一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法

    公开(公告)号:CN119028431B

    公开(公告)日:2024-12-31

    申请号:CN202411514743.0

    申请日:2024-10-29

    Abstract: 本发明适用于生物信息学领域,具体是一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法,包括:对待检测数据进行第一预处理,生成第一叠加图像,将第一叠加图像作为SNP检测模型的输入,输出得到SNP的VCF文件;对待检测数据进行第二预处理,生成第二叠加图像,将第二叠加图像作为INDEL检测模型的输入,输出得到INDEL的VCF文件;利用基于R语言的VcfR数据处理工具,对所得到的VCF文件中的数据进行变异检测和处理,得到基因组上的变异检测结果;使用IGV输出显示基因组上的变异检测结果。本发明使用了深度学习技术和长读测序技术,能够解决传统方法在灵活性与泛化能力、计算效率上的低性能,以及面对复杂问题时短读测序存在的无法检测区域的问题。

    一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法

    公开(公告)号:CN119028431A

    公开(公告)日:2024-11-26

    申请号:CN202411514743.0

    申请日:2024-10-29

    Abstract: 本发明适用于生物信息学领域,具体是一种基于深度学习和长读测序的SNP和INDEL检测方法,包括:对待检测数据进行第一预处理,生成第一叠加图像,将第一叠加图像作为SNP检测模型的输入,输出得到SNP的VCF文件;对待检测数据进行第二预处理,生成第二叠加图像,将第二叠加图像作为INDEL检测模型的输入,输出得到INDEL的VCF文件;利用基于R语言的VcfR数据处理工具,对所得到的VCF文件中的数据进行变异检测和处理,得到基因组上的变异检测结果;使用IGV输出显示基因组上的变异检测结果。本发明使用了深度学习技术和长读测序技术,能够解决传统方法在灵活性与泛化能力、计算效率上的低性能,以及面对复杂问题时短读测序存在的无法检测区域的问题。

    基于多尺度卷积网络及扩散系统的农业气象预测方法

    公开(公告)号:CN119047661B

    公开(公告)日:2025-01-28

    申请号:CN202411545074.3

    申请日:2024-11-01

    Abstract: 本发明适用于农业气象预测领域,具体是基于多尺度卷积网络及扩散系统的农业气象预测方法,包括:利用训练好的多尺度卷积网络对农业气象图像进行初步预测,得到初步预测结果;通过扩散模型对初步预测结果进行处理,对初步预测结果进行处理包括:先通过扩散模型增加噪声捕获时空特征之间的联系,以及后通过多步逆扩散过程逐步消除预测结果中噪声;对基于多尺度卷积网络和扩散模型的预测模型进行训练,得到训练好的预测模型;对于给定的农业气象图像,利用预测模型生成未来多个时间步的预测图像序列并输出。本发明通过将时空卷积神经网络结合扩散系统,显著提升了时空数据对于长期预测结果性能的提高。

    基于多尺度卷积网络及扩散系统的农业气象预测方法

    公开(公告)号:CN119047661A

    公开(公告)日:2024-11-29

    申请号:CN202411545074.3

    申请日:2024-11-01

    Abstract: 本发明适用于农业气象预测领域,具体是基于多尺度卷积网络及扩散系统的农业气象预测方法,包括:利用训练好的多尺度卷积网络对农业气象图像进行初步预测,得到初步预测结果;通过扩散模型对初步预测结果进行处理,对初步预测结果进行处理包括:先通过扩散模型增加噪声捕获时空特征之间的联系,以及后通过多步逆扩散过程逐步消除预测结果中噪声;对基于多尺度卷积网络和扩散模型的预测模型进行训练,得到训练好的预测模型;对于给定的农业气象图像,利用预测模型生成未来多个时间步的预测图像序列并输出。本发明通过将时空卷积神经网络结合扩散系统,显著提升了时空数据对于长期预测结果性能的提高。

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