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公开(公告)号:CN106815491B
公开(公告)日:2021-11-16
申请号:CN201710069402.0
申请日:2017-02-08
IPC分类号: G16B20/20
摘要: 本发明涉及一种用于检测FFPE样本基因融合的装置,其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块以及输出模块。本发明的用于检测FFPE样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。
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公开(公告)号:CN108251515A
公开(公告)日:2018-07-06
申请号:CN201611222985.8
申请日:2016-12-27
IPC分类号: C12Q1/6869 , C40B50/06 , C40B40/06
摘要: 本发明涉及一种构建FFPE样本DNA文库的方法,总体而言,本发明对FFPE样本DNA文库的构建方法做了改进,对低质量FFPE样本DNA进行末端修复,纯化;3'端加A;加接头,纯化以及PCR扩增,纯化。其中,加接头反应结束后,使用0.9×磁珠进行纯化。本发明通过对建库步骤的优化,降低了DNA片段的损失,即使采用低质量FFPE样本DNA构建文库仍然能够获得足够高通量测序使用的文库产量,使对低质量FFPE样本的研究成为可能。
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公开(公告)号:CN106845150B
公开(公告)日:2021-11-16
申请号:CN201710067169.2
申请日:2017-02-07
摘要: 本发明涉及一种用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置,其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。
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公开(公告)号:CN108256295B
公开(公告)日:2021-10-22
申请号:CN201611242964.2
申请日:2016-12-29
IPC分类号: G16B30/10
摘要: 本发明涉及一种用于检测基因融合的装置,其包括测序数据获取模块、比对模块、区分模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。
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公开(公告)号:CN108256295A
公开(公告)日:2018-07-06
申请号:CN201611242964.2
申请日:2016-12-29
IPC分类号: G06F19/20
摘要: 本发明涉及一种用于检测基因融合的装置,其包括测序数据获取模块、比对模块、区分模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。
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公开(公告)号:CN108103168A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201611061510.5
申请日:2016-11-23
摘要: 本发明涉及一种FFPE样本中DNA质量评估方法。总体而言,本发明通过核苷酸序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:8所示的引物对FFPE样本DNA进行PCR扩增,根据琼脂糖凝胶电泳结果有效评估DNA质量的等级,对FFPE样本的DNA质量准确分级。
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公开(公告)号:CN108103167A
公开(公告)日:2018-06-01
申请号:CN201611046670.2
申请日:2016-11-23
摘要: 本发明涉及一种FFPE样本DNA片段质量的检测试剂盒及方法。总体而言,本发明通过三对引物对FFPE样本DNA片段进行扩增,并将扩增产物利用琼脂糖凝胶电泳检测,根据琼脂糖凝胶电泳图判定FFPE样本DNA片段质量。
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公开(公告)号:CN106845150A
公开(公告)日:2017-06-13
申请号:CN201710067169.2
申请日:2017-02-07
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 本发明涉及一种用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置,其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。
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公开(公告)号:CN106815491A
公开(公告)日:2017-06-09
申请号:CN201710069402.0
申请日:2017-02-08
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G06F19/18
CPC分类号: G06F19/18
摘要: 本发明涉及一种用于检测FFPE样本基因融合的装置,其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块以及输出模块。本发明的用于检测FFPE样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。
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