基于批量测序数据预测空间转录组miRNA活性的方法及装置

    公开(公告)号:CN119028451A

    公开(公告)日:2024-11-26

    申请号:CN202411193364.6

    申请日:2024-08-28

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本申请提供了一种基于批量测序数据预测空间转录组miRNA活性的方法及装置,根据本申请的方法包括:收集Bulk测序数据并进行预处理后获取第一数据集,收集空间转录组学数据并进行预处理后获取第二数据集;通过所述第一数据集获取训练好的机器学习模型,并通过网格搜索法获取所述训练好的机器学习模型的最优超参数组合;以及,基于所述训练好的机器学习模型预测第二数据集中的miRNA活性。本申请提供的技术方案可以提供高精度的miRNA活性预测方法。

    一种基于动态异构图的药物-靶点关系预测方法及系统

    公开(公告)号:CN118039023A

    公开(公告)日:2024-05-14

    申请号:CN202410097624.3

    申请日:2024-01-23

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于动态异构图的药物‑靶点关系预测方法及系统,所述方法包括:获取药物与靶点相互作用数据集,将数据集划分为训练集、验证集和测试集;基于数据集建立药物‑靶点动态异构图网络;建立相互作用预测模型,所述相互作用预测模型用于,基于药物‑靶点动态异构图网络,采用图神经网络模型计算药物和靶点的表征向量,计算药物的表征向量与靶点的表征向量的内积,得到二者的相关性,将相关性作为药物靶点预测;通过训练集对相互作用预测模型进行训练,验证集选择与优化相互作用预测模型超参数、权重及训练轮数;将测试集输入训练好的相互作用预测模型预测药物‑靶点关系。本发明可以实现基于动态异构图的药物‑靶点关系预测方法。

    激光软钎焊设备的温度控制方法、系统、设备和介质

    公开(公告)号:CN117020346A

    公开(公告)日:2023-11-10

    申请号:CN202311035609.8

    申请日:2023-08-16

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本方案涉及激光软钎焊设备的温度控制方法、系统、设备和介质,控制方法包括:根据目标曲线获取预测时域内的目标温度序列,根据目标温度序列和预测模型的预测温度建立代价函数,并建立约束条件,预测模型用于预测未来一段时间内的预测温度,在满足约束条件的情况下,使代价函数最小,求解得到最优控制序列,从最优控制序列中确定目标控制功率,根据目标控制功率驱动激光软钎焊设备加热焊点。本发明可以减少实际输出温度与目标温度之间的误差值,提高系统的响应速度和控制精度,应用于焊接控制领域。

    一种基于调制技术的多级目录DNA存储编解码方法

    公开(公告)号:CN116364185A

    公开(公告)日:2023-06-30

    申请号:CN202310173414.3

    申请日:2023-02-27

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于调制技术的多级目录DNA存储编解码方法,其包括如下步骤:S100:生成引物序列和文件数据序列的调制码表,构建引物序列数据集和文件绝对路径集;S200:将待存储二进制文件调制成DNA序列,合成后进行体外存储;S300:选择目标引物,从合成池中扩增出目标逻辑磁盘下的DNA分子并测序;S400:对测序数据的每个读长根据观测调制序列,计算其文件绝对路径并以此对测序数据进行分组;S500:根据编码DNA链长度及文件绝对路径,生成用于解码各分组数据的调制序列;并用此调制序列按照调制DNA存储解码算法解码数据。本发明基于调制技术设计寻址序列,提出多级目录DNA存储编解码方法,可实现高效、灵活的DNA存储文件管理方式。

    一种基于DNA存储介质的文本存储方法

    公开(公告)号:CN112582030B

    公开(公告)日:2023-08-15

    申请号:CN202011508358.7

    申请日:2020-12-18

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明提供的一种基于DNA存储介质的文本存储方法,方法包括:获取原始文本,对原始文本进行编码得到DNA存储序列;将DNA存储序列进行合成,得到DNA分子序列,对DNA分子序列进行扩增,将扩增后的DNA分子序列进行存储;获取存储的DNA分子序列,进行转码得到原始文本;进行转码得到原始文本包括步骤:对存储的DNA分子序列进行测序,得到DNA分子序列的读长;预处理读长,去除读长中的噪音数据,将预处理后的读长进行转码得到原始文本。方法通过直接通过序列的读长将存储的DNA分子序列进行转换,去除了较多的冗余码,提高了存储效率,方法转码以及解码过程中,充分运用了原始文本中的语义信息,查询处理能力强,可广泛应用于系统生物学研究技术领域。

    基于智能算法的基因合成方法、装置、设备及介质

    公开(公告)号:CN117352056A

    公开(公告)日:2024-01-05

    申请号:CN202311455241.0

    申请日:2023-11-02

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明提供了一种基于智能算法的基因合成方法、装置、设备及介质,其中,方法包括:获取基因合成的信息输入至算法模型,获取引物集;根据输入的DNA序列、化学参数、长度范围,通过贪心算法将DNA序列划分为预设个数的寡核苷酸片段;将获取的预设个数的寡核苷酸片段通过迭代算法得到每个池的溶解温度标准差最小的分割结果;对获取的分割结果进行深度优先搜索,对每个池的分割结果构建二维数组,每列取一条寡核苷酸使得取到的寡核苷酸溶解温度标准差最小,得到新的寡核苷酸集;通过输入的结果类型对所述新的寡核苷酸集进行组装得到引物集。使设计的引物相应的重叠区域熔解温度比3℃更小,从而极大限度的提高组装的正确率,减少组装的误差。

    一种鲁棒反演滑模温度控制方法、装置、电子设备及介质

    公开(公告)号:CN117075653A

    公开(公告)日:2023-11-17

    申请号:CN202311092468.3

    申请日:2023-08-28

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鲁棒反演滑模温度控制方法、装置、电子设备及介质,方法包括:通过集中参数法,并引入外部扰动项和系统不确定项建立目标加热阶段的目标热力学数学模型;其中,目标热力学数学模型表征控制输入的激光功率和系统输出的焊接温度的数学关系;获取目标加热阶段的目标温度曲线;其中,目标温度曲线包括目标加热阶段各时刻的目标温度;根据目标温度和系统输出,结合滑模函数建立目标李雅普诺夫函数;基于目标李雅普诺夫函数,通过反演法获得控制计算式;其中,控制计算式表征焊接温度和目标温度与激光功率的数学关系;通过控制计算式,获得激光功率的控制输入值。本发明能够高效进行鲁棒反演滑模温度控制,可广泛应用于计算机技术领域。

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