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公开(公告)号：CN101967476B
公开(公告)日：2012-11-14
申请号：CN201010299261.X
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC: C12N15/11
CPC classification number: C40B40/06 , C12N15/1065 , C40B50/08
Abstract: 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列，并将标签嵌入DNA接头中从而形成DNA PCR-Free标签接头。本发明还提供了通过连接DNA PCR-Free标签接头来导入标签序列，不需要经过PCR反应而成功构建DNA标签文库，并应用于solexa DNA测序。这样将建库方法优化以后，不需要通过PCR反应来构建DNA标签文库。
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公开(公告)号：CN102643792A
公开(公告)日：2012-08-22
申请号：CN201110040036.9
申请日：2011-02-17
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q2527/119 , C12Q2563/137
Abstract: 本发明涉及高通量测序技术，具体提供了一种RNA断裂试剂及其应用。本发明提供的RNA断裂试剂，包括维持pH值在7至9之间的生物缓冲液，一价金属离子和二价金属离子；其中所述生物缓冲液、一价金属离子和二价金属离子均处于有效浓度。本发明还提供了上述试剂在RNA测序文库构建中的应用。利用该试剂的建库方法简化了操作步骤，在节约时间、降低成本的同时，利于自动化批量样品建库，利于自动化仪器的应用。
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公开(公告)号：CN102409046A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299265.8
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12N15/1093
Abstract: 本发明基于目前illumina公司提供的Solexa Single End测序平台，针对小分子RNA样品，设计了特定序列作为标签。本发明提供了使用所设计的标签，利用PCR方法构建小分子RNA标签文库的方法。本发明的这些标签及其PCR引物可以应用于任何小分子RNA标签的文库构建。
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公开(公告)号：CN103014137A
公开(公告)日：2013-04-03
申请号：CN201110283718.2
申请日：2011-09-22
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6809 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种分析基因表达定量的方法，所述方法包括：从总RNA中纯化mRNA，制备片段化mRNA；将所述片段化mRNA逆转录制备得到cDNA，将所述cDNA纯化后制备为平末端DNA，纯化所述平末端DNA；将所述平末端DNA片段制备得到末端加“A”碱基的DNA片段；在所述末端加“A”碱基的DNA片段两端加接头序列，得到两端加接头序列的DNA片段并进行纯化，对所述两端加接头序列的DNA片段进行PCR反应，纯化PCR反应产物；对所述PCR反应产物测序；将所述测序得到的数据过滤不合格序列得到干净序列，利用短序列映射程序将所述干净序列与参考序列比对，对所述比对结果进行分析。本发明有效的实现了定量准、可重复性高、费用低、检测阈值宽、信号噪音小等优点。
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公开(公告)号：CN102409044A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299248.4
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C40B40/06 , C12N15/1065 , C12Q1/6869 , C40B50/02 , C40B50/06 , C12Q2525/119
Abstract: 本发明基于目前illumina公司提供的Solexa Single End测序平台，针对数字基因表达谱文库(DGE)样品建库方法，设计了独特的标签序列(index1-12)，通过接头将标签嵌DGE文库的3’接头中，成功的建立了数字基因表达谱标签文库(DGE标签文库)的建库方法，适合任何真核生物RNA样品的DGE标签文库构建，并成功用于solexa测序，不仅增大了DGE样品的测序通量，而且降低了solexa针对DGE测序的费用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101967476A
公开(公告)日：2011-02-09
申请号：CN201010299261.X
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C40B40/06 , C12N15/1065 , C40B50/08
Abstract: 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列，并将标签嵌入DNA接头中从而形成DNA PCR-Free标签接头。本发明还提供了通过连接DNA PCR-Free标签接头来导入标签序列，不需要经过PCR反应而成功构建DNA标签文库，并应用于solexa DNA测序。这样将建库方法优化以后，不需要通过PCR反应来构建DNA标签文库。
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公开(公告)号：CN102517392A
公开(公告)日：2012-06-27
申请号：CN201110439198.X
申请日：2011-12-26
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置。该方法包括：提取微生物样品中的DNA；对宏基因组16S rDNA的高可变区V3进行扩增，对扩增产物进行Solexa建库，同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头，对每个样品进行标记；将带有标签序列的不同样品进行混合，混合后使用Solexa测序工具进行测序，得到按照标签区分的原始的测序序列reads；利用reads的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列unique reads；对unique reads进行分类分析，以实现对微生物群体的分类。本发明的方法和装置，对微生物群体的分类准确，且大大降低了测序成本。
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公开(公告)号：CN102409048A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299271.3
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2537/143
Abstract: 本发明提供了长度为7bp独特的标签序列，可以分别通过接头连接和PCR反应分别将标签序列导入DNA标签文库。本发明基于目前illumina公司的solexa测序平台提供了使用所述标签序列构建DNA标签文库的方法，应用于solexa DNA测序，提高了DNA标签文库的制备的效率，增大了DNA样品的测序通量，降低了单个样品的solexa测序费用。
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公开(公告)号：CN102409049A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299305.9
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12N15/1065 , C12Q1/6869 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q2537/143
Abstract: 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列，并将标签嵌入DNA PCR引物中从而形成DNA PCR标签引物，从而可以通过PCR反应导入标签序列。本发明成功地建立了DNA标签文库的建库方法，并应用于solexa DNA测序。
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公开(公告)号：CN102409045A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299257.3
申请日：2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12N15/1065 , C12Q2525/191 , C12Q2563/179
Abstract: 本发明基于illumina公司的solexa测序平台提供的DNA标签文库制备方法，设计了长度为6bp独特的标签序列，将标签嵌入DNA接头中，通过连接DNA接头连接来导入标签序列，成功的建立了DNA标签文库的建库方法，并应用于solexa DNA测序。
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