公开(公告)号：CN106845150B

公开(公告)日：2021-11-16

申请号：CN201710067169.2

申请日：2017-02-07

申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 ,  安诺优达基因科技(北京)有限公司 ,  安诺优达(义乌)医学检验有限公司

发明人： 董永芳 ,  荆瑞琳 ,  陈利斌 ,  隋光磊 ,  董超 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G16B30/10 ,  G16B15/30 ,  G16B25/20

摘要： 本发明涉及一种用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。

公开(公告)号：CN106815491B

公开(公告)日：2021-11-16

申请号：CN201710069402.0

申请日：2017-02-08

申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 ,  安诺优达基因科技(北京)有限公司 ,  安诺优达(义乌)医学检验有限公司

发明人： 董永芳 ,  荆瑞琳 ,  张萌萌 ,  刘伟 ,  董超 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G16B20/20

摘要： 本发明涉及一种用于检测FFPE样本基因融合的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块以及输出模块。本发明的用于检测FFPE样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。

公开(公告)号：CN106845154B

公开(公告)日：2022-04-08

申请号：CN201710067086.3

申请日：2017-02-07

申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 ,  安诺优达基因科技(北京)有限公司 ,  安诺优达(义乌)医学检验有限公司

发明人： 荆瑞琳 ,  张萌萌 ,  董永芳 ,  王旺 ,  李雪峰 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G16B20/20

摘要： 本发明涉及一种FFPE样本拷贝数变异检测装置，其检测灵敏度高。本发明的FFPE样本拷贝数变异检测装置包括测序数据获取模块、序列比对模块、前期数据处理模块、归一化模块、背景库筛选模块、数据波动消除模块、GC校正模块以及输出模块。

公开(公告)号：CN108256295B

公开(公告)日：2021-10-22

申请号：CN201611242964.2

申请日：2016-12-29

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司 ,  浙江安诺优达生物科技有限公司 ,  安诺优达(义乌)医学检验有限公司

发明人： 董永芳 ,  荆瑞琳 ,  董超 ,  王旺 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G16B30/10

摘要： 本发明涉及一种用于检测基因融合的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、区分模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。

公开(公告)号：CN108256295A

公开(公告)日：2018-07-06

申请号：CN201611242964.2

申请日：2016-12-29

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司 ,  浙江安诺优达生物科技有限公司 ,  安诺优达(义乌)医学检验有限公司

发明人： 董永芳 ,  荆瑞琳 ,  董超 ,  王旺 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G06F19/20

摘要： 本发明涉及一种用于检测基因融合的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、区分模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。

公开(公告)号：CN106845154A

公开(公告)日：2017-06-13

申请号：CN201710067086.3

申请日：2017-02-07

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 荆瑞琳 ,  张萌萌 ,  董永芳 ,  王旺 ,  李雪峰 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G06F19/22

CPC分类号： G06F19/22

摘要： 本发明涉及一种FFPE样本拷贝数变异检测装置，其检测灵敏度高。本发明的FFPE样本拷贝数变异检测装置包括测序数据获取模块、序列比对模块、前期数据处理模块、归一化模块、背景库筛选模块、数据波动消除模块、GC校正模块以及输出模块。

公开(公告)号：CN106845150A

公开(公告)日：2017-06-13

申请号：CN201710067169.2

申请日：2017-02-07

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 董永芳 ,  荆瑞琳 ,  陈利斌 ,  隋光磊 ,  董超 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G06F19/20 ,  G06F19/22

CPC分类号： G06F19/20 ,  G06F19/22

摘要： 本发明涉及一种用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块、以及输出模块。本发明的用于检测循环肿瘤DNA样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。

公开(公告)号：CN106815491A

公开(公告)日：2017-06-09

申请号：CN201710069402.0

申请日：2017-02-08

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 董永芳 ,  荆瑞琳 ,  张萌萌 ,  刘伟 ,  董超 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： G06F19/18

CPC分类号： G06F19/18

摘要： 本发明涉及一种用于检测FFPE样本基因融合的装置，其包括测序数据获取模块、比对模块、再比对模块、真实融合断点判断模块以及输出模块。本发明的用于检测FFPE样本基因融合的装置具有检测速度快、资源要求低、稳定性高的优点。

公开(公告)号：CN106755506A

公开(公告)日：2017-05-31

申请号：CN201710067030.8

申请日：2017-02-07

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 王旺 ,  荆瑞琳 ,  董永芳 ,  玄兆伶 ,  李大为 ,  梁峻彬 ,  陈重建

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/166 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2565/519 ,  C12Q2531/113

摘要： 本发明提供一种用于检测肿瘤FFPE样本中基因变异的试剂盒，该试剂盒包括用于基因捕获的探针，所述用于捕获的探针包括针对SNV区域设计的探针、针对CNV区域设计的探针、针对FUSION区域设计的探针，公共引物如SEQ ID NO:1所示核苷酸序列引物，以及标签引物如SEQ ID NO:2～SEQ ID NO:5所示核苷酸序列引物。根据本发明，在肿瘤FFPE样本中基因变异的检测方法中，能够同时稳定的检出基因SNV、CNV以及FUSION。