合成性长阅读DNA测序
    3.
    发明公开

    公开(公告)号:CN106062209A

    公开(公告)日:2016-10-26

    申请号:CN201480068025.3

    申请日:2014-09-24

    申请人: STC.UNM公司

    发明人: J.S.爱德华兹

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本公开内容描述用于通过组装多个较短的多核苷酸阅读测序长DNA序列部分的方法。一般而言,所述方法包括退火多个引物与变性的DNA分子,在引物的5’末端附加条码多核苷酸,使DNA分子经受多个循环的(1)合并、(2)分开和(3)向引物的5’末端附加条码多核苷酸,测序条码多核苷酸和基因组DNA,以及组装具有同一的条码多核苷酸的短阅读多核苷酸序列。

    一种游离DNA文库构建方法以及游离DNA中低频突变的检测方法

    公开(公告)号:CN105821481A

    公开(公告)日:2016-08-03

    申请号:CN201610273808.6

    申请日:2016-04-28

    发明人: 田埂

    IPC分类号: C40B50/06 C12Q1/68

    摘要: 本发明涉及一种游离DNA的文库构建方法,在单链游离DNA的3’端连接唯一序列标签,其中,唯一序列标签由随机序列和接头序列组成;加入PCR扩增用上游引物和下游引物进行PCR扩增,其中,上游引物为针对目标低频突变设计的引物,下游引物为与接头序列对应的引物。此外,本发明还涉及一种游离DNA中低频突变的检测方法,在单链游离DNA的3’端连接唯一序列标签,加入PCR扩增用上游引物和下游引物进行PCR扩增,上游引物和下游引物的一端分别与测序标签连接,将扩增后的DNA在Illumina平台上上机测序。本发明方法能够简单、高效的实现对cfDNA低频突变的检测,并可通过对cfDNA的检测,达到对胎儿遗传或者肿瘤细胞突变检测的目的。

    保持序列的DNA转化
    7.
    发明公开

    公开(公告)号:CN102257162A

    公开(公告)日:2011-11-23

    申请号:CN200980151070.4

    申请日:2009-10-29

    发明人: A·梅勒 翁志萍

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/09

    摘要: 本文描述了转化靶单链DNA(ssDNA)以便每个核苷酸(或碱基)腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)被转化成预定的寡核苷酸密码同时序列顺序在转化的ssDNA或RNA中得以保持的低成本高通量的方法。所述方法在循环过程中不需要使用DNA聚合酶并且涉及具有重复的连接和切割循环的寡核苷酸探针文库的用途。在每个循环中,切割例如ssDNA的靶的一端(例如,5′末端或3′末端)上的一个或多个核苷酸,然后将其与所述靶ssDNA的另一端上的相应寡核苷酸密码连接。

    核苷酸片段的分级分离方法

    公开(公告)号:CN1106459A

    公开(公告)日:1995-08-09

    申请号:CN94117583.9

    申请日:1994-10-26

    IPC分类号: C12P19/30

    摘要: 本发明的DNA片段的分级分离方法包括:第一步,制备各自固定了DNA探针的探针柱或一套探针柱,DNA探针由第一序列和第二序列组成,第一序列具有特定的已知序列和一部分酶识别序列,第二序列由邻近3′末端的第一序列的1至6个碱基的结合体组成;第二步,将DNA低聚物连到由限制酶酶切形成的DNA片段末端,DNA低聚物由一部分酶识别序列和与已知序列互补的序列组成;第三步,将探针柱或一套探针柱放到含有核苷酸片段的溶液中,核苷酸片段连有第二步产生的DNA低聚物,至少进行DNA探针的杂交和互补链延伸,由此DNA片段被分级分离。