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公开(公告)号：JP2014211907A
公开(公告)日：2014-11-13
申请号：JP2014146551
申请日：2014-07-17
摘要： 【課題】ヒト骨格筋細胞を含むヒト細胞の生理学的機能を決定するための、コンピューター内モデルを提供すること。【解決手段】このモデルは、複数のHomo sapiens反応を示すデータ構造、複数のHomo sapiens反応の束縛セット、およびHomo sapiens生理学的機能を予測可能な反応を介して流束の分布を決定するためのコマンドを、含む。本発明のモデルは、関連の遺伝子を特徴付ける情報を含む遺伝子データベースを、さらに含み得る。調節されたHomo sapiens反応は、本発明のモデルにおいて、調節反応に関する可変束縛を含むことによって、表され得る。本発明は、本発明のモデルを使用してコンピューター内Homo sapiens生理学的機能を作製するための方法を、さらに提供する。【選択図】図1
摘要翻译： 要解决的问题：提供用于确定人类细胞（包括人类骨骼肌细胞）的生理功能的计算机模型。解决方案：模型包括指示多个智人反应的数据结构，对于多个智人的约束集 反应和用于确定通过预测人类生理功能的反应的通量分布的命令。 本发明的模型还可以包括含有表征相关基因的信息的基因数据库。 调节的智人反应可以通过包括调节反应的可变约束在本发明的模型中表示。 本发明进一步提供了使用本发明的模型制备计算机智人生理功能的方法。
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公开(公告)号：JP2021176340A
公开(公告)日：2021-11-11
申请号：JP2021129428
申请日：2021-08-06
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： シャーマー アンドリアス ダブリュ. , ワン ハイボ , デル カーダイレ スティーブン ビー. , フー チーハオ , ホム ルイス ジー. , チュー バオロン , チャン シンディ , ポポヴァ エマニュエラ イー.
摘要： 【課題】ω-ヒドロキシル化脂肪酸誘導体生産方法を提供する。 【解決手段】(a)EC 3.1.2.-、3.1.1.5、もしくは3.1.2.14のチオエステラーゼ;またはEC 2.3.1.75もしくはEC 2.3.1.20のエステルシンターゼ;および(b)EC 1.14.15.3の改変されたω-ヒドロキシラーゼを含むポリペプチドをコードする少なくとも2つの核酸配列を発現するように操作された経路を含む、再生可能な原料由来の炭素源の存在下において発酵ブロス中で増殖させた場合にインビボでω-ヒドロキシ脂肪酸誘導体を産生させるための組換え微生物を提供する。 【選択図】なし
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3.发明专利
公开(公告)号：JP2021528977A
公开(公告)日：2021-10-28
申请号：JP2020572692
申请日：2019-06-26
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： ナガラジャン,ハリシュ , ヤン,テ,フン , コダヤリ,アリ
摘要： 本明細書では、G3Pを3PG(例えば、B. methanolicus gapN)および/またはフルクトース−1,6−ビスホスファターゼに変換することができるNADH依存性酵素、ならびに/またはヘキスロース−6−リン酸シンターゼ、6−ホスホ−3−ヘキスロースイソメラーゼ、ホスホケトラーゼ、またはそれらの組み合わせを含む合成メチロトロフィーを有するものを含む、組換え細胞を記載する。本開示の組換え細胞はリン酸化されたC3および/またはC4化合物の適切なプールサイズを有益に維持し、そして/またはNADPHの増加したレベルを提供する。そのようなものとして、改変はC1(例えば、メタノール供給原料)およびC5化合物からのC6化合物の生成、炭素転位によるC6化合物からのC5化合物の再生、ならびにC5化合物の再生とより低い解糖との間の改善されたバランスを可能にする。次に、これにより、組換え微生物はバイオプロダクト経路で使用することができる十分な量の代謝前駆体(例えば、アセチルCoA)を生成することができ、操作された細胞は、所望のバイオプロダクトの生成を可能にするこれらの経路酵素に対するさらなる改変を含むことができる。
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公开(公告)号：JP6933971B2
公开(公告)日：2021-09-08
申请号：JP2017241266
申请日：2017-12-18
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： コ ミョン ケイ. , ワン ハイボ , コール パトリシア ジェイ. , リャオ ペリー ワイ. , リ シモン
IPC分类号： C07C31/125 , C12P7/04 , C07C29/80
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公开(公告)号：JP6931107B2
公开(公告)日：2021-09-01
申请号：JP2020049039
申请日：2020-03-19
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： デル カーデイレ スティーブン ビー. , シャーマー アンドレアス ダブリュ. , コ ミョン , ワン ハイボ
IPC分类号： C12P7/64 , C12P7/62 , C07D313/00 , C12P17/08
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公开(公告)号：JP2018046861A
公开(公告)日：2018-03-29
申请号：JP2017254172
申请日：2017-12-28
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： マーク ジェイ. バーク , スティーブン ジェイ. バン ディーン , アンソニー バーガード , ウェイ ニュー
CPC分类号： C12N15/52 , B01D3/002 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/88 , C12N9/93 , C12N15/70 , C12N15/81 , C12P7/18 , C12P7/42 , C12P7/52 , C12P17/04 , C12Y101/01061 , C12Y102/01076 , C12Y401/01071 , C12Y602/01004 , Y02P20/52
摘要： 【課題】1,4−ブタンジオールおよびその前駆体の生合成のための組成物および方法の提供。 【解決手段】本発明は、4−ヒドロキシブタン酸脱水素酵素、スクシニル−CoA合成酵素、CoA依存性コハク酸セミアルデヒド脱水素酵素、またはα−ケトグルタル酸脱炭酸酵素をコードする少なくとも1つの外因性核酸を有する4−ヒドロキシブタン酸(4−HB)生合成経路を有する微生物を含む天然に存在しない微生物生体触媒を提供し、ここで、外因性核酸は、単量体4−ヒドロキシブタン酸(4−HB)を生産するのに十分な量で発現される。 【選択図】なし
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公开(公告)号：JP2017214358A
公开(公告)日：2017-12-07
申请号：JP2017092480
申请日：2017-05-08
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
IPC分类号： C07D223/10 , C12P13/02 , C07D201/16
CPC分类号： C07D201/08 , C07D201/16 , C07D223/10 , C08G69/16
摘要： 【課題】生化学的プロセスで得られた6−アミノカプロン酸から、カプロラクタムを形成させる新規の調製法の提供。 【解決手段】バイオマスを含む培地であって、1種または複数種の炭水化物を含んでいてもよい培地から6−アミノカプロン酸を含む混合物を回収することと、その後、過熱蒸気の存在下で前記6−アミノカプロン酸を環化し、それによってカプロラクタムを形成させることとを含むカプロラクタムの調製方法であって、前記混合物が、少なくとも2重量%の、水及び6−アミノカプロン酸を除く残留成分を含む、方法。 【選択図】なし
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公开(公告)号：JP6175912B2
公开(公告)日：2017-08-09
申请号：JP2013117830
申请日：2013-06-04
申请人： 三菱ケミカル株式会社 , ジェノマティカ, インコーポレイテッド
CPC分类号： C08G63/80 , C08G63/183 , C08G63/78 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/93 , C12P7/18 , C12Y101/01061 , C12Y102/01024 , C12Y102/04002 , C12Y602/01004 , Y02P20/52
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公开(公告)号：JP2017060518A
公开(公告)日：2017-03-30
申请号：JP2016235414
申请日：2016-12-02
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： オスターハウト,ロビン,イー. , バーガード,アンソニー,ピー. , ファーキャ,プリティ , バーク,マーク,ジェイ.
摘要： 【課題】トルエン、ベンゼン、p−トルエート、テレフタレート、(2−ヒドロキシ−3−メチル−4−オキソブトキシ)ホスホネート、(2−ヒドロキシ−4−オキソブトキシ)ホスホネート、ベンゾエート、スチレン、2,4−ペンタジエノエート、3−ブテン−1オールまたは1,3−ブタジエン生合成能を有する微生物の提供。 【解決手段】外因性核酸を含む(2−ヒドロキシ−3−メチル−4−オキソブトキシ)ホスホネート(2H3M4OP)経路、p−トルエート経路、テレフタレート経路、(2−ヒドロキシ−4−オキソブトキシ)ホスホネート(2H4OP)経路及び/又はベンゾエート経路を有する非天然に生じる微生物。 【選択図】図1
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公开(公告)号：JP2016192974A
公开(公告)日：2016-11-17
申请号：JP2016124920
申请日：2016-06-23
申请人： ジェノマティカ, インコーポレイテッド
发明人： バーク,マーク,ジェイ. , ブルガード,アンソニー,ピー. , スン,ジュン , オステルハウト,ロビン,イー. , ファーキャ,プリティ
CPC分类号： C12P5/02 , C07C1/24 , C12N15/52 , C12P5/026 , C12P7/04 , C07C2521/04 , C07C2521/12 , C07C2521/16 , C07C2523/10 , C07C2523/28 , C07C2523/31 , C07C2523/745 , C07C2527/167 , C07C2527/173 , Y02E50/343
摘要： 【課題】ブタジエンの生産法の提供。 【解決手段】クロチルアルコール経路遺伝子を含む非天然微生物を十分な量の栄養および培地中で発酵培養し、非天然微生物の培養により生産されたクロチルアルコールを触媒存在下において化学的にブタジエンへ変換する。 【選択図】図2
摘要翻译： 要解决的问题：提供生产丁二烯的方法。方法：该方法包括通过发酵培养足够量的营养物和培养基，包含非天然存在的微生物，其包含巴豆醇途径基因和转化巴豆醇， 通过在非催化剂存在下将非天然存在的微生物生物培养成丁二烯
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