公开(公告)号：US08703461B2

公开(公告)日：2014-04-22

申请号：US13600416

申请日：2012-08-31

申请人： Marian Peris ,  Michael Phelan ,  Barnett Rosenblum ,  Stephen Hendricks

发明人： Marian Peris ,  Michael Phelan ,  Barnett Rosenblum ,  Stephen Hendricks

IPC分类号： C12N9/12

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6804 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6872 ,  C12Y207/07007 ,  G01N2500/00 ,  C12Q2565/632 ,  C12Q2563/137 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2565/30 ,  C12Q2537/157

摘要： Provided herein are mutant DNA-dependent polymerases which are derived from, or otherwise related to, wild type RB69 DNA polymerase. These mutant polymerases are capable of selectively binding labeled nucleotides. These mutant polymerases are also capable of incorporating a variety of naturally occurring and modified nucleotides, including, for example, terminator nucleotides.

摘要翻译： 本文提供了衍生自野生型RB69 DNA聚合酶或与野生型RB69 DNA聚合酶相关的突变型DNA依赖性聚合酶。 这些突变型聚合酶能够选择性地结合标记的核苷酸。 这些突变型聚合酶还能够掺入多种天然存在和修饰的核苷酸，包括例如终止子核苷酸。

公开(公告)号：US20110159551A1

公开(公告)日：2011-06-30

申请号：US12900794

申请日：2010-10-08

申请人： Lei (a.k.a Larry) Xi ,  Roland Nagel ,  Stephen Hendricks ,  Jennifer Berkman ,  Marian Peris ,  Yulei Wang

发明人： Lei (a.k.a Larry) Xi ,  Roland Nagel ,  Stephen Hendricks ,  Jennifer Berkman ,  Marian Peris ,  Yulei Wang

IPC分类号： C12P19/34 ,  C12N9/10

CPC分类号： C12N9/1276 ,  C12N15/1096 ,  C12Q2521/107 ,  C12Y207/07049

摘要： The present invention provides compositions and methods for a reverse transcription reaction using a reversibly inactivated reverse transcriptase enzyme. The reversibly inactivated reverse transcriptase enzyme results from a chemical modification which inactivates the reverse transcriptase enzyme. The activity of the reverse transcriptase enzyme is recovered by an incubation of the reaction mixture at elevated temperature prior to, or as part of the reverse transcription reaction. The reverse transcriptase enzyme of the present invention provides for a signficant reduction in non-specific reverse transcription from template nucleic acid molecules because the formulation of the reaction mixture does not support the formation of reverse transcription products prior to activation of the reverse transcriptase.

摘要翻译： 本发明提供使用可逆失活的逆转录酶进行逆转录反应的组合物和方法。 可逆灭活的逆转录酶由化学修饰产生，其使逆转录酶失活。 通过在反转录反应之前或作为逆转录反应的一部分的升高温度下温育反应物来回收逆转录酶的活性。 本发明的逆转录酶提供了明显减少模板核酸分子的非特异性逆转录，因为反应混合物的配方不支持在逆转录酶激活之前形成逆转录产物。

公开(公告)号：US08632975B2

公开(公告)日：2014-01-21

申请号：US12790760

申请日：2010-05-28

申请人： Peter B. Vander Horn ,  Cheng-Yao Chen ,  Guobin Luo ,  Michael Previte ,  Jamshid Temirov ,  Theo Nikiforov ,  Zhaohui Zhou ,  Hongye Sun ,  Yufang Wang ,  Stefanie Yukiko Nishimura ,  Hongyi Wang ,  Marian Peris ,  Barnett B. Rosenblum ,  Michael Phelan

发明人： Peter B. Vander Horn ,  Cheng-Yao Chen ,  Guobin Luo ,  Michael Previte ,  Jamshid Temirov ,  Theo Nikiforov ,  Zhaohui Zhou ,  Hongye Sun ,  Yufang Wang ,  Stefanie Yukiko Nishimura ,  Hongyi Wang ,  Marian Peris ,  Barnett B. Rosenblum ,  Michael Phelan

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6804 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6872 ,  C12Y207/07007 ,  G01N2500/00 ,  C12Q2565/632 ,  C12Q2563/137 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2565/30 ,  C12Q2537/157

摘要： Provided herein are compositions and systems for use in polymerase-dependent, nucleotide transient-binding methods. The methods are useful for deducing the sequence of a template nucleic acid molecule and single nucleotide polymorphism (SNP) analyses. The methods rely on the fact that the polymerase transient-binding time for a complementary nucleotide is longer compared to that of a non-complementary nucleotide. The labeled nucleotides transiently-binds the polymerase in a template-dependent manner, but does not incorporate. The methods are conducted under any reaction condition that permits transient binding of a complementary or non-complementary nucleotide to a polymerase, and inhibits nucleotide incorporation.

摘要翻译： 本文提供了用于聚合酶依赖性核苷酸瞬变结合方法的组合物和系统。 该方法可用于推导模板核酸分子和单核苷酸多态性（SNP）分析的序列。 该方法依赖于与非互补核苷酸相比，互补核苷酸的聚合酶瞬时结合时间更长的事实。 标记的核苷酸以模板依赖的方式瞬时结合聚合酶，但不包括在内。 所述方法在允许互补或非互补核苷酸与聚合酶短暂结合并且抑制核苷酸掺入的任何反应条件下进行。

公开(公告)号：US20100330570A1

公开(公告)日：2010-12-30

申请号：US12790760

申请日：2010-05-28

申请人： Peter B. VANDER HORN ,  Cheng-Yao Chen ,  Guobin Luo ,  Michael Previte ,  Jamshid Temirov ,  Theo Nikiforov ,  Zhaohui Zhou ,  Hongye Sun ,  Yufang Wang ,  Stefanie Yukiko Nishimura ,  Hongyi Wang ,  Marian Peris ,  Barnett B. Rosenblum ,  Michael Phelan

发明人： Peter B. VANDER HORN ,  Cheng-Yao Chen ,  Guobin Luo ,  Michael Previte ,  Jamshid Temirov ,  Theo Nikiforov ,  Zhaohui Zhou ,  Hongye Sun ,  Yufang Wang ,  Stefanie Yukiko Nishimura ,  Hongyi Wang ,  Marian Peris ,  Barnett B. Rosenblum ,  Michael Phelan

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N9/96

CPC分类号： C12N9/1252 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6804 ,  C12Q1/6818 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6872 ,  C12Y207/07007 ,  G01N2500/00 ,  C12Q2565/632 ,  C12Q2563/137 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2565/30 ,  C12Q2537/157

摘要： Provided herein are compositions and systems for use in polymerase-dependent, nucleotide transient-binding methods. The methods are useful for deducing the sequence of a template nucleic acid molecule and single nucleotide polymorphism (SNP) analyses. The methods rely on the fact that the polymerase transient-binding time for a complementary nucleotide is longer compared to that of a non-complementary nucleotide. The labeled nucleotides transiently-binds the polymerase in a template-dependent manner, but does not incorporate. The methods are conducted under any reaction condition that permits transient binding of a complementary or non-complementary nucleotide to a polymerase, and inhibits nucleotide incorporation.

摘要翻译： 本文提供了用于聚合酶依赖性核苷酸瞬变结合方法的组合物和系统。 该方法可用于推导模板核酸分子和单核苷酸多态性（SNP）分析的序列。 该方法依赖于与非互补核苷酸相比，互补核苷酸的聚合酶瞬时结合时间更长的事实。 标记的核苷酸以模板依赖的方式瞬时结合聚合酶，但不包括在内。 所述方法在允许互补或非互补核苷酸与聚合酶短暂结合并且抑制核苷酸掺入的任何反应条件下进行。