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公开(公告)号:CN107208158A
公开(公告)日:2017-09-26
申请号:CN201680007652.5
申请日:2016-02-26
申请人: 赛卢拉研究公司
发明人: 斯蒂芬·P·A·福多尔 , 克里斯蒂娜·范 , 格伦·弗 , 杰弗里·菲舍
CPC分类号: G06K19/06103 , C12Q1/6813 , C12Q1/6816 , C12Q2525/179 , C12Q2543/10 , C12Q2563/155
摘要: 本披露提供了用于确定样品内不同空间位置中的不同靶标的数目的方法、组合物、系统、装置以及试剂盒。在一些实例中,这些方法包括:使用多种随机条形码随机条形编码该样品中的该多种靶标,其中该多种随机条形码中的每一种包含空间标记和分子标记;使用该分子标记估计该多种靶标中的每一种的数目;并且使用该空间标记鉴定该多种靶标中的每一种的空间位置。该方法可以是多重复路的。
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公开(公告)号:CN106715714A
公开(公告)日:2017-05-24
申请号:CN201480082163.7
申请日:2014-10-17
申请人: 深圳华大基因研究院
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12N15/1093 , C12N15/10 , C12Q1/68 , C12Q1/6806 , C12Q1/6853 , C12Q1/686 , C40B40/08 , C40B50/06 , C12Q2521/501 , C12Q2525/155 , C12Q2525/179 , C12Q2525/186 , C12Q2535/122
摘要: 本发明提供了用于核酸随机片段化的引物及核酸随机片段化方法。所述引物由若干条上游随机引物和下游随机引物组成;上游随机引物序列组成为:5’‑X‑Y‑3’;下游随机引物序列组成为:5’‑P‑Y’‑X’‑close‑3’;Y和Y’为随机序列,X为测序平台5’端接头全部或部分序列,X’为测序平台5’端接头全部或部分序列,P为磷酸化修饰,close为封闭修饰。本发明的引物利用上下游随机引物的双随机锚定,能对DNA样品进行随机打断。
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公开(公告)号:CN106062209A
公开(公告)日:2016-10-26
申请号:CN201480068025.3
申请日:2014-09-24
申请人: STC.UNM公司
发明人: J.S.爱德华兹
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/689 , C12Q1/6853 , C12Q2600/158 , C12Q2600/16 , C12Q2525/161 , C12Q2525/179 , C12Q2563/179
摘要: 本公开内容描述用于通过组装多个较短的多核苷酸阅读测序长DNA序列部分的方法。一般而言,所述方法包括退火多个引物与变性的DNA分子,在引物的5’末端附加条码多核苷酸,使DNA分子经受多个循环的(1)合并、(2)分开和(3)向引物的5’末端附加条码多核苷酸,测序条码多核苷酸和基因组DNA,以及组装具有同一的条码多核苷酸的短阅读多核苷酸序列。
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公开(公告)号:CN105821481A
公开(公告)日:2016-08-03
申请号:CN201610273808.6
申请日:2016-04-28
申请人: 元码基因科技(北京)有限公司
发明人: 田埂
CPC分类号: C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/6883 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2535/122 , C12Q2525/191 , C12Q2525/179
摘要: 本发明涉及一种游离DNA的文库构建方法,在单链游离DNA的3’端连接唯一序列标签,其中,唯一序列标签由随机序列和接头序列组成;加入PCR扩增用上游引物和下游引物进行PCR扩增,其中,上游引物为针对目标低频突变设计的引物,下游引物为与接头序列对应的引物。此外,本发明还涉及一种游离DNA中低频突变的检测方法,在单链游离DNA的3’端连接唯一序列标签,加入PCR扩增用上游引物和下游引物进行PCR扩增,上游引物和下游引物的一端分别与测序标签连接,将扩增后的DNA在Illumina平台上上机测序。本发明方法能够简单、高效的实现对cfDNA低频突变的检测,并可通过对cfDNA的检测,达到对胎儿遗传或者肿瘤细胞突变检测的目的。
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公开(公告)号:CN104640985A
公开(公告)日:2015-05-20
申请号:CN201380048308.7
申请日:2013-07-18
申请人: 恩比伊治疗有限公司
发明人: 乌尔夫·格劳乌德
CPC分类号: C12N15/1055 , C07K16/28 , C07K2317/14 , C07K2317/55 , C07K2317/56 , C07K2317/622 , C12N5/10 , C12N9/1241 , C12N15/1082 , G01N33/6854 , C12N15/1037 , C12Q2525/179
摘要: 在此公开的方法描述了一种前所未有地高效、灵活、实用和高速的用于探索和优化具有期望的结合特异性和/或功能性的多肽(包括抗原结合分子,例如抗体及其片段)以获得期望的功能性和/或结合性表型的新型科技。该新方法基于:转座结构和克隆入转座载体的多样化DNA文库,及其通过功能性转座酶的共同瞬态表达对宿主细胞进行转染。这保证了高效稳定地将基于转座子的表达载体一步引入脊椎动物宿主细胞,随后筛选所述细胞中表达的蛋白的期望功能性或结合性表型,然后可以通过标准的克隆和DNA测序技术,鉴定所述表达蛋白的相关编码序列,包括抗体及其片段。
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公开(公告)号:CN104093850A
公开(公告)日:2014-10-08
申请号:CN201380009386.6
申请日:2013-02-14
申请人: 通用电气公司
IPC分类号: C12P19/34
CPC分类号: C12P19/34 , C12Q1/6848 , C12Q1/6853 , C12Q2525/113 , C12Q2525/179 , C12Q2525/204 , C12Q2527/107 , C12Q2527/101
摘要: 本发明提供了用于核酸的有效扩增的方法和试剂盒。本公开主要涉及用于所关心的靶核酸的核酸扩增的试剂盒和方法。本文描述的方法通过在扩增过程中使用新的修饰引物,减少不需要的引物二聚体结构和嵌合核酸产物的产生而促进靶核酸(即,模板核酸)的合成。
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公开(公告)号:CN102257162A
公开(公告)日:2011-11-23
申请号:CN200980151070.4
申请日:2009-10-29
申请人: 波士顿大学理事会
CPC分类号: C12N15/66 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q2521/313 , C12Q2525/179 , C12Q2563/179
摘要: 本文描述了转化靶单链DNA(ssDNA)以便每个核苷酸(或碱基)腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)被转化成预定的寡核苷酸密码同时序列顺序在转化的ssDNA或RNA中得以保持的低成本高通量的方法。所述方法在循环过程中不需要使用DNA聚合酶并且涉及具有重复的连接和切割循环的寡核苷酸探针文库的用途。在每个循环中,切割例如ssDNA的靶的一端(例如,5′末端或3′末端)上的一个或多个核苷酸,然后将其与所述靶ssDNA的另一端上的相应寡核苷酸密码连接。
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公开(公告)号:CN101918596A
公开(公告)日:2010-12-15
申请号:CN200880125035.0
申请日:2008-11-24
申请人: 珀金埃尔默·拉斯公司
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6811 , C12Q1/6809 , C12Q1/6813 , C12Q1/6876 , Y10T436/143333 , C12Q2563/149 , C12Q2537/143 , C12Q2531/113 , C12Q2525/179 , C12Q2539/115
摘要: 本发明提供了一种针对染色体获得和丢失的编码小球多重分析,所述分析的益处是可将复杂的大型模板DNA来源(例如BAC DNA)作为探针材料,而没有小球交联或其他分析性能问题。本文描述了用于分析DNA的试剂,所述试剂含有连接有由模板DNA序列扩增得到的扩增子的多个编码颗粒。每个连接的扩增子均含有与模板DNA序列的一个随机部分相同的一段核酸序列,其中所述扩增子合在一起基本上代表完整的模板DNA,并且其中每个扩增子的与模板DNA序列的一个随机部分相同的核酸序列要比所述完整的模板DNA短。
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公开(公告)号:CN1644710A
公开(公告)日:2005-07-27
申请号:CN200410080630.0
申请日:2004-09-29
申请人: 艾本德股份有限公司
CPC分类号: C12Q1/689 , C12Q1/6837 , C12Q1/6876 , C12Q2600/156 , C12Q2565/519 , C12Q2525/179
摘要: 本发明涉及使用微阵列快速检测微生物β-内酰胺抗性的方法,和/或快速检测编码微生物β-内酰胺酶的核苷酸序列的方法,及其检测试剂盒。
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公开(公告)号:CN1106459A
公开(公告)日:1995-08-09
申请号:CN94117583.9
申请日:1994-10-26
申请人: 株式会社日立制作所
IPC分类号: C12P19/30
CPC分类号: G01N27/44743 , C12Q1/6837 , C12Q1/6874 , G01N27/447 , C12Q2535/101 , C12Q2525/179 , C12Q2565/537 , C12Q2525/191
摘要: 本发明的DNA片段的分级分离方法包括:第一步,制备各自固定了DNA探针的探针柱或一套探针柱,DNA探针由第一序列和第二序列组成,第一序列具有特定的已知序列和一部分酶识别序列,第二序列由邻近3′末端的第一序列的1至6个碱基的结合体组成;第二步,将DNA低聚物连到由限制酶酶切形成的DNA片段末端,DNA低聚物由一部分酶识别序列和与已知序列互补的序列组成;第三步,将探针柱或一套探针柱放到含有核苷酸片段的溶液中,核苷酸片段连有第二步产生的DNA低聚物,至少进行DNA探针的杂交和互补链延伸,由此DNA片段被分级分离。
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