公开(公告)号：WO2013135820A1

公开(公告)日：2013-09-19

申请号：PCT/EP2013/055250

申请日：2013-03-14

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： STEHR, Joachim ,  BUERSGENS, Federico ,  ULLERICH, Lars

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6818 ,  C12Q1/6816 ,  C12Q1/682 ,  C12Q1/6834 ,  G06F19/10 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2537/125 ,  C12Q2537/1373 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2565/515

Abstract: Method for the determination of the concentration of a type of specific nucleic acids (10) in a sample, wherein the sequences of the specific nucleic acid (10) at least partially match a reference sequence, and/or for the determination of the degree of the match of the sequences of specific nucleic acids (10) of a type in a sample (9) and a reference sequence, comprising the following steps: providing a first probe (1), which possesses a first oligonucleotide (3) on its surface; providing a second oligonucleotide (7), which is partially complementary to the first oligonucleotide (3) or to a first oligonucleotide adapter (20), which is partially complementary to the first oligonucleotide (3), and wherein the second oligonucleotide (7) is partially complementary to the reference sequence; combining of the first probe (1) and the second oligonucleotide (7) and - if applicable - the first oligonucleotide adapter (20) with the sample (9), wherein a specific nucleic acid (10) contained in the sample (9) can hybridise with the second oligonucleotide (7) and the second oligonucleotide (7) is activated by the hybridisation.

Abstract translation: 用于确定样品中特定核酸类型（10）的浓度的方法，其中所述特异性核酸（10）的序列至少部分匹配参考序列，和/或用于确定 包括以下步骤：提供在其表面上具有第一寡核苷酸（3）的第一探针（1），所述第一探针（1）在其表面上具有第一寡核苷酸（3） ; 提供与第一寡核苷酸（3）部分互补的第二寡核苷酸（7）或与第一寡核苷酸（3）部分互补的第一寡核苷酸衔接子（20），其中第二寡核苷酸（7）为 与参考序列部分互补; 第一探针（1）和第二寡核苷酸（7）的组合和（如果适用的话）第一寡核苷酸衔接子（20）与样品（9）组合，其中样品（9）中包含的特异性核酸（10） 与第二寡核苷酸（7）和第二寡核苷酸（7）杂交通过杂交而被激活。

公开(公告)号：WO2016070945A1

公开(公告)日：2016-05-12

申请号：PCT/EP2014/074101

申请日：2014-11-07

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： BUERSGENS, Federico ,  STEHR, Joachim ,  ULLERICH, Lars

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/686 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q2523/313 ,  C12Q2527/113 ,  C12Q2563/155

Abstract: Die Erfindung betrifft ein Verfahren zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren mittels einer Polymerase-Kettenreaktion, bei der ein Zyklus bestehend aus den Schritten Denaturierung, Annealing und Elongation, wiederholt durchlaufen wird. Dabei beträgt in einer Ausgestaltung der Zugewinn (g) an Exemplaren einer zu vervielfältigen Nukleinsäure am Ende wenigstens eines der Durchläufe des Zyklus weniger als 80 Prozent der zu Beginn dieses Durchlaufs vorhandenen Exemplare der Nukleinsäure und bei wenigstens einem der Durchläufe des Zyklus ist eine Einwirkdauer (t A ) kürzer als eine Sekunde. Zudem ist in einer weiteren Ausgestaltung die Anzahl (k) der Durchläufe des Zyklus der Polymerase-Kettenreaktion größer als 45 und/oder bei wenigstens einem der Durchläufe eine Zyklusdauer t c kürzer als 20 Sekunden.

Abstract translation: 本发明涉及一种用于使用在其中一个循环由，经过反复变性，退火和延伸的步骤进行聚合酶链反应乘以核酸的方法。 这里，在一个实施例中，再生核酸的拷贝在循环的运行中的至少一个的端部的增益（g）为每小于80在核酸和本通复制周期，一个曝光周期的道次中的至少一个的开始处的现有的百分之（TA ）为小于一秒。 此外，在另一个实施方案中，聚合酶链式反应的循环的运行数（K），一个周期时间Tc大于45和/或大于20秒更短的周期中的至少一个。

公开(公告)号：WO2014086912A1

公开(公告)日：2014-06-12

申请号：PCT/EP2013/075637

申请日：2013-12-05

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： BUERSGENS, Federico ,  STEHR, Joachim ,  ULLERICH, Lars ,  ANDRES, Tobias ,  GRAESSEL, Matthias

IPC: B01L3/00

CPC classification number: B01L3/50825 ,  B01L2300/041 ,  B01L2300/047 ,  B01L2300/049 ,  B01L2400/0633

Abstract: Die Erfindung betrifft ein Reaktionsgefäß (1) mit einer ersten (6) und einer zweiten Unterteilung (7), wobei in einem ersten Zustand des Reaktionsgefäßes (1) die erste (6) von der zweiten Unterteilung (7) getrennt ist und in einem zweiten Zustand die erste (6) mit der zweiten Unterteilung (7) verbunden ist. Durch das Einwirken eines magnetischen Feldes ist einer der beiden Zustände in den anderen überführbar.

Abstract translation: 本发明涉及一种反应容器（1），具有第一（6）和第二分区（7），其中在所述反应容器中的第一状态（1），所述第一设备（6）的第二分区的（7）在一分离和第二 状态下，第一（6）与所述第二分区（7）连接。 通过磁场的作用而在两个状态到另一个的一个可以被转移。

公开(公告)号：WO2013113910A1

公开(公告)日：2013-08-08

申请号：PCT/EP2013/052100

申请日：2013-02-01

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： STEHR, Joachim ,  BUERSGENS, Federico ,  ULLERICH, Lars

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/686 ,  B01L7/525 ,  B01L7/5255 ,  B01L2300/1872 ,  B82Y20/00 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q2523/313 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2563/155

Abstract: A method for the amplification of nucleic acids (1), in which nanoparticles (8) in a reaction volume (2) transfer heat to their environment through excitation.

Abstract translation: 用于扩增核酸（1）的方法，其中反应体积（2）中的纳米颗粒（8）通过激发将热量转移到其环境中。

公开(公告)号：WO2021259960A1

公开(公告)日：2021-12-30

申请号：PCT/EP2021/067049

申请日：2021-06-22

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： STEHR, Joachim ,  BUERSGENS, Federico ,  REBUFFO-SCHEER, Cecilia ,  GROTZ, Bettina ,  DUCZEK, Juliane ,  SCHMIDBAUER, Simon

IPC: C12Q1/6806 ,  B01L7/00 ,  C12N15/10 ,  B01L2200/0668 ,  B01L2300/0851 ,  B01L2300/1827 ,  B01L2400/043 ,  B01L7/52 ,  C12N15/1013

Abstract: Bereitgestellt wird ein Verfahren zur Extraktion einer Target-Nukleinsäure (12) aus einer Probenflüssigkeit (30). Das Verfahren umfasst ein Bereitstellen einer Probenflüssigkeit (30) mit der Target-Nukleinsäure (12) in einem Reaktionsgefäß (22) und ein Bereitstellen von magnetischen Mikropartikeln (10) in der Probenflüssigkeit (30), die jeweils mit zumindest einer Extraktionsnukleinsäure (16) funktionalisiert sind, wobei die Extraktionsnukleinsäuren (16) zumindest teilweise komplementär zur Target-Nukleinsäure (12) sind. Ferner umfasst das Verfahren ein Hybridisieren zumindest eines Teils der Target-Nukleinsäure (12) mit einer der Extraktionsnukleinsäuren (16) und Binden der Target-Nukleinsäure (12) über die Extraktionsnukleinsäure (16) an eines der magnetischen Mikropartikeln (10). Außerdem umfasst das Verfahren ein Bereitstellen eines Magnetfeldes in dem Reaktionsgefäß (22) derart, dass zumindest ein Teil der mit der Target-Nukleinsäure (12) verbundenen magnetischen Mikropartikeln (10) an einer Gefäßwand (22a, 22b, 22c) des Reaktionsgefäßes (22) sedimentiert. Ferner werden Vorrichtungen und Verfahren zur Amplifikation einer Target-Nukleinsäure (12), die Verwendung von magnetischen Mikropartikeln (10) zur Extraktion einer Target-Nukleinsäure (12) und ein magnetisches Mikropartikel bereitgestellt.

公开(公告)号：WO2018108680A1

公开(公告)日：2018-06-21

申请号：PCT/EP2017/081754

申请日：2017-12-06

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： STEHR, Joachim ,  STEMPLINGER, Ilse ,  URBAN, Cordula ,  ZIGANN, Katja ,  VANESKI, Aleksander ,  BUERSGENS, Federico ,  ULLERICH, Lars

IPC: C12Q1/6844 ,  B01L7/00

Abstract: Die Erfindung betrifft ein System (10) zum Vervielfältigen einer Nukleinsäure (22), umfassend zumindest ein Lokalheizelement (12), welches mit zumindest einer Verbindungsnukleinsäure (14) funktionalisiert ist, und zumindest eine Primernukleinsäure (16), welche dazu ausgelegt ist, an die zumindest eine Verbindungsnukleinsäure (14) zu binden und an die Nukleinsäure (22) zu binden, und/oder zumindest eine Primerkomplementärnukleinsäure (30), welche dazu ausgelegt ist, an die zumindest eine Verbindungsnukleinsäure (14) zu binden, und die Verbindungsnukleinsäure (14) mittels einer enzymatischen Reaktion um eine Primernukleotidsequenz zu elongieren. Ferner betrifft die Erfindung eine Primernukleinsäure (16), eine Primerkomplementärnukleinsäure (30), ein Lokalheizelement (12) und ein Verfahren zum Vervielfältigen einer Nukleinsäure (22).

公开(公告)号：WO2018073435A1

公开(公告)日：2018-04-26

申请号：PCT/EP2017/076902

申请日：2017-10-20

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： BUERSGENS, Federico ,  STEHR, Joachim ,  ULLERICH, Lars ,  OSINKINA, Lidiya ,  RUSECKAS, Eimantas

IPC: B01L7/00 ,  C12Q1/686

Abstract: The invention relates to a method for the amplification of nucleic acids by means of a polymerase chain reaction in a reaction volume, wherein the reaction volume is heated by using electrical energy. In at least one of the passages of the amplification cycle of the polymerase chain reaction, the ratio of the electrical energy used in the denaturation step to heat the reaction volume to the size of the reaction volume is less than 20 Joule per millilitre. The invention further relates to the use of a device comprising a reaction vessel for receiving the reaction volume and a heating means consisting of one or a plurality of heating elements (1), which are in contact with the reaction volume in order to heat it, wherein at least one of the heating elements is conjugated to oligonucleotides (5), for the amplification of nucleic acids in a reaction volume. Lastly, the invention relates to a device for the amplification of nucleic acids in a reaction volume, which comprises a reaction vessel for receiving the reaction volume, and a heating means consisting of one or a plurality of heating elements (1), which are in contact with the reaction volume in order to heat it.

Abstract translation: 本发明涉及在反应体积中通过聚合酶链式反应扩增核酸的方法，其中通过使用电能加热反应体积。 在聚合酶链式反应的扩增循环的至少一个传代中，变性步骤中用于将反应体积加热至反应体积大小的电能的比率小于20焦耳/毫升。 本发明还涉及包括用于接收反应体积的反应容器和由与反应体积接触以加热反应体积的一个或多个加热元件（1）组成的加热装置的装置的用途， 其中至少一个加热元件与寡核苷酸（5）缀合，用于扩增反应体积中的核酸。 最后，本发明涉及用于扩增反应体积中的核酸的装置，其包括用于接收反应体积的反应容器和由一个或多个加热元件（1）组成的加热装置，所述加热元件处于 接触反应体积以加热它。

公开(公告)号：WO2016074701A1

公开(公告)日：2016-05-19

申请号：PCT/EP2014/074210

申请日：2014-11-10

Applicant: GNA BIOSOLUTIONS GMBH

Inventor： BUERSGENS, Federico ,  STEHR, Joachim ,  ULLERICH, Lars ,  REBUFFO-SCHEER, Cecilia

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6844 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2523/313 ,  C12Q2525/119 ,  C12Q2563/155

Abstract: Eine Verwendung von einem oder mehreren Nanopartikeln (9), die jeweils mit mindestens einem Oligonukleotid (4) konjugiert sind, zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren (1), wobei eines oder mehrere der Oligonukleotide (4) wenigstens eine Primersequenz (5) aufweisen sowie einen weiteren Abschnitt, der sich von dem nanopartikelnahen Ende der Primersequenz in Richtung des Nanopartikels erstreckt, und wobei der weitere Abschnitt wenigstens eine abasische Modifikation (7) aufweist. Außerdem ein Verfahren zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren (1) in einer Probe mit einem Vervielfältigungsschritt zum Vervielfältigen der Nukleinsäuren und einem Testschritt zum Bestimmen der Konzentration der Produkte der Vervielfältigungsreaktion, wobei der Testschritt nach dem Ende des Vervielfältigungsschritts beginnt, und wobei indem Testschritt entweder wenigstens einem Teil der Probe in Stoffe zugeführt werden oder keine Stoffe zugeführt werden. Außerdem Verfahren zum Vervielfältigen von Nukleinsäuren (1), wobei Nanopartikel (8) in einem Reaktionsvolumen (2) durch Anregung Wärme an ihre Umgebung übertragen. Schließlich ein Verfahren zum Vervielfältigen einer Nukleinsäure mittels einer Polymerase-Kettenreaktion, bei der ein Zyklus bestehend aus den Schritten Denaturierung, Annealing und Elongation, wiederholt durchlaufen wird.

Abstract translation: 具有一种或多种纳米颗粒（9）的每一个都与至少一个寡核苷酸（4）共轭，用于相乘核酸（1），其中一个或多个所述寡核苷酸（4）的至少一个引物序列（5）和另一 从在所述纳米颗粒的方向上的引物序列的所述纳米颗粒近端延伸，并且其中，所述另一部分具有至少一个脱碱基修饰部分（7）。 此外，用于核酸（1）用放大核酸的扩增步骤以及用于确定扩增反应的产物的浓度的测试步骤，其中，所述测试步骤的再现步骤结束之后开始，并且其中由测试步骤的样品中任一的至少一部分相乘的方法 样品中的物质或将要提供的任何物质来供给。 此外，用于相乘核酸的方法（1）中，所述纳米颗粒（8）在反应体积（2）通过激发转移热量他们的周围环境。 最后，对于由其中一个循环由，通过变性，退火和延伸的步骤进行聚合酶链反应复制核酸的重复方法。