一种DNA存储的对称加密方法

    公开(公告)号:CN113315623A

    公开(公告)日:2021-08-27

    申请号:CN202110557922.2

    申请日:2021-05-21

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明提供的一种DNA存储的对称加密方法,方法包括以下步骤:获取待加密文件,根据加密密钥加密待加密文件的二进制信息,得到DNA存储序列;将DNA存储序列进行混淆操作处理;将若干混淆操作处理后的DNA存储序列进行合成得到DNA分子序列,将DNA分子序列进行存储,DNA分子序列通过测序得到读长,根据读长与加密密钥解密得到二进制信息;方法在不同错误率下,增大测序深度,数据恢复率呈上升趋势,方法还能够有效地减少加密解密过程中的信息冗余,鲁棒性更高,恶意破解难度大,保密效果更好,可广泛应用于系统生物学研究技术领域。

    一种基于基因通路识别小分子核糖核酸的方法

    公开(公告)号:CN108319816B

    公开(公告)日:2021-04-23

    申请号:CN201810162452.8

    申请日:2018-02-27

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明实施例公开了一种基于基因通路识别癌症相关小RNA(miRNA)的方法,包括确定基因表达谱数据和通路数据,并根据所述确定的基因表达谱数据和通路数据,通过最小生成树的方法找到功能异常的子通路;在基因表达谱数据中,筛选出所述功能异常的子通路所对应的差异表达基因;根据miRNA‑mRNA对应关系,确定潜在的疾病相关小RNA(miRNA);在小RNA(miRNA)功能相似性网络中,利用已知癌症相关miRNA作为种子节点,为候选miRNA打分。实施本发明,能降低寻找过程复杂度,快速准确的找到疾病相关的小RNA(miRNA)。

    基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质

    公开(公告)号:CN111223521A

    公开(公告)日:2020-06-02

    申请号:CN202010008463.8

    申请日:2020-01-06

    Applicant: 广州大学

    Inventor: 刘文斌

    Abstract: 本发明公开了一种基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质。该方法通过从样本集中获取基因数据,基于所述基因数据,分别获取单个基因各个异构体在癌症和正常状态下的表达量,然后通过散度对基因每个异构体在癌症和正常状态下的表达差异进行分析,得到基因的散度值,最后对各个基因的散度值进行排序,并输出散度值大于预设散度阈值的基因数据。该系统包括获取模块、处理模块、分析模块和排序模块。通过使用本发明中的方法,能够方便高效地分析在可变剪接整体上发生显著变化的紊乱基因,更快速地定位出潜在的癌症相关基因,整个过程简单,计算复杂度低。本发明可广泛应用于生物基因技术领域内。

    基于超图嵌入的POI推荐方法及装置

    公开(公告)号:CN116775988A

    公开(公告)日:2023-09-19

    申请号:CN202310554294.1

    申请日:2023-05-17

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于超图嵌入的POI推荐方法及装置,方法包括:接收用户的历史轨迹和候选POI列表,利用超图嵌入方法将每个节点映射到一个低维向量空间中,以使得不同节点之间的相似度通过向量之间的距离或余弦相似度来计算;采用时空注意力网络表示用户行为模式和POI之间的关系,所述时空注意力网络包括两个自注意力机制和一个双向注意力机制;根据时空注意力网络学习到的信息生成推荐结果。本发明使用超图嵌入算法将用户的签到信息视作超图,在用户‑用户之间进行随机游走学习嵌入向量,能够更好地利用用户签到信息之间的关联性,提高POI推荐的效果和准确性。

    一种基于DNA存储介质的文本存储方法

    公开(公告)号:CN112582030B

    公开(公告)日:2023-08-15

    申请号:CN202011508358.7

    申请日:2020-12-18

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明提供的一种基于DNA存储介质的文本存储方法,方法包括:获取原始文本,对原始文本进行编码得到DNA存储序列;将DNA存储序列进行合成,得到DNA分子序列,对DNA分子序列进行扩增,将扩增后的DNA分子序列进行存储;获取存储的DNA分子序列,进行转码得到原始文本;进行转码得到原始文本包括步骤:对存储的DNA分子序列进行测序,得到DNA分子序列的读长;预处理读长,去除读长中的噪音数据,将预处理后的读长进行转码得到原始文本。方法通过直接通过序列的读长将存储的DNA分子序列进行转换,去除了较多的冗余码,提高了存储效率,方法转码以及解码过程中,充分运用了原始文本中的语义信息,查询处理能力强,可广泛应用于系统生物学研究技术领域。

    基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质

    公开(公告)号:CN111223521B

    公开(公告)日:2023-04-25

    申请号:CN202010008463.8

    申请日:2020-01-06

    Applicant: 广州大学

    Inventor: 刘文斌

    Abstract: 本发明公开了一种基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质。该方法通过从样本集中获取基因数据,基于所述基因数据,分别获取单个基因各个异构体在癌症和正常状态下的表达量,然后通过散度对基因每个异构体在癌症和正常状态下的表达差异进行分析,得到基因的散度值,最后对各个基因的散度值进行排序,并输出散度值大于预设散度阈值的基因数据。该系统包括获取模块、处理模块、分析模块和排序模块。通过使用本发明中的方法,能够方便高效地分析在可变剪接整体上发生显著变化的紊乱基因,更快速地定位出潜在的癌症相关基因,整个过程简单,计算复杂度低。本发明可广泛应用于生物基因技术领域内。

    一种量化miRNA对相关疾病基因影响程度的方法

    公开(公告)号:CN109033750B

    公开(公告)日:2021-11-16

    申请号:CN201810787841.X

    申请日:2018-07-18

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明公开了一种量化miRNA对相关疾病基因影响程度的方法,包括如下步骤:①确定miRNA‑mRNA调控关系表;②基因差异表达分析,确定显著差异变化的基因;③计算miRNA表达变化矩阵(ΔEmiR)和mRNA表达变化矩阵(ΔEGene);④根据miRNA表达变化矩阵及miRNA‑mRNA调控关系表,计算所有miRNAs对靶基因mRNA的协同效应(ΔR);⑤计算mRNA表达变化与ΔR之间的皮尔森相关系数,获得显著负相关的基因;⑥计算单个miRNA对相应靶基因mRNA的影响。本发明考虑多个miRNAs对靶基因mRNA的协同作用效果,并提出了量化miRNA对其影响的方法。该方法对于筛选在疾病发生发展中起到关键作用的miRNA具有重要的意义。

    一种招标信息的个性化推荐方法

    公开(公告)号:CN108399191B

    公开(公告)日:2021-06-15

    申请号:CN201810074423.6

    申请日:2018-01-25

    Applicant: 广州大学

    Abstract: 本发明实施例公开了一种招标信息的个性化推荐方法,包括当新标A产生时,借助标的资质信息、金额信息及区域信息,计算标A与其他标的相似度,找出与标A相似度最高的k个标作为种子节点;从种子节点出发使用基于频度的推荐算法或基于随机游走的PersonalRank算法寻找可能参标的企业,生成参标企推荐业列表。实施本发明,能降低算法复杂程度,避免招标信息的盲目推送,减轻了招标人员的工作量。

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