一种识别合子型基因激活ZGA基因的方法及装置

    公开(公告)号:CN112382339B

    公开(公告)日:2024-08-13

    申请号:CN202011288493.5

    申请日:2020-11-17

    IPC分类号: G16B25/10 G16B30/20 G06F18/23

    摘要: 本申请提供了一种识别合子型基因激活ZGA基因的方法及装置,其中,所述方法包括:获取胚胎发育过程中细胞基因的基因表达矩阵,其中,基因表达矩阵包括处于不同发育时间点的细胞基因的表达量;对不同发育时间点进行划分,得到胚胎的不同发育阶段;基于得到的不同发育阶段将基因表达矩阵划分为N个基因表达子矩阵,其中,每个基因表达子矩阵包括处于相同发育阶段的细胞基因的表达量;获取与每个基因表达子矩阵对应的表达量特征值;基于各个基因表达子矩阵和获得的表达量特征值确定ZGA基因。这样一来,通过从细胞基因中确定出的各个基因表达子矩阵和获得的表达量特征值确定ZGA基因,误差较小,可靠性较高,从而提高了细胞基因识别的准确率。

    染色体间易位识别方法、装置、电子设备及可读存储介质

    公开(公告)号:CN112052813B

    公开(公告)日:2023-12-19

    申请号:CN202010964014.0

    申请日:2020-09-15

    IPC分类号: G06V20/69 G06V10/82 G06N3/08

    摘要: 本申请提供了一种染色体间易位识别方法、装置、电子设备及可读存储介质,易位识别方法包括:对获取到的待识别染色体的初始测序数据进行预处理,得到所述待识别染色体的染色体交互图像;将所述染色体交互图像输入至预先训练好的区域分类模型中,从所述染色体交互图像中识别出染色体片段发生易位的高频区域;将所述染色体交互图像输入至预先训练好的位置检测模型中,根据所述高频区域确定出所述染色体交互图像中存在染色体片段发生易位的易位起始位置。这样,通过区域分类模型和位置检测模型对染色体片段进行分类和检测,能够准确的对染色体片段发生易位的情况进行识别,从而确定出染色体片段发生易位的易位起始位置,提高易位(56)对比文件Monika Sharma等.Crowdsourcing forChromosome Segmentation and DeepClassification.2017 IEEE Conference onComputer Vision and Pattern RecognitionWorkshops (CVPRW).2017,第786-793页.Hao Hong等.DeepHiC: A generativeadversarial network for enhancing Hi-Cdata resolution.PLOS ComputationalBiology.2020,第16卷(第2期),第1-28页.Rosarme Vetro等.TIDE: Inter-chromosomal translocation and insertiondetection using embeddings.2014 IEEEInternational Conference on Big Data (BigData).2015,第64-70页.

    一种碳纤维及其制备方法与应用

    公开(公告)号:CN109709187A

    公开(公告)日:2019-05-03

    申请号:CN201811568960.2

    申请日:2018-12-21

    IPC分类号: G01N27/327 H01M8/16

    摘要: 本发明公开了一种碳纤维及其制备方法与应用。它的制备方法,包括如下步骤:将泡沫镍作为基底置于反应器皿中,除去体系中的空气,然后以乙炔作为碳源,采用化学气相沉积方法反应,即得到碳纤维。本发明所述碳纤维在制备葡萄糖生物传感器和/或葡萄糖/氧气生物燃料电池中的应用。本发明葡萄糖生物传感器,其分子识别元件表面包覆所述碳纤维;且所述碳纤维上固定葡萄糖氧化酶。本发明葡萄糖生物燃料电池,其工作电极表面包覆所述碳纤维;且所述碳纤维上固定所述葡萄糖氧化酶。本发明碳纤维在葡萄糖生物传感器和GBFC应用中表现出良好的电化学性能。

    一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置

    公开(公告)号:CN112992267B

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202110392600.7

    申请日:2021-04-13

    IPC分类号: G16B20/00 G06N3/0464 G06N3/08

    摘要: 本申请提供了一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置,其中,所述方法包括:获取scATAC‑seq数据,其中,scATAC‑seq数据包括峰值区域‑细胞矩阵;对峰值区域‑细胞矩阵进行初始化处理,分别得到表征转录因子之间的调控关系的初始邻接矩阵,以及表征每个转录因子的特征信息的初始特征矩阵;将初始邻接矩阵和初始特征矩阵输入至转录因子调控网络预测模型中,得到与初始邻接矩阵相对应的邻接矩阵预测结果。这样一来,仅通过采用scATAC‑seq数据即可解决单细胞的转录因子调控网络预测问题,规避了scRNA‑seq数据在预测调控关系时的诸多弊(56)对比文件Seungbyn Baek,et al.."Single-cellATAC sequencing analysis: From datapreprocessing to hypothesis generation".《Computational and StructuralBiotechnology Journal》.2020,(第18期),1429–1439.

    一种病原体感染损伤机理解析方法及装置

    公开(公告)号:CN109671467B

    公开(公告)日:2023-03-24

    申请号:CN201811521645.4

    申请日:2018-12-12

    IPC分类号: G16B25/10

    摘要: 本发明实施例提供的一种病原体感染损伤机理解析方法及装置,属于基因数据处理领域。该方法包括:获取多个基因沉默后的全基因组表达数据;获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列;获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据;基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集;获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数;根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理,从而融合了海量各类跨平台的转录组大数据,无需从头培养病原体并感染细胞,做大规模的实验,进而降低了研发低成本、缩短了检测周期。并且减少了实验误差,使得对病原体感染的损伤机理的分析更加精确。

    面向DNA信息存储的编码和解码方法与装置

    公开(公告)号:CN113687976A

    公开(公告)日:2021-11-23

    申请号:CN202110994739.9

    申请日:2021-08-27

    IPC分类号: G06F11/10 G16B30/00

    摘要: 本发明提供了一种面向DNA信息存储的编码和解码方法与装置,该方法包括将目标DNA序列进行拆分处理,得到多个原始子序列;针对每个所述原始子序列,生成所述原始子序列的多个第一编码,将多个所述第一编码分别插入至所述原始子序列中的指定位置,得到第一中间子序列;对每个所述第一中间子序列进行编码处理,得到所述目标DNA序列的编码后的多个目标子序列。相关技术中,当编码、解码过程中地址信息错误时,解码恢复得到的序列信息的正确率会明显下降,本申请的技术方案通过加入多个第一编码的方式,提高了编码、存储DNA序列的正确率;通过反复多次对序列进行CRC校验的方式,提高了解码、恢复DNA序列的正确率。