公开(公告)号：US20120301881A1

公开(公告)日：2012-11-29

申请号：US13522224

申请日：2011-01-20

申请人： Zhenyu Zhu ,  Yu Zheng ,  Shengxi Guan ,  Hua Wang ,  Aine Quimby ,  Penghua Zhang ,  Lynne Apone

发明人： Zhenyu Zhu ,  Yu Zheng ,  Shengxi Guan ,  Hua Wang ,  Aine Quimby ,  Penghua Zhang ,  Lynne Apone

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N9/16

CPC分类号： C12N9/22 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q2521/331

摘要： Compositions, methods and a kit are described relating to a novel family of enzymes which preferentially bind to a hydroxymethylated cytosine or a glucosylated hydroxymethylated cytosine and cleave double-stranded DNA at a defined distance 3′ of the recognition site to produce a cleavage fragment with a 1-3 base overhang.

摘要翻译： 描述了组合物，方法和试剂盒，其涉及一种新型家族的酶，其优先结合羟甲基化的胞嘧啶或葡糖基化的羟甲基化的胞嘧啶，并在识别位点的3'的限定距离处切割双链DNA以产生具有 1-3基础突出。

公开(公告)号：US20230033390A1

公开(公告)日：2023-02-02

申请号：US17391727

申请日：2021-08-02

申请人： Yang Xiang ,  Alexa Vahey ,  Aine Quimby

发明人： Yang Xiang ,  Alexa Vahey ,  Aine Quimby

IPC分类号： C12M3/06 ,  C12M1/34

摘要： Disclosed is a device for angling a multi-well plate during shaking on a typical low speed laboratory incubator-shaker to facilitate cell growth. An assembly with a holder for a deep-well multi-well plate to attach it to a base has an adjustable-angle joint. The base is attached to a conventional incubator shaker tray via screws or a sticky pad. The adjustable-angle joint allows maintaining the desired angle of the plate, even at full shaking speed.

公开(公告)号：US08969061B2

公开(公告)日：2015-03-03

申请号：US13522224

申请日：2011-01-20

申请人： Zhenyu Zhu ,  Yu Zheng ,  Shengxi Guan ,  Hua Wang ,  Aine Quimby ,  Penghua Zhang ,  Lynne Apone

发明人： Zhenyu Zhu ,  Yu Zheng ,  Shengxi Guan ,  Hua Wang ,  Aine Quimby ,  Penghua Zhang ,  Lynne Apone

IPC分类号： C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/34 ,  C12N9/00 ,  C12N9/22

CPC分类号： C12N9/22 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q2521/331

摘要： Compositions, methods and a kit are described relating to a novel family of enzymes which preferentially bind to a hydroxymethylated cytosine or a glucosylated hydroxymethylated cytosine and cleave double-stranded DNA at a defined distance 3′ of the recognition site to produce a cleavage fragment with a 1-3 base overhang.

摘要翻译： 描述了组合物，方法和试剂盒，其涉及一种新型家族的酶，其优先结合羟甲基化的胞嘧啶或葡糖基化的羟甲基化的胞嘧啶，并在识别位点的3'的限定距离处切割双链DNA以产生具有 1-3基础突出。

公开(公告)号：US20120088237A1

公开(公告)日：2012-04-12

申请号：US13202851

申请日：2010-03-04

申请人： Zhenyu Zhu ,  Shengxi Guan ,  Aine Quimby

发明人： Zhenyu Zhu ,  Shengxi Guan ,  Aine Quimby

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N9/16 ,  C12N1/21 ,  C12N15/55 ,  C12N15/63

CPC分类号： C12N9/22

摘要： A restriction endonuclease is provided that has been engineered to have a cleavage specificity for a DNA recognition sequence containing a modified nucleotide. Methods for engineering enzymes to cleave DNA containing modified nucleotides at specific sequences are provided.

摘要翻译： 提供了限制性内切核酸酶，其被工程化以具有对含有修饰的核苷酸的DNA识别序列的切割特异性。 提供了用于以特定序列切割含有修饰的核苷酸的DNA的工程酶的方法。

公开(公告)号：US08637291B2

公开(公告)日：2014-01-28

申请号：US13022561

申请日：2011-02-07

申请人： Zhenyu Zhu ,  Aine Quimby ,  Shengxi Guan ,  Dapeng Sun ,  Yishu Huang ,  Xuhui Lai ,  Siu-hong Chan ,  Xianghui Li ,  Shuang-Yong Xu ,  Chunhua Zhang

发明人： Zhenyu Zhu ,  Aine Quimby ,  Shengxi Guan ,  Dapeng Sun ,  Yishu Huang ,  Xuhui Lai ,  Siu-hong Chan ,  Xianghui Li ,  Shuang-Yong Xu ,  Chunhua Zhang

IPC分类号： C12N9/22

CPC分类号： C12N9/22 ,  C12N9/16 ,  C12Q1/34 ,  C12Q1/44 ,  C12Q1/68 ,  C12Y301/21004 ,  G01N2333/916 ,  G01N2333/922

摘要： Methods and compositions are provided for engineering mutant enzymes with reduced star activity where the mutant enzymes have a fidelity index (FI) in a specified buffer that is greater than the FI of the non-mutated enzyme in the same buffer.

摘要翻译： 提供了用于工程化具有降低的星形活性的突变酶的方法和组合物，其中突变酶在特定缓冲液中具有比同一缓冲液中非突变酶的FI高的保真度指数（FI）。

公开(公告)号：US20110151450A1

公开(公告)日：2011-06-23

申请号：US13022561

申请日：2011-02-07

申请人： Zhenyu Zhu ,  Aine Quimby ,  Shengxi Guan ,  Dapeng Sun ,  Yishu Huang ,  Xuhui Lai ,  Siu-hong Chan ,  Xianghui Li ,  Shuang-Yong Xu ,  Chunhua Zhang

发明人： Zhenyu Zhu ,  Aine Quimby ,  Shengxi Guan ,  Dapeng Sun ,  Yishu Huang ,  Xuhui Lai ,  Siu-hong Chan ,  Xianghui Li ,  Shuang-Yong Xu ,  Chunhua Zhang

IPC分类号： C12N9/16 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/22 ,  C12N9/16 ,  C12Q1/34 ,  C12Q1/44 ,  C12Q1/68 ,  C12Y301/21004 ,  G01N2333/916 ,  G01N2333/922

摘要： Methods and compositions are provided for engineering mutant enzymes with reduced star activity where the mutant enzymes have a fidelity index (FI) in a specified buffer that is greater than the FI of the non-mutated enzyme in the same buffer.

摘要翻译： 提供了用于工程化具有降低的星形活性的突变酶的方法和组合物，其中突变酶在特定缓冲液中具有比同一缓冲液中非突变酶的FI高的保真度指数（FI）。