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公开(公告)号：CN117210562A
公开(公告)日：2023-12-12
申请号：CN202310683558.3
申请日：2023-06-09
申请人： 四川大学华西医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明涉及体外诊断试剂领域，具体涉及检测SRE‑PTPRZ1结构变异的试剂在制备鳞状细胞癌筛查试剂盒中的用途。本发明首次发现了体细胞简单重复扩增SRE‑PTPRZ1与鳞状细胞癌具有关联，且SRE插入会导致PTPRZ1的高表达。上述发现为鳞状细胞癌的治疗和检测提供了新的靶点和标志物，可用于临床癌症的治疗和辅助诊断，临床应用前景良好。
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公开(公告)号：CN112831460A
公开(公告)日：2021-05-25
申请号：CN202010727575.9
申请日：2020-07-24
申请人： 四川大学华西医院
IPC分类号： C12N5/071
摘要： 本发明公开了一种新的从肺部穿刺组织中制备单细胞悬液的方法，属于细胞分离与培养领域。本发明的方法包括如下步骤：1)将肺部穿刺组织置于冰上剪碎至颗粒状；2)加入终浓度为0.2mg/ml的IV型胶原酶，37±0.3摄氏度下消化10‑15min；3)使用孔径40μm的细胞过滤网过滤，收集滤过液；4)加入红细胞裂解液重悬细胞。本发明的方法相比传统方法，可以有效提高细胞得率，提高细胞活性。
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公开(公告)号：CN117205320A
公开(公告)日：2023-12-12
申请号：CN202310683562.X
申请日：2023-06-09
申请人： 四川大学华西医院
摘要： 本发明涉及体外诊断试剂领域，具体涉及SRE‑PTPRZ1抑制剂在制备治疗鳞状细胞癌的药物中的用途。本发明首次发现了体细胞简单重复扩增SRE‑PTPRZ1与鳞状细胞癌具有关联，且SRE简单重复扩增插入会导致PTPRZ1的高表达。上述发现为鳞状细胞癌的治疗和检测提供了新的靶点和标志物，可用于临床癌症的治疗和辅助诊断，临床应用前景良好。
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公开(公告)号：CN110412269A
公开(公告)日：2019-11-05
申请号：CN201910562537.X
申请日：2019-06-26
申请人： 四川大学华西医院 , 成都华西精准医学产业技术研究院有限公司
IPC分类号： G01N33/574
摘要： 本发明涉及体外诊断试剂领域，具体涉及NDN自身抗体检测试剂在制备肺癌筛查试剂盒中的用途。本发明首次发现肺癌患者血清中NDN蛋白的自身抗体水平显著高于健康患者。本发明将检测NDN蛋白自身抗体的试剂用于制备肺癌筛查试剂盒，能够实现肺癌的有效筛查。
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公开(公告)号：CN118571309A
公开(公告)日：2024-08-30
申请号：CN202410455114.9
申请日：2024-04-16
申请人： 四川大学华西医院 , 脉得智能科技(无锡)有限公司
IPC分类号： G16B15/30 , G16B40/00 , G16B50/30 , G06F18/10 , G06F18/22 , G06F18/25 , G06F18/241 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要： 本发明公开了抗生素耐药基因或毒力因子的基因预测或分类方法、装置、设备，涉及深度学习和生物信息学技术领域。通过提取六种基因相关特征，包括：基于bit分数的相似性特征、序列信息特征,物理化学性质特征，进化信息特征、氨基酸组成特征和结构域信息特征，能够更好地捕捉基因的综合特性，经过特征融合，由此构建的模型能够提高抗生素耐药基因或毒力因子的基因预测准确性。对于抗生素耐药基因或毒力因子的基因筛选、分类和预测具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN111848754A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010798708.1
申请日：2020-08-10
申请人： 四川大学华西医院
IPC分类号： C07K14/165 , C12N15/50 , G01N33/569 , G01N33/543
摘要： 本发明公开了一种新型冠状病毒N蛋白重组抗原及其用途，属于蛋白免疫检测试剂领域。所述重组抗原是一种蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO.1或3所示。将该重组抗原用于制备检测N蛋白抗体的试剂，相比N蛋白全长抗原，能提高试剂的热稳定性和检测的准确性。
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公开(公告)号：CN118380054A
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202410455118.7
申请日：2024-04-16
申请人： 四川大学华西医院 , 脉得智能科技(无锡)有限公司
IPC分类号： G16B40/00 , G16B20/00 , G06F18/10 , G06F18/213 , G06N3/0455 , G06N3/08
摘要： 本发明公开了大队列宏基因组的条件致病菌的识别方法、装置及存储介质，涉及深度学习和生物信息学技术领域。本发明提出的深度学习网络采用分层(或分阶)识别策略，构建从单个物种到多个物种间的条件致病菌识别方法，与现有技术相比，本发明提供的条件致病菌的识别方法能更准确地识别条件致病菌的交互作用。通过分析多个物种间的复杂交互网络结构，来识别条件致病菌之间的相互作用模式，这有助于更全面地揭示微生物在疾病发生和发展中的作用，进而为临床诊断和治疗进行更精细的内因解读，有助于临床诊断和治疗策略的制定。
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公开(公告)号：CN118351938A
公开(公告)日：2024-07-16
申请号：CN202410455116.8
申请日：2024-04-16
申请人： 四川大学华西医院 , 脉得智能科技(无锡)有限公司
IPC分类号： G16B30/10 , G16B40/00 , G06N3/0464 , G06F18/213 , G06F18/22
摘要： 本发明公开了一种基于深度学习的短序列比对方法、设备及存储介质，涉及测序数据分析技术领域。本发明提供的基于深度学习的短序列比对方法，在保证比对准确率的基础上，能够加速索引查找步骤，加速序列比对过程，从而为精准医疗等行业的基因组分析节省宝贵的时间。
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公开(公告)号：CN118197420A
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202410440081.0
申请日：2024-04-12
申请人： 四川大学华西医院 , 脉得智能科技(无锡)有限公司
IPC分类号： G16B30/00 , G16B40/00 , G06N5/022 , G06N3/0455 , G06V10/40 , G06V10/80 , G06V10/764 , G06V10/82 , G06N3/0464 , G06N3/048 , G16B40/20
摘要： 本发明公开了一种基于深度学习的变异识别方法、装置及存储介质，涉及基因组分析技术领域。本发明提供了一种基于先验数据集和基因序列多维度特征图像融合的Transformer变异识别算法，将Transformer和基因序列生成多维度特征图像应用于基因组学变异识别，可以有效提取图像中的底层特征，并建立不同维度图像间的长期依赖，不同维度特征图像的合理融合可以潜在地增强深度分类网络，可以捕获更丰富地基因组学信息。本发明的提出，有助于提升基因组学变异识别的准确性和效率。
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公开(公告)号：CN116555423A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202210112052.2
申请日：2022-01-27
申请人： 四川大学华西医院 , 江苏鹍远生物科技股份有限公司 , 成都华西精准医学产业技术研究院有限公司 , 江苏鹍远生物技术有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11
摘要： 本发明属于生物技术领域，涉及一组生物标志物组合、检测产品及其应用。本发明提供的生物标志物包含SHOX2基因、PTGER4基因、NXPH1基因、HOXD9基因、PCDH8基因和TBR1基因的组合，所述标志物组合可用于肺癌诊断。本发明还公开了基于所述标志物组合设计的检测引物和探针，所述检测引物的序列如SEQ ID NO:1～12所示，所述检测探针的序列如SEQ ID NO:13～18所示。采用本发明所述的生物标志物和检测产品对相关基因甲基化水平的检测更加准确，敏感性和特异性高，具有广泛应用前景。
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