所述核酸序列与参照数据库进行比对进而得到比对后的核酸序列;综合分析组件,其设置在数据库比对组件的下游,用于分析比对后的核酸序列和收集组间差异信息;以及分析结果输出组件,其设置在综合分析组件的下游,用于输出所述差异信息。
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公开(公告)号:CN210913441U
公开(公告)日:2020-07-03
申请号:CN201921302626.2
申请日:2019-08-12
摘要: 本实用新型公开了一种样本存储盒。该样本存储盒包括:样本管,所述样本管内设置有样本容纳空间;载板,所述载板包括:板体,所述板体上设置有通孔,所述通孔的内径与所述样本管的外径相匹配;盖体,所述盖体罩设在所述板体上,且与所述板体相匹配;箱体,所述箱体内设置有载板存储空间。样本放置于样本管中,样本管放置在载板的通孔内,由盖体盖上防止样本管掉出,装有样本管的载板放置在箱体中存储。由此,样本管根据需要规则放置于载板中,而载板进一步规则放置在箱体中,样本存储空间利用率高,便于大量生物样本的管理,尤其适用于基因测序样本的存储。
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公开(公告)号:CN210945557U
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201921721608.8
申请日:2019-10-15
申请人: 安诺优达生命科学研究院 , 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达(义乌)医学检验有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 北京市十一学校
摘要: 本实用新型公开了磁力架。该磁力架包括:板体,所述板体的一侧分布多个呈阵列分布的反应孔,所述板体被划分有第一分布区和第二分布区,一部分所述反应孔位于所述第一分布区且另一部分反应孔位于所述第二分布区;以及磁棒,所述磁棒设置在所述板体上,且分布在所述第一分布区。该磁力架通过在第一分布区内设置磁棒,使磁力架一部分区域具有磁性,另一部分区域不具有磁性,从而将装有样本的耗材板放置在本实用新型实施例的磁力架上时,通过旋转耗材板放置在磁力架上的方向,即可通过移液工作站利用该磁力架全自动地实现单独地加热孵育和磁吸孵育加热功能。
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公开(公告)号:CN117095745A
公开(公告)日:2023-11-21
申请号:CN202311069138.2
申请日:2023-08-23
摘要: 本发明涉及一种用于检测孕妇血浆游离DNA中胎儿非整倍体和拷贝数变异的方法和装置及应用。方法包括:基于常规非靶向全基因组测序方式,得到测序数据,以期对测序模版进行分组并产生可分析的子文库;提取测序数据中不同基因组区间的测序深度信息;根据从测序数据中提取的特征向量/矩阵进行分组,并统计和提取来自不同的分组的基因组区间的深度信息;通过机器学习构建分类器,进一步精确区分胎儿携带的变异和母体携带的变异。采用本发明的方法和装置能够精确区分胎儿携带的变异和母体携带的变异,而且本发明的方法和装置兼容性强、适用性广、成本低,只需要超低的测序深度即可实现对胎儿游离DNA基因组的非整倍体和拷贝数变异的精确区分和检测。
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公开(公告)号:CN116855617B
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202311109723.0
申请日:2023-08-31
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
摘要: 本发明公开了一种基于核心家系的串联重复变异分型检测方法及其应用。方法包括:基于父本的测序数据集和母本的测序数据集,对子代的测序数据集进行第一分型和组装;以得到的子代单倍型基因组为参考,分别对父本和母本基因组进行单核苷酸位点变异检测,并对父本的测序数据集和母本的测序数据集分别进行第二分型,得到两套父本单倍型基因组、两套母本单倍型基因组,并明确由父本遗传到子代的单倍型基因组、以及由母本遗传到子代的单倍型基因组;对单倍型基因组分别进行串联重复变异检测。本发明提供一种基于三代长读长测序技术,高准确度、全基因组覆盖的串联重复区域变异检测方法;而且本发明方法能得到遗传过程中串联重复发生变异的单倍型信息。
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