基于RPA-CRISPR/Cas12a检测十二指肠贾第虫集聚体A或者B的试剂盒及检测方法

    公开(公告)号:CN117467783A

    公开(公告)日:2024-01-30

    申请号:CN202311054113.5

    申请日:2023-08-21

    Abstract: 本发明基于RPA‑CRISPR/Cas12a检测十二指肠贾第虫集聚体A或者B的试剂盒及检测方法,属于病原检测技术领域。本发明提供了基于RPA‑CRISPR/Cas12a检测十二指肠贾第虫集聚体A或者B的tpi位点的靶点序列,所述靶点序列为十二指肠贾第虫集聚体A的tpi基因位点KM190791的第137 bp~第160 bp位点的核苷酸序列;所述第137 bp~第160 bp位点的核苷酸序列为SEQ ID NO:1;十二指肠贾第虫集聚体B的tpi基因位点KP687783的第171 bp~第194 bp位点的核苷酸序列;所述第171 bp~第194 bp位点的核苷酸序列为SEQ ID NO:2。同时本发明还提供了检测十二指肠贾第虫集聚体A或者B的试剂盒,包括权利要求2所述上下游引物对及RPA扩增体系的TwistAmpTM Basic Kit试剂盒及试剂、权利要求4所述的crRNA及CRISPR/Cas12a荧光检测反应体系的试剂及CRISPR/Cas12a试纸条检测反应体系的试剂。

    基于Lectin基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法

    公开(公告)号:CN107881221A

    公开(公告)日:2018-04-06

    申请号:CN201711487999.7

    申请日:2017-12-29

    Abstract: 本发明公开了一种基于Lectin 基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法,具体步骤如下:(1)基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,确定待测样品是否为隐孢子虫阳性,以及属于哪一种隐孢子虫种;(2)若待测样品属于C. parvum、C. hominis、C. cuniculus、horse genotype或驴源C. hominis中的一种,则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明,Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA 序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度,可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。

    采用LAMP技术检测牛无浆体方法

    公开(公告)号:CN104152550B

    公开(公告)日:2016-05-18

    申请号:CN201410332786.7

    申请日:2014-07-14

    Abstract: 采用LAMP技术检测牛无浆体方法,该检测方法包括LAMP引物设计、LAMP 反应体系建立以及采用LAMP检测方法,所述的 LAMP 检测方法是采用特异性检测、敏感性检测和荧光可视化检测,所述的LAMP引物设计利用Primer Explorer V4软件针对牛无浆体16S rRNA基因的6个位点设计4条LAMP引物,引物包括两条外引物F3和B3、两条内引物FIP和BIP,其中:F3:GGGCATGTAGGTGGTTTGG;B3:GCGTGGACTACCAGGGTAT;FIP:TCTCCCGGACTCCAGTCTGGTAAAGGTGAAATGCCAGGGC;BIP:ATTAGGAGGAACACCAGTGGCGCACGCTTTCGCACCTCAG。该法以牛无浆体16S rRNA为靶基因位点,具有快速、灵敏、高效、低成本等特点,为牛无浆体病的病原检测提供新的技术方法。

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