公开(公告)号：US20110104682A1

公开(公告)日：2011-05-05

申请号：US12898490

申请日：2010-10-05

申请人： Hatim Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, JR. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, JR. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N9/14

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/683 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明提供了用于切割和修饰核酸的新型切割剂和聚合酶。 裂解剂和聚合酶可用于例如核酸序列的检测和表征以及核酸序列的变化。 在一些实施方案中，使用各种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US08063184B2

公开(公告)日：2011-11-22

申请号：US12898490

申请日：2010-10-05

申请人： Hatim Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C07K14/00 ,  C12N15/00

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/683 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

公开(公告)号：US20080293046A1

公开(公告)日：2008-11-27

申请号：US11642815

申请日：2006-12-19

申请人： Hatim Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, JR. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, JR. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/11 ,  C12N15/00 ,  C12N5/06 ,  C07K14/00

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/683 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明提供了用于切割和修饰核酸的新型切割剂和聚合酶。 裂解剂和聚合酶可用于例如核酸序列的检测和表征以及核酸序列的变化。 在一些实施方案中，使用各种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US20090142754A1

公开(公告)日：2009-06-04

申请号：US11929404

申请日：2007-10-30

申请人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/00 ,  C12N15/11 ,  C12N15/00 ,  C12N5/06 ,  C07K14/00

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/683 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明提供了用于切割和修饰核酸的新型切割剂和聚合酶。 裂解剂和聚合酶可用于例如核酸序列的检测和表征以及核酸序列的变化。 在一些实施方案中，使用各种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US07150982B2

公开(公告)日：2006-12-19

申请号：US10084839

申请日：2002-02-26

申请人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C12N9/22

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q1/6827 ,  H04L29/06 ,  H04L29/06027 ,  H04L69/32 ,  C12Q2561/109 ,  C12Q2537/162 ,  C12Q2525/161

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

公开(公告)号：US07935800B2

公开(公告)日：2011-05-03

申请号：US11642815

申请日：2006-12-19

申请人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  WuPo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C07H21/02 ,  C12Q1/68 ,  C07K1/00

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/683 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明提供了用于切割和修饰核酸的新型切割剂和聚合酶。 裂解剂和聚合酶可用于例如核酸序列的检测和表征以及核酸序列的变化。 在一些实施方案中，使用各种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US07807806B2

公开(公告)日：2010-10-05

申请号：US11929404

申请日：2007-10-30

申请人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  Wupo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

发明人： Hatim T. Allawi ,  Brad T. Argue ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Lin Ji ,  Michael W. Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  Natalie E. Lyamicheva ,  Wupo Ma ,  Bruce P. Neri ,  Sarah M. Olson ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  James J. Schaefer ,  Zbigniev Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Lisa C. Thompson ,  Kevin L. Vedvik

IPC分类号： C07H21/04 ,  C07K14/00

CPC分类号： C12Q1/6823 ,  C12N9/1252 ,  C12N9/22 ,  C12Q1/683 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明提供了用于切割和修饰核酸的新型切割剂和聚合酶。 裂解剂和聚合酶可用于例如核酸序列的检测和表征以及核酸序列的变化。 在一些实施方案中，使用各种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US07045289B2

公开(公告)日：2006-05-16

申请号：US09864636

申请日：2001-05-24

申请人： Hatim Allawi ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  WuPo Ma ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  Sarah M. Olson ,  James J. Schaefer ,  Zbigniew Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Kevin L. Vedvik ,  Natalie Lyamichev ,  Bruce P. Neri

发明人： Hatim Allawi ,  Christian Tor Bartholomay ,  LuAnne Chehak ,  Michelle L. Curtis ,  Peggy S. Eis ,  Jeff G. Hall ,  Hon S. Ip ,  Michael Kaiser ,  Robert W. Kwiatkowski, Jr. ,  Andrew A. Lukowiak ,  Victor Lyamichev ,  WuPo Ma ,  Marilyn C. Olson-Munoz ,  Sarah M. Olson ,  James J. Schaefer ,  Zbigniew Skrzypczynski ,  Tsetska Y. Takova ,  Kevin L. Vedvik ,  Natalie Lyamichev ,  Bruce P. Neri

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/22 ,  C12N9/1252 ,  C12Q1/6823 ,  C12Q1/683 ,  H04L29/06 ,  H04L29/06027 ,  H04L69/32 ,  C12Q2561/109

摘要： The present invention provides novel cleavage agents and polymerases for the cleavage and modification of nucleic acid. The cleavage agents and polymerases find use, for example, for the detection and characterization of nucleic acid sequences and variations in nucleic acid sequences. In some embodiments, the 5′ nuclease activity of a variety of enzymes is used to cleave a target-dependent cleavage structure, thereby indicating the presence of specific nucleic acid sequences or specific variations thereof.

摘要翻译： 本发明提供了用于切割和修饰核酸的新型切割剂和聚合酶。 裂解剂和聚合酶可用于例如核酸序列的检测和表征以及核酸序列的变化。 在一些实施方案中，使用各种酶的5'核酸酶活性来切割靶依赖性切割结构，从而指示特异性核酸序列的存在或其特定变体。

公开(公告)号：US20120059594A1

公开(公告)日：2012-03-08

申请号：US13196882

申请日：2011-08-02

申请人： Eli Hatchwell ,  Peggy S. Eis

发明人： Eli Hatchwell ,  Peggy S. Eis

IPC分类号： G06F19/00 ,  C12Q1/68 ,  C40B30/00 ,  C40B30/04

CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/16 ,  G06F19/18 ,  G06F19/24 ,  C12Q2537/16 ,  C12Q2537/165

摘要： The compositions and methods provided herein allow for identification of causative genetic biomarkers for a disease condition or drug response.

摘要翻译： 本文提供的组合物和方法允许鉴定疾病状况或药物反应的致病遗传生物标志物。

公开(公告)号：US07700288B2

公开(公告)日：2010-04-20

申请号：US11352837

申请日：2006-02-13

申请人： James E. Dahlberg ,  Peggy S. Eis ,  Wayne Tam ,  Elsebet Lund

发明人： James E. Dahlberg ,  Peggy S. Eis ,  Wayne Tam ,  Elsebet Lund

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： G01N33/5052 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/136 ,  C12Q2600/178 ,  G01N33/5091 ,  G01N33/57426

摘要： The invention provides methods for diagnosing B-cell lymphoma in an animal. In particular, the invention provides methods for distinguishing an animal having diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) with an activated B-cell (ABC) phenotype from an animal having DLBCL with a non-activated germinal-center (GC) phenotype. The invention also provides methods for identifying compounds for treating B-cell lymphoma. The invention further provides reagents and methods for determining the amount of miR-155 in sample isolated from an animal. In this regard, the invention provides a set of oligonucleotides for determining the amount of miR-155 in sample isolated from an animal.

摘要翻译： 本发明提供了用于诊断动物中B细胞淋巴瘤的方法。 特别地，本发明提供了从具有非活化生发中心（GC）表型的DLBCL的动物区分具有弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的动物与活化的B细胞（ABC）表型的方法。 本发明还提供鉴定用于治疗B细胞淋巴瘤的化合物的方法。 本发明还提供用于测定从动物分离的样品中miR-155的量的试剂和方法。 在这方面，本发明提供了一组用于确定从动物分离的样品中miR-155的量的寡核苷酸。