公开(公告)号：CN118389448A

公开(公告)日：2024-07-26

申请号：CN202410193303.3

申请日：2024-02-21

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) ,  广东环凯生物技术有限公司 ,  广东环凯生物科技有限公司

发明人： 李程思 ,  吴清平 ,  吴毓薇 ,  张菊梅 ,  秦小娃 ,  陈志勇 ,  叶青华 ,  赵昕宇 ,  曾嘉辉 ,  刘振杰 ,  林秀华 ,  彭飞艇

IPC分类号： C12N7/00 ,  A23L3/3571 ,  A01N63/40 ,  A01P1/00 ,  C12R1/92

摘要： 本发明公开了一种用于防控克罗诺杆菌的噬菌体鸡尾酒。包括克罗诺杆菌噬菌体Cronobacterbacteriophage vB_CtuP_A24，保藏编号为：GDMCC 61184‑B1；克罗诺杆菌噬菌体Cronobacterbacteriophage vB_CtuP_B1，保藏编号为：GDMCC 61185‑B1克罗诺杆菌噬菌体Cronobacterphage vB_CroP_12_2_1，保藏编号为：GDMCC 64062‑B1；克罗诺杆菌噬菌体Cronobacterphage vB_CroP_15_3，保藏编号为：GDMCC 64061‑B1。本发明中的克罗诺杆菌噬菌体鸡尾酒制剂，可以裂解多种克罗诺杆菌株，具有一定的广谱性。

公开(公告)号：CN118374614A

公开(公告)日：2024-07-23

申请号：CN202410462119.4

申请日：2024-04-17

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) ,  广东环凯生物科技有限公司

发明人： 王涓 ,  汪智 ,  吴清平 ,  丁郁 ,  张伟培 ,  潘紫英 ,  张菊梅 ,  黄溱颖 ,  赵一冰 ,  吴毓薇 ,  赵昕宇

IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

摘要： 本发明公开了用于检测空肠弯曲菌的种特异性分子靶标yclQ、crRNA、CRISPR/Cas12a体系、检测方法及试剂盒。所述靶标yclQ的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，本发明基于该靶标yclQ开发了3种空肠弯曲菌的检测试剂盒，分别为基于RAA/PCR‑CRISPR/Cas12a系统的试剂盒、嵌合荧光法qPCR检测试剂盒和探针法qPCR检测试剂盒，利用上述3种试剂盒对空肠弯曲菌进行检测均能获得高的检测灵敏度，其中第1种试剂盒的检测灵敏度为5.3×100CFU/g，后2种试剂盒的检测DNA的灵敏度达到aM级别。本发明检测方法具有特异性强，灵敏度高，检出速度快等特点，可以应用于食品安全领域。

公开(公告)号：CN117701745A

公开(公告)日：2024-03-15

申请号：CN202311725832.5

申请日：2023-12-15

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) ,  广东科环生物科技有限公司

发明人： 吴清平 ,  邝祖鹏 ,  李滢 ,  吴毓薇 ,  赵昕宇 ,  陈惠元 ,  谢新强 ,  吴磊 ,  赵辉 ,  高鹤 ,  梁婷婷 ,  张菊梅

IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

摘要： 本发明公开了一种快速检测幽门螺杆菌对克拉霉素耐药性的方法及其检测试剂盒。H.py lori对克拉霉素耐药的23S rRNA基因突变基因检测的特异性引物，包括：23S‑4F：5’‑TTGT AGTGGAGGTGAAAATTCCTC‑3’和23S‑4R：5’‑ACCTTTACTACAACTTAGCACTGCT‑3’。本发明方案的检测抗干扰能力更强，即使待测菌株23S rRNA基因2099～2179位点扩增范围内出现除了2143位点以外的碱基突变，本发明检测仍能稳定检出A2143G突变，而传统探针法则无法在此类菌株中检出A2143G突变。

公开(公告)号：CN117660249A

公开(公告)日：2024-03-08

申请号：CN202311673237.1

申请日：2023-12-07

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

发明人： 张淑红 ,  代京莎 ,  吴清平 ,  黄远斌 ,  张菊梅 ,  古其会 ,  杨小鹃 ,  吴毓薇 ,  赵昕宇 ,  邓梅清 ,  曾嘉辉 ,  彭飞艇 ,  林秀华

IPC分类号： C12N1/20 ,  A61K35/744 ,  A61P31/04 ,  A23K10/18 ,  C07K14/195 ,  C12N15/31 ,  C12R1/01

摘要： 本发明公开了一株对多种高毒力多重耐药大肠杆菌具有抑菌活性的乳酸片球菌36E‑3及其应用。乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)36E‑3于2023年11月22日保藏于广东省微生物菌种保藏中心(GDMCC)，地址：广州市先烈中路100号大院59号楼5楼，广东省科学院微生物研究所，邮编：510070，保藏编号为：GDMCC No：64049。本发明的乳酸片球菌36E‑3可以同时抑制多种高毒力致泻大肠杆菌的生长，且携带II类细菌素氨基酸序列，具有广谱抑菌效果(对其他常见食源性致病菌也具有明显抑制作用)，在食品病原菌污染防控和畜禽动物健康养殖方面具有较高的应用价值。

公开(公告)号：CN118497147A

公开(公告)日：2024-08-16

申请号：CN202410708679.3

申请日：2024-06-03

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) ,  广东科环生物科技有限公司

发明人： 吴清平 ,  戚金芝 ,  杨小鹃 ,  吴毓薇 ,  赵昕宇 ,  刘泽锟 ,  黄士轩 ,  杨诗沅 ,  林秀华 ,  曾嘉辉

IPC分类号： C12N7/00 ,  A61K35/76 ,  A61P31/04 ,  A01N63/40 ,  A01P1/00 ,  A23C3/08 ,  C12Q1/70 ,  C12N15/11 ,  C12R1/92

摘要： 本发明公开了两株新型烈性沙门菌噬菌体vB_SalA_35d、vB_SalA_39c及其应用。噬菌体vB_SalA_35d保藏编号为：GDMCC NO：64652‑B1，噬菌体噬菌体vB_SalA_39c保藏编号为：GDMCC NO：64653‑B1。本发明提供的烈性噬菌体特异性好，具有特异性分子靶标，且不含与溶原、耐药及毒力相关的基因。同时，本发明的噬菌体具有良好的热稳定性、pH稳定性及紫外耐受性，不易在应用过程中失活，在生菜和牛奶中对目标菌有较好的抑制效果。综上所述，噬菌体vB_SalA_35d和vB_SalA_39c可作为单一抑制剂或组合其他噬菌体构成抑制剂用于防控沙门菌等病原菌。

公开(公告)号：CN117954095A

公开(公告)日：2024-04-30

申请号：CN202410151303.7

申请日：2024-02-02

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) ,  广东科环生物科技有限公司

发明人： 吴清平 ,  黄惠书 ,  李滢 ,  黄士轩 ,  陈谋通 ,  吴毓薇 ,  赵昕宇 ,  陈惠元 ,  谢新强 ,  吴磊 ,  高鹤 ,  赵辉

IPC分类号： G16H50/30 ,  G16B20/00 ,  G16B40/20 ,  G06F18/241

摘要： 本发明公开了一种结合机器学习及MALDI‑TOF MS的幽门螺杆菌快速鉴定系统。本发明基于一个囊括121株Hp及来自26个属、37个种不同胃部微生物、共5890张菌株蛋白指纹图谱数据的基础上，利用机器学习建立了12个独立的Hp蛋白指纹识别模型，并开发了一套综合上述12个模型鉴定待测菌株是否为Hp的快速鉴定系统Hp_pred。检测者仅需使用少量待测菌株的菌体进行简单的预处理，后在MALDI‑TOF MS质谱仪进行检测，即可在数分钟内实现对待测菌株是否为Hp的鉴定，经测试准确率达到100％。与现有的蛋白指纹图谱鉴定系统相比，Hp_pred系统具有鉴定准确度高、泛化能力强的技术优势，应用前景巨大。

公开(公告)号：CN118866074A

公开(公告)日：2024-10-29

申请号：CN202410837092.2

申请日：2024-06-26

申请人： 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) ,  广东科环生物科技有限公司

发明人： 吴清平 ,  邝祖鹏 ,  李滢 ,  黄士轩 ,  吴毓薇 ,  赵昕宇 ,  谢新强 ,  陈谋通 ,  黄惠书 ,  商燕燕 ,  刘泽锟 ,  张菊梅

IPC分类号： G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

摘要： 本发明公开了一种结合机器学习和MALDI‑TOF MS的幽门螺杆菌耐药诊断系统。该系统基于我国的HP临床菌株MALDI‑TOF MS蛋白组学数据库，利用LightGBM算法分别构建了菌株对于克拉霉素和左氧氟沙星两种抗生素耐药的机器学习预测模型，模型对于克拉霉素和左氧氟沙星的AUROC分别为0.82和0.86，accuracy分别为0.75和0.72。HP_res_pred通过对HP的多张蛋白指纹图谱数据分别调用模型、智能统计并输出耐药预测结果。与现有技术相比，HP_res_pred系统具有耗时短、成本低、菌株用量少、同时可检测两种药物耐药性、预测准确性高及操作简便等优势，应用前景巨大。

公开(公告)号：CN118957115A

公开(公告)日：2024-11-15

申请号：CN202411214743.9

申请日：2024-09-02

申请人： 广东环凯生物科技有限公司 ,  广东环凯信息科技有限公司 ,  广州环凯实验室科技有限公司 ,  上海环凯生物科技有限公司

发明人： 吴毓薇 ,  冯燕梅 ,  吴清平 ,  赵昕宇 ,  叶青华 ,  王涓 ,  万强 ,  蒋富凤 ,  蔡芷荷 ,  黄嘉慧 ,  黄惠书 ,  曲晓莹 ,  张健伟 ,  潘紫英 ,  周聪煜

IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11 ,  C12R1/42 ,  C12R1/01 ,  C12R1/19

摘要： 本发明属于微生物分子检测领域，公开了一种同时检测多种致病菌的多重qPCR试剂盒及方法。发明人针对沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌和阪崎克罗诺杆菌基因组各自的新特异性基因片段以及大肠埃希氏菌O157:H7特异性较高的rfbE基因，优化设计得到的多重qPCR引物探针组具有很高的特异性，仅对四种目标菌在特异性的荧光信号通道检测出现荧光信号，检测结果更加准确。本发明的多重qPCR检测试剂盒10 h内即可完成单管内四种致病菌的高灵敏度检测，其中qPCR全过程仅需约1 h，检测灵敏度可低至1.9～12 CFU/Test，显著提高了检测效率、降低了检测成本，特别适用于大规模样品的摸底排查和实际检测。

公开(公告)号：CN118932095A

公开(公告)日：2024-11-12

申请号：CN202411346147.6

申请日：2024-09-26

申请人： 广东环凯生物科技有限公司 ,  广东环凯信息科技有限公司 ,  广州环凯实验室科技有限公司 ,  上海环凯生物科技有限公司

发明人： 赵昕宇 ,  邹晶晶 ,  吴清平 ,  冯燕梅 ,  吴毓薇 ,  叶青华 ,  王涓 ,  万强 ,  蔡芷荷 ,  黄惠书 ,  黄嘉慧 ,  曲晓莹 ,  张建伟

IPC分类号： C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

摘要： 本发明公开了一种用于检测克罗诺致病菌的四重Taqman qPCR检测试剂，所述克罗诺致病菌为阪崎克罗诺杆菌、丙二酸盐克罗诺杆菌、苏黎世克罗诺杆菌及都柏林克罗诺杆菌；所述试剂包括这四种克罗诺致病菌对应的特异性引物和Taqman探针。本发明提供的靶向阪崎克罗诺杆菌、丙二酸盐克罗诺杆菌、苏黎世克罗诺杆菌和都柏林克罗诺杆菌的引物‑探针组合具有极高的特异性和灵敏性，为重要克罗诺杆菌的防控提供了可靠的依据，有效降低了单重qPCR检测的工作量，工作效率得到了大幅度地提升，同时降低了经济成本。

公开(公告)号：CN118028419A

公开(公告)日：2024-05-14

申请号：CN202410111630.X

申请日：2024-01-26

申请人： 广东环凯生物科技有限公司

发明人： 吴清平 ,  曹璐璐 ,  吴毓薇 ,  金乐萱 ,  赵昕宇 ,  叶青华 ,  万强 ,  曲晓莹 ,  蒋富凤 ,  高宝

IPC分类号： C12Q1/04 ,  G16B30/00 ,  C12R1/01

摘要： 本发明属于微生物鉴定领域，公开了一种克罗诺杆菌属内菌种的生化反应分析数值鉴定方法。通过将待测菌株经克罗诺杆菌选择性培养基纯培养后，进行8个生化实验，基于生化反应的结果，计算其与已知克罗诺杆菌分类单元的模式反应的匹配度，结合鉴定百分数与模式似然比值T值对待测菌株鉴定结果的可信度进行评价，确定待测菌株所属的分类单元。本发明首次建立了克罗诺杆菌属内种间鉴定的生化反应分析数值鉴定方法，所涉及的生化反应呈现的阴性或阳性鉴定结果界限分明，易于判别；生化反应项目少，仅用8种生化实验即可完成克罗诺杆菌属7个种、3个亚种的有效区分，简化操作流程的同时保证了鉴定结果与fusA基因测序法具有高达100%的一致率。