公开(公告)号：CN117025570A

公开(公告)日：2023-11-10

申请号：CN202310450263.1

申请日：2023-04-24

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  魏京京

IPC: C12N9/22 ,  C12N15/55 ,  C12N15/113 ,  C12N15/85 ,  C12N15/65

Abstract: 本发明涉及基因编辑技术领域，具体地涉及一种Mb4Cas12a突变体蛋白以及采用该突变体蛋白的CRISPR/Cas12a基因编辑系统以及其应用。本发明的Mb4Cas12a突变体蛋白与crRNA形成的复合体能够精确地定位靶向DNA序列并产生切割，使所述靶序列发生双链断裂损伤，具有高的特异性，能够降低细胞中或体外进行基因编辑的脱靶率，并且能够区分出靶位点的单碱基差异，具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN112884707B

公开(公告)日：2023-05-05

申请号：CN202110052839.X

申请日：2021-01-15

Applicant: 复旦大学附属妇产科医院 ,  上海长江计算机有限公司

Inventor： 华克勤 ,  王永明 ,  王刚 ,  胡伟平

IPC: G06T7/00 ,  G06V10/25 ,  G06V10/26 ,  G06V10/82 ,  G06N3/0455

Abstract: 本发明公开了一种基于阴道镜的宫颈癌前病变检测系统、设备及介质，本系统建立宫颈癌前病变检测模型，其中包括阴道镜图像分类模块、宫颈部位ROI图像分割模块和宫颈癌前病变检测模块；阴道镜图像分类模块通过深度多分类网络对采集到的阴道镜图像进行三种分类，保留部分宫颈部位和全部宫颈部位的阴道镜图像；宫颈部位ROI图像分割模块通过深度分割网络对部分宫颈部位图像进行分割提取，生成宫颈部位ROI图像；宫颈癌前病变检测模块对全部宫颈部位和宫颈部位ROI图像进行目标检测，输出宫颈癌前病变区域及对应的病变类型。本系统可快速且准确的得出宫颈癌前病变的检测结果，识别病变类型，对及时发现癌前病变和宫颈癌起到了积极的促进作用。

公开(公告)号：CN112884707A

公开(公告)日：2021-06-01

申请号：CN202110052839.X

申请日：2021-01-15

Applicant: 复旦大学附属妇产科医院 ,  上海长江计算机有限公司

Inventor： 华克勤 ,  王永明 ,  王刚 ,  胡伟平

IPC: G06T7/00 ,  G06K9/32 ,  G06K9/34 ,  G06N3/04

Abstract: 本发明公开了一种基于阴道镜的宫颈癌前病变检测系统、设备及介质，本系统建立宫颈癌前病变检测模型，其中包括阴道镜图像分类模块、宫颈部位ROI图像分割模块和宫颈癌前病变检测模块；阴道镜图像分类模块通过深度多分类网络对采集到的阴道镜图像进行三种分类，保留部分宫颈部位和全部宫颈部位的阴道镜图像；宫颈部位ROI图像分割模块通过深度分割网络对部分宫颈部位图像进行分割提取，生成宫颈部位ROI图像；宫颈癌前病变检测模块对全部宫颈部位和宫颈部位ROI图像进行目标检测，输出宫颈癌前病变区域及对应的病变类型。本系统可快速且准确的得出宫颈癌前病变的检测结果，识别病变类型，对及时发现癌前病变和宫颈癌起到了积极的促进作用。

公开(公告)号：CN112359137A

公开(公告)日：2021-02-12

申请号：CN202011001921.1

申请日：2020-09-22

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  王瑞

IPC: C12Q1/70 ,  C12Q1/6844 ,  C12N15/11

Abstract: 本申请属于核酸检测技术领域，具体公开一种可视化病毒核酸RNA检测所用的RT‑LAMP扩增体系及应用，所述可视化病毒核酸RNA检测所用的RT‑LAMP扩增体系由模板、引物组、反应液和去离子水组成；其用于病毒核酸RNA可视化检测时所用的CRISPR体系由Cas12a酶或Cas12b酶、向导RNA、RNA酶抑制剂和ssDNA荧光猝灭探针等组成，可视化病毒核酸RNA检测所用的RT‑LAMP扩增体系：CRISPR体系的体积比为0.1‑5.0:1。整个检测过程可在30至45min内完成，检测结果的准确性和可靠性，适用于核酸的现场、快速、高灵敏检测。

公开(公告)号：CN109777830A

公开(公告)日：2019-05-21

申请号：CN201910022784.0

申请日：2019-01-10

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  王贝

IPC: C12N15/85 ,  C12N15/90

Abstract: 本发明属于基因工程领域，具体为一种在细胞系中条件性敲除必需基因的方法。本发明首先构建双质粒系统：敲除质粒(KO质粒)编码用于敲除必需基因的Cas9和sgRNA，营救质粒(Rescue质粒)编码由Tet-off系统调控的外源补偿基因，然后将两个质粒同时转入细胞后用药筛若干天，分选单克隆，通过测序鉴定，获得必需基因纯合敲除细胞系。本发明中可以通过加Doxcyclin关闭外源基因表达，以研究必需基因的功能。另外，本发明中Rescue质粒可以被另外一个含有不同抗性基因的Rescue2质粒替换，Rescue2质粒上编码必需基因的突变体，用以研究必需基因突变体的功能。本方法操作简单，实验周期短。

公开(公告)号：CN113583999B

公开(公告)日：2024-07-12

申请号：CN202110765655.8

申请日：2021-07-06

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  王帅 ,  高思琪 ,  王瑶

IPC: C12N9/22 ,  C12N15/55 ,  C12N15/113 ,  C12N15/864 ,  C12N5/10

Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体涉及一种CRISPR/Cas9基因编辑系统以及其应用。本发明基因编辑系统为特定Cas9蛋白与sgRNA形成的复合体，能精确定位靶向DNA序列并产生切割，使所述靶序列发生双链断裂损伤；所述基因编辑为在细胞中或体外进行基因编辑。所述各Cas9蛋白均具有数量相对少的氨基酸，可与相同的sgRNA形成复合体进行基因编辑。进一步地，所述Sa‑SchCas9蛋白和SchCas9蛋白识别的PAM序列非常简单，所述Sha2Cas9‑HF1蛋白、Sha2Cas9‑HF2蛋白、SpeCas9‑HF1蛋白、SpeCas9‑HF2蛋白和SpeCas9‑HF3蛋白特异性非常高且编辑效率很高。本发明在基因编辑领域中具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN116751762A

公开(公告)日：2023-09-15

申请号：CN202310449559.1

申请日：2023-04-24

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  魏京京

IPC: C12N9/22 ,  C12N15/113 ,  C12N15/85 ,  C12N15/65

Abstract: 本发明涉及基因编辑技术领域，具体地涉及一种Cas12b突变体蛋白、单链向导RNA、以及采用它们的CRISPR/Cas12基因编辑系统以及其应用。更具体地，本发明的Cas12b突变体蛋白与单链向导RNA形成的复合体，能够精确地定位靶向DNA序列并产生切割，使所述靶序列发生双链断裂损伤，具有高的特异性，能够降低细胞中或体外进行基因编辑的脱靶率，并且能够区分出靶位点的单碱基差异，具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN110551762B

公开(公告)日：2023-03-10

申请号：CN201910731794.1

申请日：2019-08-08

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  胡子英 ,  王大奇 ,  王帅

IPC: C12N15/90 ,  C12N15/864 ,  C12N15/10 ,  C12N9/22 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体为一种CRISPR/ShaCas9基因编辑系统以及其应用。本发明基因编辑系统为ShaCas9蛋白与sgRNA形成的复合体，能精确靶向DNA序列，并产生切割，使DNA发生双链断裂损伤；所述基因编辑为在细胞中或体外进行基因编辑；ShaCas9蛋白小，为1055个氨基酸，识别的PAM序列简单，所述ShaCas9蛋白具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述sgRNA具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。本发明在基因编辑领域中具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN110577970B

公开(公告)日：2022-11-18

申请号：CN201910731398.9

申请日：2019-08-08

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  胡子英 ,  王大奇 ,  王帅

IPC: C12N15/90 ,  C12N15/864 ,  C12N15/10 ,  C12N9/22 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体为一种CRISPR/Sa‑SlutCas9基因编辑系统以及其应用。本发明基因编辑系统为Sa‑SlutCas9蛋白与sgRNA形成的复合体，能精确靶向DNA序列，并产生切割，使DNA发生双链断裂损伤；所述基因编辑为在细胞中或体外进行基因编辑；Sa‑SlutCas9为融合蛋白，把SaCas9的PAM识别结构域（PAM interacting，PI）替换为SlutCas9的PAM识别结构域（SlutCas9‑PI）。Sa‑SlutCas9蛋白小，为1056个氨基酸，识别的PAM序列简单，所述Sa‑SlutCas9蛋白具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述sgRNA具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。本发明在基因编辑领域中具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN110577972B

公开(公告)日：2022-10-11

申请号：CN201910731412.5

申请日：2019-08-08

Applicant: 复旦大学

Inventor： 王永明 ,  胡子英 ,  王大奇 ,  王帅

IPC: C12N15/90 ,  C12N15/864 ,  C12N15/10 ,  C12N9/22 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体为一种CRISPR/Sa‑ShaCas9基因编辑系统以及其应用。本发明基因编辑系统为Sa‑ShaCas9蛋白与sgRNA形成的复合体，能精确靶向DNA序列，并产生切割，使DNA发生双链断裂损伤；所述基因编辑为在细胞中或体外进行基因编辑；Sa‑ShaCas9为融合蛋白，把SaCas9的PAM识别结构域（PAM interacting，PI）替换为ShaCas9的PAM识别结构域（ShaCas9‑PI），Sa‑ShaCas9蛋白小，为1055个氨基酸，识别的PAM序列简单，所述Sa‑ShaCas9蛋白具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，所述sgRNA具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。本发明在基因编辑领域中具有广泛的应用前景。