公开(公告)号：CN118116600B

公开(公告)日：2024-07-09

申请号：CN202410532738.6

申请日：2024-04-30

申请人： 数据空间研究院

发明人： 吴艳平 ,  王飞 ,  马韵洁 ,  王佐成

IPC分类号： G16H50/30 ,  G16H10/20 ,  G16H10/40 ,  G16H10/60 ,  G16B20/10 ,  G16B20/20 ,  G16B25/10 ,  G16B40/00 ,  G06N3/042 ,  G06N3/045 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/084 ,  G06N3/0985

摘要： 本发明公开了一种基于多组学和临床检验数据的结直肠癌预后方法，包括S1、从不同数据源、数据库或实验收集来自不同结直肠癌患者组学数据和患者在手术切除结直肠癌后两年后的生存状况，并采集与患者相关的临床数据，并对组学数据和临床数据进行预处理操作；S2、通过预处理后的组学数据和临床数据以及生存状况构建患者组学相似性网络；S3、编码患者的节点拓扑结构信息和患者临床数据信息；S4、将患者的节点拓扑结构信息和患者临床数据信息添加到图注意力网络的编码中；S5、通过预测模型预测患者在手术切除结直肠癌后两年后的生存状况；S6、使用二元交叉熵损失函数对预测模型进行优化。本发明具备更好的动态适应性，适应癌症发展中的动态变化。

公开(公告)号：CN118280449A

公开(公告)日：2024-07-02

申请号：CN202211739165.1

申请日：2022-12-30

申请人： 中国科学院深圳先进技术研究院

发明人： 杨玉洁 ,  陈宇 ,  李寅虎

IPC分类号： G16B40/00 ,  G16B25/10 ,  G16B30/00

摘要： 本发明公开了一种基于RNA‑seq数据对APOE基因进行分型的方法及其应用。所述方法包括：获取待测样本的RNA‑seq数据，提取出GRCh38chr19号染色体上第44908684和第44908822位点上碱基的信息，统计碱基C和T的数量，判断APOE4基因个数以及APOE基因型。本发明以RNA‑seq数据中GRCh38chr19号染色体上第44908684和第44908822位点的碱基信息为依据，设计特定分析方法，判断样本携带的APOE4的个数及样本的APOE基因型，能够用于阿尔兹海默症的辅助判断、药物筛选等，具有预测结果快速准确，操作简单，成本低等特点。

公开(公告)号：CN118230830A

公开(公告)日：2024-06-21

申请号：CN202410434594.0

申请日：2024-04-11

申请人： 宁波甬恒瑶瑶智能科技有限公司

发明人： 何加铭 ,  王钦文 ,  金錱 ,  吴东舒 ,  单丹丹 ,  江文玲 ,  洪锐 ,  郑国俊 ,  张济鹏 ,  余伟康 ,  雷宣龙

IPC分类号： G16B50/00 ,  G16B30/20 ,  G16B25/10

摘要： 本发明涉及生物工程技术领域，本发明公开了一种生物积块的系统信息数据库建立方法及系统，包括先是获取M个生物积块的基因序列，根据M个基因序列所对应的第一生物信息，将M个基因序列分为N个第一基因序列集合，基于N个第一基因序列集合生成N个相对应的加密字符串，通过数字隐写将加密字符串嵌入至所述第一基因序列集合中，获得N个第二基因序列集合，基于N个第二基因序列集合所对应的第二生物信息进行聚类，获得H个第三基因序列集合，最后基于H个第三基因序列集合构建基因信息数据库，这样根据基因数据库的特点进行加密，不仅保证了基因信息数据库的安全性，为研究人员和工程师提供便利。

公开(公告)号：CN118197467A

公开(公告)日：2024-06-14

申请号：CN202311729961.1

申请日：2023-12-14

申请人： 浦项工科大学校产学协力团 ,  依米诺比姆有限公司

发明人： 李光焕 ,  金相旭 ,  金仁海 ,  李柱勋

IPC分类号： G16C20/50 ,  G16C20/70 ,  G16B15/30 ,  G16B25/10 ,  G16B40/00

摘要： 根据本申请的共必需网络可确定癌症特异性抗癌剂，并发现药物重定位(drug‑repurposing)候选物。共必需链接形成了高度集群化的、潜在药物靶点的网络模块。而且，共必需网络与其他分子网络相比，可更准确地预测针对癌细胞的药物反应。因此，本申请可成为精准肿瘤学中的宝贵资源，有望为癌症患者提供新的治疗机会。

公开(公告)号：CN118197411A

公开(公告)日：2024-06-14

申请号：CN202211600021.8

申请日：2022-12-13

申请人： 深圳华大智造科技股份有限公司

发明人： 杨梦 ,  杨悦羽霄 ,  谢辰熙

IPC分类号： G16B25/10 ,  G16B5/00 ,  G06N3/0464

摘要： 本公开提供一种基因表达量预测的方法及装置、电子设备，通过将待测DNA序列划分为不重叠的第一目标向量；将每个所述不重叠的第一目标向量以分块为单位进行预定次数的局部自注意力信息交互处理得到目标空间向量；对所述目标空间向量进行下采样处理；将下采样处理后的目标空间向量进行预测处理，得到相应的预测表达量。与相关技术相比，本公开通过局部自注意力信息交互机制，可以精确建模局部信息，实现对DNA短序列依赖的捕捉，提高基因表达量的预测精确度。

公开(公告)号：CN118197399A

公开(公告)日：2024-06-14

申请号：CN202410307587.4

申请日：2024-03-18

申请人： 南昌大学第二附属医院

发明人： 白茹茹 ,  洪葵 ,  苏雨豪 ,  万蓉 ,  申阳

IPC分类号： G16B15/30 ,  G16B25/10 ,  G16B30/10

摘要： 本发明提供一种应用于大分子量蛋白突变位点靶向药物筛查的方法，包括：获取大分子量的受体蛋白结构和氨基酸序列，利用计算机软件将受体蛋白分割为若干个片段得到优化的受体片段蛋白结构；收集可能对受体蛋白产生影响的药物分子进行对接初筛和能量最小化优化得到优化的配体结构；运行分子对接软件对接程序，将优化后的受体片段蛋白结构与配体结构分子对接；建立药物与受体蛋白靶向作用位点的映射关系数据库；利用软件建立点突变蛋白片段，获得对该突变产生作用的高评分药物分子，实现蛋白突变位点靶向药物筛查。本发明以计算机开源软件为基础，设计了基于蛋白片段的蛋白‑小分子药物对接筛查方式，用以筛查药物分子在大分子量蛋白上的结合位点。

公开(公告)号：CN114736961B

公开(公告)日：2024-06-11

申请号：CN202210564584.X

申请日：2022-05-23

申请人： 武汉儿童医院

发明人： 高雯琪 ,  邓志芳 ,  肖晗 ,  刘珏

IPC分类号： C12Q1/6883 ,  G16B25/10 ,  G16B45/00 ,  G16H50/20

摘要： 本发明公开了一种老年期抑郁症早期诊断的试剂，其特征在于，包括转录因子LMO2、HTATIP2、ARID3A和CEBPB的基因表达水平检测试剂中一个或多个组合。若获取的LMO2、HTATIP2、ARID3A和CEBPB一个或多个基因表达水平与正常水平有明显差异表达，则判断该样本是来自于老年期抑郁症患者；反之，则判断该样本不是来自于老年期抑郁症患者。本发明提供的老年期抑郁症检测试剂，应用于老年期抑郁检测系统，测试系统中显示转录因子LMO2、HTATIP2、ARID3A和CEBPB基因的受试者工作特征曲线(ReceiverOperatingCharacteristiccurve，ROC)的曲线下面积均超过0.8(当曲线下面积达到0.7至0.9，为临床检测的高精密度)，非常适合用于老年期抑郁症早期诊断。

公开(公告)号：CN118116475A

公开(公告)日：2024-05-31

申请号：CN202410209317.X

申请日：2024-02-26

申请人： 广东隆宇医疗科技有限公司

发明人： 廖影月

IPC分类号： G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G16B25/10 ,  G16B25/20 ,  G16H50/20 ,  G06F18/241 ,  G06F18/2411 ,  G06F18/2413 ,  G06F18/243 ,  G06N20/10 ,  G06N20/20 ,  G06N3/08 ,  C12Q1/6886

摘要： 本发明属于生物医药技术领域，公开了一种多基因分类模型及其构建方法和应用。本发明的肿瘤生态识别的多基因分类模型通过利用算法整合并于训练队列中进行机器学习训练而得；所述算法包括支持向量机、随机森林、神经网络、极端梯度提升、决策树、K最近邻。本发明将其应用于临床患者预后及药物敏感性预测领域。本发明对肿瘤进行肿瘤生态分型的方法，通过识别出134个可分别代表不同肿瘤生态分型的特征基因，输入肿瘤组织的基因表达矩阵即可实现对其肿瘤生态进行分类的功能。该分类器可对胃癌以及其他泛癌种患者进行分型、评估预后和指导治疗方案，效果稳健。本发明的分类模型可以高效识别肿瘤分型，不仅可精确筛选免疫治疗或放化疗的获益人群，亦可剖析免疫治疗抵抗患者的耐药机理，以便于实现免疫治疗增敏，探索更优的联合用药方案，对于胃癌及其他癌症的精准个体化治疗具有临床应用价值。

公开(公告)号：CN118053501A

公开(公告)日：2024-05-17

申请号：CN202410145086.0

申请日：2024-02-01

申请人： 东北大学

发明人： 栗伟 ,  赵敏清 ,  潘智超 ,  谢维冬 ,  冯朝路 ,  杨金柱 ,  覃文军 ,  曹鹏 ,  赵大哲

IPC分类号： G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G16B25/10 ,  G16B25/30 ,  G06F18/2111 ,  G06F18/2113 ,  G06F18/23 ,  G06F18/2411 ,  G06F18/243 ,  G06F18/27 ,  G06N5/01 ,  G06N20/20

摘要： 本发明提供一种基于遗传算法的生物标志物识别方法，涉及机器学习技术领域。该方法首先利用mRMR算法对高维的基因微阵列数据进行过滤；然后通过多种机器学习方法的特征选择结果与OBL算法相结合生成初始化种群，最后使用改进的遗传算法进行最优特征子集的选择，实现生物标志物的识别。该方法融合了不同特征选择算法的优势，还结合了全局搜索和局部搜索进行特征选择，得到的最优个体向量能够保留较少的特征数目且具备较高的分类准确率，实现了较好的分类效果。

公开(公告)号：CN118053496A

公开(公告)日：2024-05-17

申请号：CN202410245363.5

申请日：2024-03-05

申请人： 上海恩元医学检验实验室有限公司 ,  上海恩元生物科技有限公司

发明人： 肖紫阳 ,  金万强 ,  吴建明 ,  程鹏 ,  于畅 ,  陈丽娟 ,  任斌

IPC分类号： G16B25/10 ,  G16H20/10 ,  G16H70/40

摘要： 本发明涉及生物医药技术领域，本发明提供了一种个体化用药基因检测结果可视化系统，包括：检测结果可视化模块；所述检测结果可视化模块用于将药物在代谢、疗效、毒性三个方面的基因检测结果进行处理，生成检测结果二维直角坐标图；所述检测结果二维直角坐标图用于图形化展示各药物在所述检测结果二维直角坐标图中的位置，基于所述位置指示药物的预测疗效、预测毒性和药物代谢情况。本发明可以有效帮助临床医生快速使用报告检出内容辅助患者临床用药决策。