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    BACTERIA ENGINEERED TO TREAT DISORDERS INVOLVING THE CATABOLISM OF A BRANCHED CHAIN AMINO ACID
    1.
    发明申请
    BACTERIA ENGINEERED TO TREAT DISORDERS INVOLVING THE CATABOLISM OF A BRANCHED CHAIN AMINO ACID 审中-公开
    涉及涉及分支链氨基酸的分析的细菌的细菌工程

    公开(公告)号：WO2016201380A9

    公开(公告)日：2017-02-16

    申请号：PCT/US2016037098

    申请日：2016-06-10

    申请人： SYNLOGIC INC

    发明人： FALB DEAN ,  MILLER PAUL ,  MILLET YVES ,  ISABELLA VINCENT ,  KOTULA JONATHAN ,  TUCKER ALEX

    IPC分类号： C12N1/00 ,  A61K35/74

    CPC分类号： A61K35/74 ,  A61K9/0019 ,  A61K9/0053 ,  A61K38/44 ,  A61K38/443 ,  C07K14/245 ,  C12N9/00 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/0022 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/70 ,  C12Y101/01 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y104/01009 ,  C12Y104/03002 ,  C12Y206/01042 ,  C12Y401/01 ,  C12Y401/01001

    摘要： The present disclosure provides recombinant bacterial cells that have been engineered with genetic circuitry which allow the recombinant bacterial cells to sense a patient's internal environment and respond by turning an engineered metabolic pathway on or off. When turned on, the recombinant bacterial cells complete all of the steps in a metabolic pathway to achieve a therapeutic effect in a host subject. These recombinant bacterial cells are designed to drive therapeutic effects throughout the body of a host from a point of origin of the microbiome. Specifically, the present disclosure provides recombinant bacterial cells comprising a heterologous gene encoding a branched chain amino acid catabolism enzyme. The disclosure further provides pharmaceutical compositions comprising the recombinant bacteria, and methods for treating disorders involving the catabolism of branched chain amino acids using the pharmaceutical compositions disclosed herein.

    摘要翻译： 本公开提供已经用遗传电路设计的重组细菌细胞，其允许重组细菌细胞感测患者的内部环境并且通过打开或关闭工程化代谢途径来进行应答。 当开启时，重组细菌细胞完成代谢途径中的所有步骤以在宿主受试者中达到治疗效果。 这些重组细菌细胞被设计成从微生物群的起点驱动整个宿主体内的治疗效果。 具体地，本公开提供包含编码支链氨基酸分解代谢酶的异源基因的重组细菌细胞。 本公开进一步提供了包含重组细菌的药物组合物，以及使用本文公开的药物组合物治疗涉及分支代谢支链氨基酸的病症的方法。

    改変ロイシン脱水素酵素
    3.
    发明申请
    改変ロイシン脱水素酵素 审中-公开
    改良的脱水脱氢酶

    公开(公告)号：WO2013146940A1

    公开(公告)日：2013-10-03

    申请号：PCT/JP2013/059124

    申请日：2013-03-27

    申请人： 味の素株式会社

    发明人： 星野　亘 ,  小玉　優哉 ,  水越　利巳 ,  田上　宇乃

    IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N9/06 ,  C12Q1/32

    CPC分类号： C12N9/0016 ,  C07K2319/02 ,  C12P13/06 ,  C12P13/08 ,  C12Q1/32 ,  C12Y104/01009 ,  G01N33/6812 ,  G01N2333/90616

    摘要： 　本発明は、総分岐鎖アミノ酸濃度の測定に有用な手段および方法を提供する。具体的には、本発明は、総分岐鎖アミノ酸の測定に関連するロイシン脱水素酵素の特性（例、総分岐鎖アミノ酸に対するロイシン脱水素酵素の基質特異性、任意の分岐鎖アミノ酸に対するロイシン脱水素酵素の活性、およびロイシン脱水素酵素の熱安定性）を改善するようにその少なくとも１つのアミノ酸残基を変異させた、改変酵素；および当該改変酵素を用いて被検試料中に含まれる総分岐鎖アミノ酸を測定することを含む、総分岐鎖アミノ酸の分析方法などを提供する。

    摘要翻译： 本发明提供了用于测量所有支链氨基酸浓度的方法和方法。 具体地，本发明提供了一种修饰的酶，其中至少一个氨基酸残基已经改变以改善亮氨酸脱氢酶的性质，这与所有支链氨基酸的测量相关（例如，亮氨酸脱氢酶的底物特异性相对于 所有支链氨基酸，亮氨酸脱氢酶相对于给定的支链氨基酸的活性和亮氨酸脱氢酶的热稳定性）; 分析所有支链氨基酸的方法，包括使用该修饰酶测量测试样品中所含的所有支链氨基酸等。

    REDOX SELF-SUFFICIENT BIOCATALYTIC AMINATION OF ALCOHOLS
    5.
    发明申请
    REDOX SELF-SUFFICIENT BIOCATALYTIC AMINATION OF ALCOHOLS 审中-公开
    REDOX自发生物生物化学胺化

    公开(公告)号：WO2016001362A1

    公开(公告)日：2016-01-07

    申请号：PCT/EP2015/065101

    申请日：2015-07-02

    申请人： BASF SE

    发明人： BALDENIUS, Kai-Uwe ,  BREUER, Michael ,  DITRICH, Klaus ,  NAVICKAS, Vaidotas ,  MUTTI, Francesco ,  KNAUS, Tanja ,  TURNER, Nicholas

    IPC分类号： C12P13/00 ,  C12N9/06

    CPC分类号： C12P13/001 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/0018 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y104/01009 ,  C12Y104/0102

    摘要： The present invention relates to a novel biocatalytic method for the production of primary and secondary amines, comprising coupled enzymatic oxidation and reduction processes simultaneously regenerating the required cofactor; making use of two enzymes - i.e. an alcohol dehydrogenase and an amine dehydrogenase - operating simultaneously in a one pot process (i.e. biocatalytic cascade). Furthermore, the overall process is redox neutral, since the hydride generated from the first oxidative step is internally recycled in the second reductive step. The invention also relates to recombinant expression systems and microorganisms procuring the required enzyme activities; and bioreactors for performing such methods.

    摘要翻译： 本发明涉及一种用于生产伯胺和仲胺的新型生物催化方法，其包括同时再生所需辅因子的偶联酶氧化和还原方法; 利用在一锅法（即生物催化级联）中同时操作的两种酶即醇脱氢酶和胺脱氢酶。 此外，总体方法是氧化还原中性，因为从第一氧化步骤产生的氢化物在第二还原步骤中被内部再循环。 本发明还涉及获得所需酶活性的重组表达系统和微生物; 和用于执行这种方法的生物反应器。

    METHOD FOR CHEMICAL TRANSFORMATION USING A MUTATED ENZYME
    7.
    发明申请
    METHOD FOR CHEMICAL TRANSFORMATION USING A MUTATED ENZYME 审中-公开
    使用突变酶的化学转化方法

    公开(公告)号：WO0236742A3

    公开(公告)日：2003-08-21

    申请号：PCT/US0148577

    申请日：2001-10-30

    申请人： BIOCATALYTICS INC ,  ROZZELL J DAVID JR

    发明人： ROZZELL J DAVID JR

    IPC分类号： C12N9/04 ,  C12N9/06 ,  C12P13/04 ,  C12P13/06 ,  C12P13/22 ,  C12Q1/32 ,  C12Q1/52

    CPC分类号： C12Y104/01009 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/0018 ,  C12P13/04

    摘要： Methods for chemically transforming compounds using a mutated enzyme are provided, and more particularly a method for the production of an amino acid from a target 2-ketoacid, the production of an amine from a target ketone and the production of an alcohol from a target ketone. The methods comprise creating a mutated enzyme that catalyzes the reductive amination or transamination of the target 2-ketoacid or ketone or the reduction of the ketone and providing the mutated enzyme in a reaction mixture comprising the target 2-ketoacid or ketone under conditions sufficient to permit the formation of the desired amino acid, amine or alcohol to thereby produce the amino acid, amine or alcohol.

    摘要翻译： 提供了使用突变酶对化合物进行化学转化的方法，更具体地，涉及从目标酮生产氨基酸的方法，从目标酮生产胺和从目标酮生产醇 。 所述方法包括产生催化目标2-酮酸或酮的还原胺化或转氨酶或还原酮并在包含目标2-酮酸或酮的反应混合物中提供突变酶的突变酶，条件足以允许 形成所需的氨基酸，胺或醇，从而产生氨基酸，胺或醇。

    BACTERIA ENGINEERED TO TREAT DISORDERS INVOLVING THE CATABOLISM OF A BRANCHED CHAIN AMINO ACID
    9.
    发明申请
    BACTERIA ENGINEERED TO TREAT DISORDERS INVOLVING THE CATABOLISM OF A BRANCHED CHAIN AMINO ACID 审中-公开
    细菌设计用于治疗涉及分支链氨基酸的分解的病症

    公开(公告)号：WO2016201380A8

    公开(公告)日：2017-01-26

    申请号：PCT/US2016037098

    申请日：2016-06-10

    申请人： SYNLOGIC INC

    发明人： FALB DEAN ,  MILLER PAUL ,  MILLET YVES ,  ISABELLA VINCENT ,  KOTULA JONATHAN ,  TUCKER ALEX

    IPC分类号： C12N1/00 ,  A61K35/74

    CPC分类号： A61K35/74 ,  A61K9/0019 ,  A61K9/0053 ,  A61K38/44 ,  A61K38/443 ,  C07K14/245 ,  C12N9/00 ,  C12N9/0006 ,  C12N9/0016 ,  C12N9/0022 ,  C12N9/1096 ,  C12N9/88 ,  C12N15/52 ,  C12N15/70 ,  C12Y101/01 ,  C12Y101/01001 ,  C12Y101/01086 ,  C12Y104/01009 ,  C12Y104/03002 ,  C12Y206/01042 ,  C12Y401/01 ,  C12Y401/01001

    摘要： The present disclosure provides recombinant bacterial cells that have been engineered with genetic circuitry which allow the recombinant bacterial cells to sense a patient's internal environment and respond by turning an engineered metabolic pathway on or off. When turned on, the recombinant bacterial cells complete all of the steps in a metabolic pathway to achieve a therapeutic effect in a host subject. These recombinant bacterial cells are designed to drive therapeutic effects throughout the body of a host from a point of origin of the microbiome. Specifically, the present disclosure provides recombinant bacterial cells comprising a heterologous gene encoding a branched chain amino acid catabolism enzyme. The disclosure further provides pharmaceutical compositions comprising the recombinant bacteria, and methods for treating disorders involving the catabolism of branched chain amino acids using the pharmaceutical compositions disclosed herein.

    摘要翻译： 本公开内容提供了已经用遗传电路工程化的重组细菌细胞，所述遗传电路允许重组细菌细胞感测患者的内部环境并且通过开启或关闭工程化的代谢途径来进行响应。 打开时，重组细菌细胞完成代谢途径中的所有步骤以在宿主受试者中实现治疗效果。 这些重组细菌细胞被设计为从微生物组的起源点驱动整个宿主体内的治疗效果。 具体而言，本公开提供了包含编码支链氨基酸分解代谢酶的异源基因的重组细菌细胞。 本公开还提供了包含重组细菌的药物组合物，以及使用本文公开的药物组合物治疗涉及支链氨基酸分解代谢的病症的方法。

    酸化酵素、それをコードするポリヌクレオチド、及びそれらの利用
    10.
    发明申请
    酸化酵素、それをコードするポリヌクレオチド、及びそれらの利用 审中-公开
    氧化物，其相同的代码和用于两种的多核苷酸

    公开(公告)号：WO2016006522A1

    公开(公告)日：2016-01-14

    申请号：PCT/JP2015/069106

    申请日：2015-07-02

    申请人： 住友化学株式会社

    发明人： 朝子　弘之

    IPC分类号： C12N15/09 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N5/10 ,  C12N9/04 ,  C12P13/04 ,  C12P13/06 ,  C12P13/12

    CPC分类号： C12N9/0016 ,  C07K2319/21 ,  C12N5/10 ,  C12N15/09 ,  C12P13/04 ,  C12P13/06 ,  C12P13/12 ,  C12Y104/01009

    摘要： 配列番号１または３で示されるアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド；配列番号１または３で示されるアミノ酸配列を有するタンパク質；並びに；本発明タンパク質をα－ヒドロキシカルボン酸化合物に作用させて対応するα－オキソカルボン酸化合物を得る工程（１）、及び、α－オキソカルボン酸化合物をアミノ化して対応するL－α－アミノ酸化合物に変換する能力を有するタンパク質を、工程（１）で得られたα－オキソカルボン酸化合物に作用させて、対応するL－α－アミノ酸化合物を得る工程を含むL－α－アミノ酸化合物の製造方法；等。

    摘要翻译： 提供：编码由SEQ ID NO：1或3表示的氨基酸序列的多核苷酸; 具有SEQ ID NO：1或3所示氨基酸序列的蛋白质; 一种制备L-α-氨基酸化合物的方法; 等等。 制备L-α-氨基酸化合物的方法包括：获得使该蛋白质作用于α-羟基羧酸化合物和相应的α-氧代羧酸化合物的步骤（1） 使具有通过胺化将α-氧代羧酸化合物转化为相应的L-α-氨基酸化合物的能力的蛋白质作用于通过工序（1）得到的α-氧代羧酸化合物， 得到相应的L-α-氨基酸化合物。