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公开(公告)号：CN103060924B
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201110316066.8
申请日：2011-10-18
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC分类号： C12Q1/6874 , C12N15/1093 , C12Q1/6853 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12Q2523/125 , C12Q2525/179 , C12Q2525/191 , C12Q2531/113 , C12Q2537/159
摘要： 本发明涉及微量核酸样本的文库制备方法及其应用，所述方法包括：用DOP(Degenerate Oligonucleotide Primed)引物对样本中的DNA进行第一次扩增，DOP引物序列具有至少5′端非简并核苷酸区和3′端简并核苷酸区；用DOP-Amp引物对第一PCR产物进行第二次扩增，获得第二PCR扩增产物；对第二PCR扩增产物进行接头连接PCR(adaptor-ligation PCR)，获得第三PCR产物，两端带有测序接头的第三PCR产物即为核酸文库。所述文库可以进行片段大小选择和高通量测序，得到样本中疾病相关的基因信息。本发明还提供一种试剂盒及其在所述微量核酸样本文库制备的用途。
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公开(公告)号：CN102533960A
公开(公告)日：2012-07-04
申请号：CN201010619689.8
申请日：2010-12-31
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12Q1/6851 , C12Q1/6869 , C12Q1/6876 , C12Q2600/166 , C12Q2531/119 , C12Q2545/101
摘要： 本发明公开了一种单细胞基因组分析方法和试剂盒。所述方法包括：a、获取完整细胞基因组DNA；b、进行单细胞全基因组扩增；c、对扩增产物进行定量检测及定性检测，所述定性检测是指，采用Housekeeping Gene检测方法，对单细胞全基因组的扩增产物进行检测。所述试剂盒含有所述单细胞的Housekeeping Gene的特异性引物。本发明的方法可以全面完整地分析单细胞基因组的遗传变异信息，并对于全新物种的单细胞基因组研究提供了有效的研究策略；而引入的定性及定量检测筛选步骤，可去除大量不合格的扩增样品，从而控制下游上机测序文库的质量，能从很大程度上避免不必要的浪费。
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公开(公告)号：CN104508141A
公开(公告)日：2015-04-08
申请号：CN201280074982.8
申请日：2012-08-23
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q2600/156
摘要： 提供了确定个体是否患有异常状态的方法及系统。其中，确定个体是否患有异常状态的方法包括：针对所述个体的核酸样本，构建测序文库；对所述测序文库进行测序，以便获得测序结果，所述测序结果由多个测序数据构成；基于所述测序数据，确定所述测序结果中所包含的已知SNP；以及基于所述已知SNP，确定所述个体是否患有与所述已知SNP相关的异常状态。
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公开(公告)号：CN102533960B
公开(公告)日：2014-04-30
申请号：CN201010619689.8
申请日：2010-12-31
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12Q1/6851 , C12Q1/6869 , C12Q1/6876 , C12Q2600/166 , C12Q2531/119 , C12Q2545/101
摘要： 本发明公开了一种单细胞基因组分析方法和试剂盒。所述方法包括：a、获取完整细胞基因组DNA；b、进行单细胞全基因组扩增；c、对扩增产物进行定量检测及定性检测，所述定性检测是指，采用Housekeeping？Gene检测方法，对单细胞全基因组的扩增产物进行检测。所述试剂盒含有所述单细胞的Housekeeping？Gene的特异性引物。本发明的方法可以全面完整地分析单细胞基因组的遗传变异信息，并对于全新物种的单细胞基因组研究提供了有效的研究策略；而引入的定性及定量检测筛选步骤，可去除大量不合格的扩增样品，从而控制下游上机测序文库的质量，能从很大程度上避免不必要的浪费。
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公开(公告)号：CN103060924A
公开(公告)日：2013-04-24
申请号：CN201110316066.8
申请日：2011-10-18
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC分类号： C12Q1/6874 , C12N15/1093 , C12Q1/6853 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12Q2523/125 , C12Q2525/179 , C12Q2525/191 , C12Q2531/113 , C12Q2537/159
摘要： 本发明涉及微量核酸样本的文库制备方法及其应用，所述方法包括：用DOP(Degenerate Oligonucleotide Primed)引物对样本中的DNA进行第一次扩增，DOP引物序列具有至少5′端非简并核苷酸区和3′端简并核苷酸区；用DOP-Amp引物对第一PCR产物进行第二次扩增，获得第二PCR扩增产物；对第二PCR扩增产物进行接头连接PCR(adaptor-ligation PCR)，获得第三PCR产物，两端带有测序接头的第三PCR产物即为核酸文库。所述文库可以进行片段大小选择和高通量测序，得到样本中疾病相关的基因信息。本发明还提供一种试剂盒及其在所述微量核酸样本文库制备的用途。
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