公开(公告)号：CN107881221B

公开(公告)日：2021-03-02

申请号：CN201711487999.7

申请日：2017-12-29

申请人： 河南农业大学

发明人： 菅复春 ,  刘珍珍 ,  胡苏辉 ,  宁晓东 ,  王荣军 ,  张龙现 ,  宁长申

IPC分类号： C12Q1/6848 ,  C12Q1/6893

摘要： 本发明公开了一种基于Lectin基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法，具体步骤如下：（1）基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增，测序比对，确定待测样品是否为隐孢子虫阳性，以及属于哪一种隐孢子虫种；（2）若待测样品属于C.parvum、C.hominis、C.cuniculus、horse genotype或驴源C.hominis中的一种，则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增，测序比对，通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明，Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度，可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。

公开(公告)号：CN107881221A

公开(公告)日：2018-04-06

申请号：CN201711487999.7

申请日：2017-12-29

申请人： 河南农业大学

发明人： 菅复春 ,  刘珍珍 ,  胡苏辉 ,  宁晓东 ,  王荣军 ,  张龙现 ,  宁长申

IPC分类号： C12Q1/6848 ,  C12Q1/6893

CPC分类号： Y02A50/451 ,  C12Q1/6848 ,  C12Q1/6893 ,  C12Q2549/119 ,  C12Q2537/165

摘要： 本发明公开了一种基于Lectin 基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法，具体步骤如下：（1）基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增，测序比对，确定待测样品是否为隐孢子虫阳性，以及属于哪一种隐孢子虫种；（2）若待测样品属于C. parvum、C. hominis、C. cuniculus、horse genotype或驴源C. hominis中的一种，则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增，测序比对，通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明，Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA 序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度，可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。