本发明公开了一种畜禽车的AGM蓄电池剩余电量计算方法及系统，涉及汽车电子技术领域，该方法包括确定待进行畜禽车蓄电池放电容量测量的运行工况；基于车辆的负载电流和发电机电流，计算得到蓄电池的放电电流；依次测量不同温度下不同放电电流情形下的电池放电容量；基于测量的电池电量变化，得到所述运行工况下蓄电池放电容量MAP图，并基于所述MAP图进行畜禽车AGM蓄电池剩余电量计算。本发明能够实现畜禽车蓄电池剩余电量的精准计算，有效避免发动机无法启动或蓄电池损坏问题。