一种预测环状RNA IRES的方法

    公开(公告)号:CN115394376B

    公开(公告)日:2023-04-18

    申请号:CN202211194884.X

    申请日:2022-09-28

    IPC分类号: G16C20/50 G16C20/70

    摘要: 本发明公开了一种基于DeepCPI计算框架将特征嵌入与深度学习方法相结合实现预测环状RNA IRES的方法。在预测过程中,该方法使用S‑LSTM学习全局句子级节点来表征整个RNA序列,从而为分类任务建模上下文信息。此外,该方法通过一个加权RNA图来模拟RNA的二级结构,并基于GCN提取所需结构特征。与此同时,该方法采用下采样和模型集成解决数据不平衡带来的问题。验证实验结果表明,与目前各种深度学习方法相比,本发明所述方法不仅在序列和结构中提取特征方面具有最佳的性能,而且能有效预测不同长度的人和病毒环状RNA IRES。由此可见,本发明所提供的方法可以应用于环状RNA编码能力研究以及随后的环状RNA设计和应用,如环状RNA疫苗的开发。

    一种预测环状RNA IRES的方法

    公开(公告)号:CN115394376A

    公开(公告)日:2022-11-25

    申请号:CN202211194884.X

    申请日:2022-09-28

    IPC分类号: G16C20/50 G16C20/70

    摘要: 本发明公开了一种基于DeepCPI计算框架将特征嵌入与深度学习方法相结合实现预测环状RNA IRES的方法。在预测过程中,该方法使用S‑LSTM学习全局句子级节点来表征整个RNA序列,从而为分类任务建模上下文信息。此外,该方法通过一个加权RNA图来模拟RNA的二级结构,并基于GCN提取所需结构特征。与此同时,该方法采用下采样和模型集成解决数据不平衡带来的问题。验证实验结果表明,与目前各种深度学习方法相比,本发明所述方法不仅在序列和结构中提取特征方面具有最佳的性能,而且能有效预测不同长度的人和病毒环状RNA IRES。由此可见,本发明所提供的方法可以应用于环状RNA编码能力研究以及随后的环状RNA设计和应用,如环状RNA疫苗的开发。

    一种抗体的抗原结合片段-海兔毒素偶联物及其制备方法和应用

    公开(公告)号:CN108084267A

    公开(公告)日:2018-05-29

    申请号:CN201711195434.1

    申请日:2017-11-24

    申请人: 浙江大学

    摘要: 本发明公开了一种抗体的抗原结合片段-海兔毒素偶联物及其制备方法和应用,所述制备方法包括以下步骤:(1)提供C端具有LPXTG序列的抗CD20单抗的抗原结合片段、具有寡甘氨酸接头的海兔毒素或海兔毒素衍生物;(2)在Sortase A酶催化下,LPXTG序列与寡甘氨酸接头发生转肽反应,使所述抗原结合片段与具有寡甘氨酸接头的海兔毒素或海兔毒素衍生物进行偶联;(3)反应完成后,分离纯化得到所述抗原结合片段-海兔毒素偶联物。本发明抗原结合片段-海兔毒素偶联药物,保留了全抗-海兔毒素偶联药物的特异性和亲和力,以及对CD20阳性肿瘤细胞的杀伤作用;并且具有较快的穿透肿瘤的速率及较高的肿瘤部位的聚集量。

    一种抗体偶联药物的制备方法、抗体偶联药物及应用

    公开(公告)号:CN107875398A

    公开(公告)日:2018-04-06

    申请号:CN201710892507.6

    申请日:2017-09-27

    申请人: 浙江大学

    CPC分类号: A61K38/07

    摘要: 本发明公开了一种抗体偶联药物的制备方法、抗体偶联药物及应用。所述制备方法先在Sortase A酶催化下,LPXTG序列与寡甘氨酸接头发生转肽反应,使所述抗CD20单克隆抗体连接第一连接臂;然后所述叠氮基接头与炔基接头发生环加成反应,使所述第一连接臂连接第二连接臂。利用酶-化学法制备抗体偶联药物,降低价格昂贵药物的用量,节省成本。采用双功能小分子,减小Sortase A酶转肽反应时的空间位阻,灵活性好。有效控制抗体上药物的偶联位点和个数,增强均一性,在保持原有抗体亲和性的基础上提高其体内外抗肿瘤活性。

    一种超抗原参与的三功能T细胞衔接器及其应用

    公开(公告)号:CN116284448B

    公开(公告)日:2024-06-21

    申请号:CN202310166185.2

    申请日:2023-02-14

    申请人: 浙江大学

    摘要: 本发明公开了一种超抗原参与的三功能T细胞衔接器的制备及其应用,涉及生物制药技术领域。本发明超抗原参与的三功能T细胞衔接器在细胞水平上具有较好的特异性T细胞激活、增殖活性及T细胞抗肿瘤活性,而且对实体瘤具有不错的疗效。因此,本发明的三功能T细胞衔接器或其编码的基因可用于制成抗肿瘤药物。该超抗原参与的三功能T细胞衔接器的制备方法有着制备简便且通过哺乳动物细胞表达的优点。