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公开(公告)号：CN106715713A
公开(公告)日：2017-05-24
申请号：CN201480081856.4
申请日：2014-09-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供了一种试剂盒、一种基于双链DNA制备环状双链DNA的方法、一种制备双链核酸融合分子的方法、一种基于双链DNA片段构建测序文库的方法、一种核酸测序方法、一种基于双链DNA制备环状双链DNA的装置、一种基于双链DNA片段构建测序文库的设备以及一种核酸测序系统。
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公开(公告)号：CN103902852B
公开(公告)日：2017-03-22
申请号：CN201410108121.8
申请日：2014-03-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明公开了一种基因表达的定量方法和装置，包括：获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与所有参考基因进行比对，获取比对上的读段序列；对比对上的读段序列进行过滤，舍去软剪切比例超过第一预设值，序列长度小于第二预设值，以及比对得分小于第三预设值的读段序列，软剪切比例是指没有比对上的碱基数目占该读段序列总碱基数目的比例；比对得分是按照每个读段序列与参考基因的匹配程度以及读段序列的长度而确定的数值；对于已过滤的读段序列，使用RPKM对目标基因表达进行定量。通过将读段序列与参考基因进行比对，而不是现有的与参考基因组进行比对，可以简化比对过程，提高比对效率。
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公开(公告)号：CN103902852A
公开(公告)日：2014-07-02
申请号：CN201410108121.8
申请日：2014-03-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明公开了一种基因表达的定量方法和装置，包括：获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与所有参考基因进行比对，获取比对上的读段序列；对比对上的读段序列进行过滤，舍去软剪切比例超过第一预设值，序列长度小于第二预设值，以及比对得分小于第三预设值的读段序列，软剪切比例是指没有比对上的碱基数目占该读段序列总碱基数目的比例；比对得分是按照每个读段序列与参考基因的匹配程度以及读段序列的长度而确定的数值；对于已过滤的读段序列，使用RPKM对目标基因表达进行定量。通过将读段序列与参考基因进行比对，而不是现有的与参考基因组进行比对，可以简化比对过程，提高比对效率。
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公开(公告)号：CN107124888A
公开(公告)日：2017-09-01
申请号：CN201480083528.8
申请日：2014-11-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
CPC classification number: C12Q1/6874 , C12Q1/68 , C12Q1/6855
Abstract: 本发明提供了一种鼓泡状接头元件和使用其构建测序文库的方法。所述接头元件是由一条核酸长链A和一条核酸短链B形成的两端序列互补、中间序列不互补而呈鼓泡状的杂交体。
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公开(公告)号：CN107075561A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201480082162.2
申请日：2014-10-13
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q1/6855 , C12Q1/686 , C12Q2525/179 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种核酸片段化方法和序列组合，包括如下步骤：使用单链5’端延伸引物对变性后的核酸进行退火、延伸反应，其中单链5’端延伸引物包括5’端的测序平台接头序列和相连的随机序列，随机序列在变性后的核酸的随机位点发生退火；将双链3’端接头序列定向连接到延伸反应生成的核酸的3’端，变性纯化后得到片段化的包含两端接头序列的单链核酸。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106715691A
公开(公告)日：2017-05-24
申请号：CN201480082154.8
申请日：2014-10-14
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供一种转座酶打断核酸并加接头的方法和试剂。该方法包括如下步骤：使用转座酶包埋复合体对核酸进行随机打断，其中转座酶包埋复合体包含转座酶和含转座酶识别序列的第一接头，打断的核酸两端连接第一接头并且形成缺口；通过纯化或化学试剂处理的方式，去除体系中的转座酶对后续反应的影响；使用连接酶在缺口处连接上第二接头，第二接头的序列不同于第一接头；使用分别靶向结合第一接头和第二接头的引物进行PCR反应，得到两端分别连接有不同接头序列的产物。
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公开(公告)号：CN106661575A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201480081525.0
申请日：2014-10-14
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供了一种接头元件和使用该接头元件构建测序文库的方法，所述接头元件由接头A和接头B组成；接头A由一条核酸长链与一条核酸短链互补配对而成，长链5’端具有磷酸修饰，短链3’端为封闭修饰，短链中具有酶作用位点；接头B为一条核酸单链，其3’端能与接头A长链5’端互补配对。使用本发明的接头元件构建测序文库时，在保证接头连接方向性的同时，解决了片段互连、接头自连、连接效率低的问题，减少了步骤间的纯化反应，缩短了连接时间，降低了成本。
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公开(公告)号：CN105506063A
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201410485821.9
申请日：2014-09-22
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明提供了引物组合物及其用途，其中该引物组合物包含：第一引物组，所述第一引物组包含第一正向引物和第一反向引物，其中，所述第一正向引物由目标区域特异性正向引物和第一核酸序列构成，所述第一反向引物由目标区域特异性反向引物和第二核酸序列构成；第二引物组，所述第二引物组包含第二正向引物和第二反向引物，其中，所述第二正向引物包含第一核酸序列和第一测序接头，所述第二反向引物包含第二核酸序列和第二测序接头。利用该引物组合物对待测样品的包含目标区域的核酸样本进行PCR扩增，一步即能够实现目标区域核酸的富集，并且，PCR扩增产物直接构成测序文库。
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公开(公告)号：CN113166974B
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN201980082590.8
申请日：2019-12-11
Applicant: 深圳华大生命科学研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C40B40/06 , C12Q1/6837 , G01N33/543
Abstract: 一种化学修饰的可识别的生物芯片，其制备方法和应用。
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