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11.发明专利
公开(公告)号：JP2013535203A
公开(公告)日：2013-09-12
申请号：JP2013521907
申请日：2011-07-26
发明人： オスターハウト，ロビン，イー． , バーガード，アンソニー，ピー． , ファーキャ，プリティ , バーク，マーク，ジェイ．
IPC分类号： C12N1/21 , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N15/09 , C12P5/02 , C12P7/04 , C12P7/22 , C12P7/40 , C12P7/62
摘要： 本発明は、トルエン、ベンゼン、ｐ−トルエート、テレフタレート、（２−ヒドロキシ−３−メチル−４−オキソブトキシ）ホスホネート、（２−ヒドロキシ−４−オキソブトキシ）ホスホネート、ベンゾエート、スチレン、２，４−ペンタジエノエート、３−ブテン−１オールまたは１，３−ブタジエン経路を有する、非天然に生じる微生物を提供する。 本発明はさらに、トルエン、ベンゼン、ｐ−トルエート、テレフタレート、（２−ヒドロキシ−３−メチル−４−オキソブトキシ）ホスホネート、（２−ヒドロキシ−４−オキソブトキシ）ホスホネート、ベンゾエート、スチレン、２，４−ペンタジエノエート、３−ブテン−１オールまたは１，３−ブタジエンを生産するためのそのような微生物を使用する方法を提供する。
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公开(公告)号：JP2013524853A
公开(公告)日：2013-06-20
申请号：JP2013509203
申请日：2011-05-04
发明人： バーク，マーク，ジェイ , ブルガード，アンソニー，ピー． , スン，ジュン , オステルハウト，ロビン，イー． , ファーキャ，プリティ
CPC分类号： C12P5/026 , C07C11/16 , C08F136/06 , C12N15/52
摘要： The invention provides non-naturally occurring microbial organisms having a butadiene pathway. The invention additionally provides methods of using such organisms to produce butadiene.
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公开(公告)号：JP2011519561A
公开(公告)日：2011-07-14
申请号：JP2011507667
申请日：2009-04-30
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： ロビン イー． オステラウト， , アンソニー ピー． バーガード， , マーク ジェイ． バーク， , プリティ ファルクヤ，
CPC分类号： C12P7/42 , C12N9/0008 , C12N9/1096 , C12N9/88 , C12N9/90 , C12P7/40 , C12Y102/01 , C12Y206/01022 , C12Y403/01 , C12Y504/99002
摘要： 本発明は、２−ヒドロキシイソ酪酸、３−ヒドロキシイソ酪酸またはメタクリル酸経路を有する、天然に存在しない微生物体を提供する。 微生物体は、２−ヒドロキシイソ酪酸、３−ヒドロキシイソ酪酸またはメタクリル酸経路中の酵素をコードする少なくとも１つの外因性核酸を含有する。 本発明は、２−ヒドロキシイソ酪酸、３−ヒドロキシイソ酪酸またはメタクリル酸を生成する方法をさらに提供する。 この方法は、十分な量で２−ヒドロキシイソ酪酸、３−ヒドロキシイソ酪酸またはメタクリル酸経路の酵素をコードする少なくとも１つの外因性核酸を発現する、２−ヒドロキシイソ酪酸、３−ヒドロキシイソ酪酸またはメタクリル酸を生成する微生物体を培養し、２−ヒドロキシイソ酪酸、３−ヒドロキシイソ酪酸またはメタクリル酸を生成する条件下およびそれに十分な期間培養することを含むことができる。
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公开(公告)号：JP2011515111A
公开(公告)日：2011-05-19
申请号：JP2011502115
申请日：2009-03-27
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： ロビン イー． オステラウト， , アンソニー ピー． バーガード， , プリティ ファルクヤ，
CPC分类号： C12N15/52 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/001 , C12N9/1029 , C12N9/1096 , C12N9/80 , C12N9/88 , C12P7/44 , C12P7/46 , C12P7/62 , C12P13/001 , C12P13/005 , C12P13/02 , C12P17/10 , C12Y101/01035 , C12Y102/0101 , C12Y103/01031 , C12Y206/01 , C12Y402/01
摘要： 本発明は、アジペート、６−アミノカプロン酸またはカプロラクタム経路を有する天然に存在しない微生物を提供する。 当該微生物は、そのそれぞれのアジペート、６−アミノカプロン酸またはカプロラクタム経路に酵素をコードする少なくとも１つの外因性核酸を含有する。 加えて、本発明は、アジペート、６−アミノカプロン酸またはカプロラクタムを生産するための方法を提供する。 この方法は、アジペート、６−アミノカプロン酸またはカプロラクタム生産性微生物であって、アジペート、６−アミノカプロン酸またはカプロラクタム経路酵素をコードする少なくとも１つの外因性核酸をそのそれぞれの産物の生産に十分な量で発現するものである上記微生物を、アジペート、６−アミノカプロン酸またはカプロラクタムを生産する条件下でおよび十分な期間にわたって培養することを含み得る。
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公开(公告)号：JP2010521182A
公开(公告)日：2010-06-24
申请号：JP2009553836
申请日：2008-03-14
发明人： ウェイ ニュー， , アンソニー バーガード， , マーク ジェイ． バーク， , ディーン， スティーブン ジェイ． バン
CPC分类号： C12N15/52 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/88 , C12N9/93 , C12N15/70 , C12N15/81 , C12P7/18 , C12P7/42 , C12P7/52 , C12P17/04 , C12Y101/01061 , C12Y102/01076 , C12Y401/01071 , C12Y602/01004 , Y02P20/52
摘要： 本発明は、４−ヒドロキシブタン酸脱水素酵素、スクシニル−ＣｏＡ合成酵素、ＣｏＡ依存性コハク酸セミアルデヒド脱水素酵素、またはα−ケトグルタル酸脱炭酸酵素をコードする少なくとも１つの外因性核酸を有する４−ヒドロキシブタン酸（４−ＨＢ）生合成経路を有する微生物を含む天然に存在しない微生物生体触媒を提供し、ここで、外因性核酸は、単量体４−ヒドロキシブタン酸（４−ＨＢ）を生産するのに十分な量で発現される。 また、４−ヒドロキシブタン酸（４−ＨＢ）および１，４−ブタンジオール（ＢＤＯ）生合成経路を有する微生物を含む天然に存在しない微生物生体触媒が提供され、この経路は、４−ヒドロキシブタン酸脱水素酵素、スクシニル−ＣｏＡ合成酵素などをコードする少なくとも１つの外因性核酸を含み、ここで、外因性核酸は、１，４−ブタンジオール（ＢＤＯ）を生産するのに十分な量で発現される。
摘要翻译： 本发明提供了一种非天然存在的微生物生物催化剂，其包括具有4-羟基丁酸（4-HB）生物合成途径的微生物生物，其具有至少一种编码4-羟基丁酸脱氢酶的外源核酸，琥珀酰辅酶A合成酶，CoA依赖性琥珀酸半醛 脱氢酶或± - 酮戊二酸脱羧酶，其中外源核酸以足够的量表达以产生单体4-羟基丁酸（4-HB）。 还提供了非天然存在的微生物生物催化剂，其包括具有4-羟基丁酸（4-HB）和1,4-丁二醇（BDO）生物合成途径的微生物生物，该途径包括至少一种编码4-羟基丁酸脱氢酶的外源核酸 ，琥珀酰辅酶A合成酶，CoA依赖性琥珀酸半醛脱氢酶，4-羟基丁酸酯：CoA转移酶，4-丁酸酯激酶，磷酸转磷酸化酶，± - 酮戊二酸脱羧酶，醛脱氢酶，醇脱氢酶或醛/醇脱氢酶，其中外源核酸为 以足够的量表示产生1,4-丁二醇（BDO）。 另外提供了生产4-HB的方法。 该方法包括培养具有4-羟基丁酸（4-HB）生物合成途径的非天然存在的微生物生物，其包含至少一种编码4-羟基丁酸脱氢酶的外源核酸，琥珀酰辅酶A合成酶，CoA依赖性琥珀酸半醛脱氢酶或± - 酮戊二酸脱羧酶在充分的厌氧条件下持续足够的时间以产生单体4-羟基丁酸（4-HB）。 还提供了用于生产BDO的方法。 该方法包括培养非天然存在的微生物生物催化剂，其包含具有4-羟基丁酸（4-HB）和1,4-丁二醇（BDO）生物合成途径的微生物生物，该途径包括至少一种编码4- 羟基丁酸脱氢酶，琥珀酰-CoA合成酶，CoA依赖性琥珀酸半醛脱氢酶，4-羟基丁酸酯：CoA转移酶，4-羟基丁酸酯激酶，磷酸转移羟基丁酸酶，± - 酮戊二酸脱羧酶，醛脱氢酶，醇脱氢酶或醛/醇脱氢酶， 时间来生产1,4-丁二醇（BDO）。 4-HB和/或BDO产物可以分泌到培养基中。
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公开(公告)号：JP2009514062A
公开(公告)日：2009-04-02
申请号：JP2008523048
申请日：2006-07-21
发明人： クリストファー エイチ． シリング， , イマンドクト ファミリ，
CPC分类号： G06F19/12 , G01N33/5008 , G01N2500/10 , G06F19/18 , G06F19/28 , G06F19/704
摘要： 本発明は、ホモ・サピエンスゲノム中の遺伝子間の相互結合およびそれらに関連する反応および作用物質を記載するイン・シリコモデルを提供する。 また、本発明は、細胞内の異なる生化学ネットワークの間の、ならびに細胞間の相互結合を記載するイン・シリコモデルも提供する。 細胞間の異なる生化学ネットワーク内の相互結合は、例えば、異なる位置、組織、器官内の細胞を含めた細胞の群の間の、あるいは多細胞生物の異なる機能を行う細胞間の相互作用を記載することができる。 従って、該モデルを用いて、ヒト細胞を含めた多細胞生物に由来する細胞の細胞挙動の異なる態様を刺激することができ、ならびにそれを用いて、細胞の群の細胞挙動相互作用の異なる態様を刺激することができる。
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公开(公告)号：JP2021180678A
公开(公告)日：2021-11-25
申请号：JP2021131594
申请日：2021-08-12
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： デル カーデイレ スティーブン ビー. , シャーマー アンドレアス ダブリュ. , コ ミョン , ワン ハイボ
IPC分类号： C12N15/53 , C12N15/54 , C12N15/55 , C12N9/02 , C12N9/10 , C12N9/16 , C12N1/00 , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N1/21 , C12N5/10 , C07D309/30 , C07D307/33 , C07D313/00 , C12P7/64
摘要： 【課題】芳香剤に用いられる化合物を含む産業的価値のある化合物を得るための、微生物による有機中間体の生産とその後の合成変換とを組合せたプロセスを提供する。 【解決手段】以下を含む、芳香剤成分を作り出すための化学酵素的プロセス:代謝改変を含む組換え微生物を培養する段階であって、該微生物が、少なくとも1種類の脂肪酸誘導体をインビボで産生し、該培養が、炭素系の原料とともに行われる、段階;およびラクトンまたは大環状ケトンを生成させるのに十分な条件下で、該脂肪酸誘導体を試薬とエクスビボで接触させる段階。 【選択図】なし
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公开(公告)号：JP2021177785A
公开(公告)日：2021-11-18
申请号：JP2021133752
申请日：2021-08-19
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： デル カーデイレ スティーブン ビー. , ホム ルイス ジー.
IPC分类号： C12N1/21 , C12N1/19 , C12N1/15 , C12N1/13 , C12N1/20 , C12P13/02 , C12N15/53 , C12N15/31 , C12N15/55 , C12N15/54
摘要： 【課題】脂肪アミンおよびその誘導体の生産のための組換え微生物の提供。 【解決手段】脂肪アルデヒドを脂肪アミンに変換するための遺伝子操作された代謝経路を含む、脂肪アミンの生産のための組換え微生物であって、該代謝経路が、アミノトランスフェラーゼ活性またはアミンデヒドロゲナーゼ活性を有する外因性生合成酵素を含む、インビボで脂肪アミンを産生する該微生物。 【選択図】なし
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公开(公告)号：JP6926143B2
公开(公告)日：2021-08-25
申请号：JP2019084119
申请日：2019-04-25
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： リュード マシュー , トリン ナ , シルマー アンドレアス , ガーノ ジェーコブ
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公开(公告)号：JP2021098720A
公开(公告)日：2021-07-01
申请号：JP2021034513
申请日：2021-03-04
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
IPC分类号： C07D223/10
摘要： 【課題】生化学的に調製された6−アミノカプロン酸(6−ACA)からε−カプロラクタム(カプロラクタム)を調製するための方法を提供する。 【解決手段】バイオマスを含む培地から6−アミノカプロン酸を含む混合物を回収し、その後、過熱蒸気の存在下で6−アミノカプロン酸を環化し、それによってカプロラクタムを形成させるカプロラクタムの調製方法であって、前記混合物中の炭水化物と6−アミノカプロン酸との重量比が0.03以下である、調製方法とする。 【選択図】なし
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