-
公开(公告)号:CN111383713B
公开(公告)日:2023-08-01
申请号:CN201811642911.9
申请日:2018-12-29
Applicant: 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC: G16B30/00 , G16B50/30 , G16H50/20 , G16H70/40 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种ctDNA检测分析装置,其包括:数据处理模块、体细胞变异获取模块、体细胞变异筛选模块。
-
公开(公告)号:CN111383713A
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201811642911.9
申请日:2018-12-29
Applicant: 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC: G16B30/00 , G16B50/30 , G16H50/20 , G16H70/40 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种ctDNA检测分析装置,其包括:数据处理模块、体细胞变异获取模块、体细胞变异筛选模块。
-
公开(公告)号:CN110659252A
公开(公告)日:2020-01-07
申请号:CN201910739964.0
申请日:2019-08-12
Applicant: 安诺优达生命科学研究院 , 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达(义乌)医学检验有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
Abstract: 公开了一种基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备。该基于云的生物信息数据交付方法包括:获取生物信息数据;将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据;以及,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台,所述云平台上存储的所述生物信息数据用于通过响应于用户的请求由用户访问和/或下载而交付给用户。这样,提高了数据交付的便利度和安全性,并降低了数据交付的成本。
-
公开(公告)号:CN211578386U
公开(公告)日:2020-09-25
申请号:CN201921468717.3
申请日:2019-09-05
Applicant: 安诺优达(义乌)医学检验有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
Abstract: 本实用新型涉及一种宏基因组分析装置,其包括:测序组件,用于获取两组以上核酸样本的核酸序列;数据库比对组件,其设置在测序组件的下游,用于将所述核酸序列与参照数据库进行比对进而得到比对后的核酸序列;综合分析组件,其设置在数据库比对组件的下游,用于分析比对后的核酸序列和收集组间差异信息;以及分析结果输出组件,其设置在综合分析组件的下游,用于输出所述差异信息。
-
公开(公告)号:CN116855617B
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202311109723.0
申请日:2023-08-31
Applicant: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于核心家系的串联重复变异分型检测方法及其应用。方法包括:基于父本的测序数据集和母本的测序数据集,对子代的测序数据集进行第一分型和组装;以得到的子代单倍型基因组为参考,分别对父本和母本基因组进行单核苷酸位点变异检测,并对父本的测序数据集和母本的测序数据集分别进行第二分型,得到两套父本单倍型基因组、两套母本单倍型基因组,并明确由父本遗传到子代的单倍型基因组、以及由母本遗传到子代的单倍型基因组;对单倍型基因组分别进行串联重复变异检测。本发明提供一种基于三代长读长测序技术,高准确度、全基因组覆盖的串联重复区域变异检测方法;而且本发明方法能得到遗传过程中串联重复发生变异的单倍型信息。
-
公开(公告)号:CN117275587A
公开(公告)日:2023-12-22
申请号:CN202311094603.8
申请日:2023-08-29
Applicant: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 浙江安诺优达生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种用于多组学联合分析展示的方法和装置及其应用。该方法包括如下步骤:步骤1、获取原始下机数据;步骤2、将所述原始下机数据的Hi‑C部分进行第一数据整理;将所述原始下机数据的Hi‑C以外部分进行第二数据处理;其中,所述第一数据处理的步骤包括:步骤3.1、在服务器上,采用Hic‑Pro进行基因比对,并对比到到酶切片段,生成vaildpairs数据;步骤3.2、在服务器上,采用juicer pre将所述vaildpairs数据生成.hic文件;步骤3.3、在服务器上,用juicer dump读取.hic文件;步骤3.4、在服务器上,用HiCCUPs进行call loop处理。本发明的方法和装置为基于linux服务器运行的工具,运用资源更灵活,支持多样本,大数据量处理和可视化,界面更友好,应用更广泛。
-
公开(公告)号:CN117095742A
公开(公告)日:2023-11-21
申请号:CN202311109741.9
申请日:2023-08-31
Applicant: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 浙江安诺优达生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于核心家系的串联重复变异分型检测装置及其应用。该装置包括子代分型和组装单元、亲本分型单元和单倍型检测单元;其中,所述子代分型和组装单元用于对子代的测序数据集进行第一分型和组装,得到两套子代单倍型基因组;所述亲本分型单元,用于以得到的子代单倍型基因组为参考,分别对父本和母本基因组进行单核苷酸位点变异检测,并对父本的测序数据集和母本的测序数据集分别进行第二分型,并明确由父本遗传到子代的单倍型基因组、由母本遗传到子代的单倍型基因组;所述单倍型检测单元,用于分别对单倍型基因组进行串联重复变异检测。本发明的装置针对串联重复区域变异检测具有高准确度、全基因组覆盖的优点。
-
公开(公告)号:CN116855617A
公开(公告)日:2023-10-10
申请号:CN202311109723.0
申请日:2023-08-31
Applicant: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 浙江安诺优达生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于核心家系的串联重复变异分型检测方法及其应用。方法包括:基于父本的测序数据集和母本的测序数据集,对子代的测序数据集进行第一分型和组装;以得到的子代单倍型基因组为参考,分别对父本和母本基因组进行单核苷酸位点变异检测,并对父本的测序数据集和母本的测序数据集分别进行第二分型,得到两套父本单倍型基因组、两套母本单倍型基因组,并明确由父本遗传到子代的单倍型基因组、以及由母本遗传到子代的单倍型基因组;对单倍型基因组分别进行串联重复变异检测。本发明提供一种基于三代长读长测序技术,高准确度、全基因组覆盖的串联重复区域变异检测方法;而且本发明方法能得到遗传过程中串联重复发生变异的单倍型信息。
-
公开(公告)号:CN112596707B
公开(公告)日:2025-01-28
申请号:CN202011486331.2
申请日:2020-12-16
Applicant: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 北京安诺优达医学检验实验室有限公司
Abstract: 公开了一种基于生物信息分析工具模块的生物信息分析方法,装置和电子设备。该方法包括:接收用户请求;解析用户请求以确定用户请求的类型;响应于用户请求是工具调用请求,确定与用户请求相关联的主类别字段和子类别字段,主类别涉及生物信息分析的分析种类,子类别涉及每一分析种类下的分析模块;基于主类别字段和子类别字段,通过使用生物信息分析工具模块的主类别信息和子类别信息确定要调用的生物信息分析工具模块;以及,使用生物信息分析工具模块的编译器信息调用生物信息分析工具模块。这样,能够有效地统一组织和调用由不同编程语言编写的针对不同方向的生物信息分析工具模块。
-
公开(公告)号:CN116168763A
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202211691347.6
申请日:2022-09-06
Applicant: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
Abstract: 本发明公开了一种同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的方法和装置及其应用。该分型组装的方法包括:步骤1、将样本的测序数据集与近缘二倍体物种的分型后的参考基因组分别进行比对;根据比对结果鉴定基因组变异信息并分型,得到能分型的且与参考基因组相似的测序数据集I、能分型的且与参考基因组不相似的测序数据集II,以及无法分型的测序数据集III;步骤2、提取单碱基深度≥1/2平均深度的测序数据集IV;步骤3、将测序数据集I与测序数据集III组装;将测序数据集II与测序数据集III、测序数据集IV组装。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果,可以应用于高度同源的同源四倍体样本,而且花费较低,取样容易。
-
-
-
-
-
-
-
-
-