一种奶牛全基因组中高密度SNP芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117431324A

    公开(公告)日:2024-01-23

    申请号:CN202311218327.1

    申请日:2023-09-20

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12Q1/6874

    摘要: 本发明提供一种中高密度奶牛全基因组126K SNP芯片,其包含检测120,155个SNP位点的试剂,所述SNP位点来自:第一类,发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点,包含5,363个SNP位点;第二类,奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点,包含223个SNP个位点;第三类,基于我国的大规模奶牛群体,根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布,从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点,包含114,569个SNP位点。本发明的芯片,可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

    低密度奶牛全基因组30K SNP芯片及其应用

    公开(公告)号:CN116356041A

    公开(公告)日:2023-06-30

    申请号:CN202310266276.3

    申请日:2023-03-20

    摘要: 本发明提供一种低密度奶牛全基因组30K SNP芯片,其包含检测30326个SNP位点的试剂,所述SNP位点来自:第一类,发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点,包含3,399个SNP位点;第二类,奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点,包含226个SNP个位点;第三类,基于我国的大规模奶牛群体,根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布,从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点,包含26,701个SNP位点。本发明的芯片,可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

    一种毛发皮质醇激素提取方法

    公开(公告)号:CN105158041B

    公开(公告)日:2017-10-20

    申请号:CN201510570829.X

    申请日:2015-09-09

    IPC分类号: G01N1/28 G01N33/74 G01N33/531

    摘要: 本发明提供了一种毛发皮质醇激素提取方法,所述方法包括以下步骤:步骤一:将毛发样品置于异丙醇中进行振荡洗涤后在68‑72℃干燥3.5‑4.5h获得洗涤后的毛发;步骤二:利用球磨仪对所述洗涤后的毛发进行研磨获得研磨后的毛发;步骤三:将研磨后的毛发与甲醇在75‑85℃接触15‑17h后离心获得上清液。利用本发明所提供的方法提高了皮质醇激素的提取量,更缩短了样品处理时间,提高了皮质醇提取效率。

    一种用于检测牛GART突变基因型的引物对和检测方法

    公开(公告)号:CN104962556A

    公开(公告)日:2015-10-07

    申请号:CN201510338374.9

    申请日:2015-06-17

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68

    摘要: 本发明涉及分子生物学,具体提供了一种用于检测牛GART突变基因型的引物对,所述引物对如SEQ ID No.1-2所示。本发明进一步提供了一种检测牛GART突变基因型的方法,包括PCR扩增、扩增产物酶切和电泳检测酶切产物,判断待测样本基因型。本发明所设计的引物除了能够扩增牛GART基因的目的突变位点外,所扩增片段内还包含另外2个相同的酶切位点,能够避免因酶切不完全或酶切反应失败而导致的假阳性,从而确保检测的准确性。

    检测牛凝血因子XI基因第9外显子内15bp插入突变的试剂盒

    公开(公告)号:CN102776288B

    公开(公告)日:2013-12-25

    申请号:CN201210266722.2

    申请日:2012-07-30

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明提供一种检测牛凝血因子XI基因第9外显子内15bp插入突变的试剂盒,该试剂盒中包括Seq ID No.1-4所示的引物组合。本发明基于15bp插入片段在牛凝血因子XI基因第9外显子中的位置,设计了跨越15bp插入片段区域的2对引物,并在此基础上建立了PCR检测体系。其中,第1对引物(Seq ID No.1和2)仅能特异扩增出野生型的等位基因;第2对引物(Seq ID No.3和4)仅能特异扩增出突变型等位基因;2个PCR产物长度相差94bp,利用低浓度的琼脂糖凝胶,经过较短时间电泳即能灵敏区分不同的基因型,从而准确筛查出遗传缺陷携带者。

    牛微卫星标记组合及其应用

    公开(公告)号:CN101705299B

    公开(公告)日:2013-11-06

    申请号:CN200910236820.X

    申请日:2009-10-30

    IPC分类号: C12Q1/68 G01N27/447 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种牛微卫星标记组合,其包括17个牛微卫星标记,同时提供了基于此17个微卫星标记的高效检测方法。这些标记多态性高、标记间不连锁并且片段大小间隔适当,易于同时检测。本发明在检测技术上加以改进,利用多标记复合扩增技术和荧光半自动微卫星分型方法,优化实验体系,建立了高通量、准确高效的17个牛微卫星标记复合扩增和基因分型方法。

    褐牛蜘蛛腿综合征致病位点PCR检测方法

    公开(公告)号:CN102586464B

    公开(公告)日:2013-10-09

    申请号:CN201210076915.1

    申请日:2012-03-21

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种褐牛蜘蛛腿综合征致病位点PCR检测用引物,其核苷酸序列如下:5’-CTCAAGAGTCACCACGCAGAT-3’,5’-ATGGAGGGTGCCTTGTCGTC-3’。本发明还涉及PCR检测试剂盒及其检测方法和应用。本发明褐牛蜘蛛腿综合征致病位点PCR检测用引物及其试剂盒,检测结果稳定,成本低,准确可靠,可实现高通量检测,对褐牛AS致病位点可以进行准确的分型,能及时发现褐牛蜘蛛腿综合征携带者个体。

    一种检测牛瓜氨酸血症有害基因的方法及其专用引物

    公开(公告)号:CN102181529B

    公开(公告)日:2013-03-27

    申请号:CN201110065117.4

    申请日:2011-03-17

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种检测牛瓜氨酸血症有害基因的方法及其专用引物。本发明提供的检测瓜氨酸血症有害基因的引物组合物,包括序列表中序列1所示的引物1、序列表中序列2所示的引物2和序列表中序列3所示的引物3。采用本发明的专用引物对瓜氨酸血症(CN)有害基因的携带者和正常个体(非CN有害基因携带者)分别进行AS-PCR检测,实验证明:AS-PCR扩增分型结果和测序结果与预期没有偏差,说明特异性引物的扩增特异性很高,可以分辨单碱基变化;且内标条带也能够指示DNA和PCR体系质量,排除假阴性存在的可能性,说明本发明试剂盒检测CN有害基因的准确性很高。