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公开(公告)号:CN115354067A
公开(公告)日:2022-11-18
申请号:CN202210041455.2
申请日:2022-01-14
申请人: 郑州大学第一附属医院 , 江苏先声医学诊断有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12Q1/34
摘要: 本发明提供一种游离DNA甲基化建库的方法,有效的解决了甲基化双链建库在使用中成本较高、检测灵敏度低、冗余度高的问题;包括步骤:S1:提供样本DNA,使用TET酶对样本DNA中的5mC和5fmC进行氧化,分别转化为5caC/5gC,完成氧化并加入终止反应液,然后进行磁珠纯化;S2:将纯化产物变性为单链DNA,使用APOBEC酶,将未修饰的胞嘧啶转化形成尿嘧啶,然后进行磁珠纯化,得到完成C到U转化的单链DNA模板;S3:对纯化产物进行修复,使用单链连接酶进行第一接头连接,得到3’端连接有接头的产物单链DNA分子;一种游离DNA甲基化建库的方法,由于酶法甲基化转化条件温和,可最大程度的减少DNA在转化过程中的损失,提高了文库建库效率。
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公开(公告)号:CN115246531A
公开(公告)日:2022-10-28
申请号:CN202111615588.8
申请日:2021-12-27
申请人: 郑州大学第一附属医院
摘要: 本发明公开了一种用于外周血RNA甲基化检测的运输保存系统,包括外壳,所述外壳的外壁上方焊接有薄板,所述薄板的顶部安装有开合结构,所述开合结构包括竖杆、套板、第一弹簧、圆杆、滑块和弯板,所述竖杆的外壁下方与薄板的顶部外侧间隙配合。该用于外周血RNA甲基化检测的运输保存系统,实现顶盖固定,提高稳定性,防止脱离,垫板的底部与血样管顶部抵紧,防止发生晃动,避免碰撞,确保存放,移动直板使血样管整体顶出,方便血样管收取,降低了使用难度,提高了实用性,第二弹簧提供回弹力带动圆杆回弹,使圆杆穿过套筒与插杆外壁的凹槽插接,完成外壳的重叠放置,防止发生放置倾倒,确保正常使用,便于推广使用。
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公开(公告)号:CN117741150A
公开(公告)日:2024-03-22
申请号:CN202311210384.5
申请日:2023-09-19
申请人: 郑州大学第一附属医院
IPC分类号: G01N33/68 , G16H50/50 , G06F18/214
摘要: 本申请实施例提供了一种用于检测肺癌的组合标志物、试剂盒及其用途,其中组合标志物,包括蛋白:CDON、CLEC4A、DGKZ、FLT3LG、IL6、KRT19、MLN、MVK、PSIP1、REG4、SIT1、TGFA;具有高度敏感性和特异性、准确性高的有益效果;适用于肺癌标志物的技术领域。
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公开(公告)号:CN117275585A
公开(公告)日:2023-12-22
申请号:CN202311311093.5
申请日:2023-10-10
申请人: 郑州大学第一附属医院
摘要: 本申请实施例提供基于LP‑WGS和DNA甲基化的肺癌早筛模型构建方法及电子设备,包括,采集肺癌患者和健康人的外周血,提取cfDNA,建立样本集;基于cfDNA,进行低深度全基因组及甲基化靶向的测序,构建测序文库;对低深度全基因组测序数据、甲基化靶向测序数据进行特征提取,得到全基因组测序数据的片段特征、甲基化靶向测序数据的甲基化特征;根据全基因组测序数据的片段特征、甲基化靶向测序数据的甲基化特征及甲基化数据的片段组特征,构建基于多特征交叉堆叠的肺癌早筛预测模型;通过样本集对肺癌早筛预测模型进行训练和验证,得到最终的肺癌早筛预测模型和预测结果;具有无创的、能够对早期肺癌进行高准确率预测的有益效果,适用于生物医学的技术领域。
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公开(公告)号:CN117305455A
公开(公告)日:2023-12-29
申请号:CN202311315400.7
申请日:2023-10-11
申请人: 郑州大学第一附属医院
IPC分类号: C12Q1/6886 , G16B25/10 , G16B40/00
摘要: 本申请实施例提供一种肺癌DNA甲基化标志物的筛选方法,包括以下步骤:S10,获取DNA甲基化测序数据;S20,对获取的DNA甲基化测序数据进行预处理;S30,在预处理后的DNA甲基化测序数据中对肿瘤细胞在肿瘤样本中的占比进行计算,过滤肿瘤细胞占比<15%的肿瘤样本;S40,对肿瘤细胞占比<15%的肿瘤样本进行过滤后,初步筛选差异甲基化位点及差异甲基化区域;S50,对初步筛选得到的每个差异甲基化位点和每个差异甲基化区域的重要性分数均进行计算,得到候选甲基化标志物;S60,对候选甲基化标志物进行优化和组合,得到肺癌DNA甲基化标志物;具有高灵敏度和特异性、经济有效、简单安全的有益效果;适用于生信分析和分子诊断的技术领域。
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公开(公告)号:CN113667578B
公开(公告)日:2023-09-15
申请号:CN202111174837.4
申请日:2021-10-09
申请人: 郑州大学第一附属医院
摘要: 本发明提供一种从动物组织和细胞中提取RNA的试剂盒及使用方法,有效的解决了现有的试剂盒固不具有摇匀和震荡作用以及试管多时导致工作效率慢的问题,所述试剂盒内前后滑动安装有实验盒,所述实验盒的后端固定安装有实验架,所述实验架的上下两端分别均匀固定开设有多个上下对应的试管孔,所述实验架的下端固定安装有且套设在每个所述试管上的固定环,通过外滑动架、内滑动架和加液管之间的配合使用,解决了同时处理较多试管时工作效率低的问题,而且很大程度上降低操作先后顺序对不同试管内溶液反应时间的影响,通过前齿轮、主动齿条和竖向带轮组各个部件之间配合使用,这样可以实现实验盒和闭合门之间的联动控制。
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公开(公告)号:CN113667578A
公开(公告)日:2021-11-19
申请号:CN202111174837.4
申请日:2021-10-09
申请人: 郑州大学第一附属医院
摘要: 本发明提供一种从动物组织和细胞中提取RNA的试剂盒及使用方法,有效的解决了现有的试剂盒固不具有摇匀和震荡作用以及试管多时导致工作效率慢的问题,所述试剂盒内前后滑动安装有实验盒,所述实验盒的后端固定安装有实验架,所述实验架的上下两端分别均匀固定开设有多个上下对应的试管孔,所述实验架的下端固定安装有且套设在每个所述试管上的固定环,通过外滑动架、内滑动架和加液管之间的配合使用,解决了同时处理较多试管时工作效率低的问题,而且很大程度上降低操作先后顺序对不同试管内溶液反应时间的影响,通过前齿轮、主动齿条和竖向带轮组各个部件之间配合使用,这样可以实现实验盒和闭合门之间的联动控制。
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公开(公告)号:CN216140449U
公开(公告)日:2022-03-29
申请号:CN202122028143.1
申请日:2021-08-26
申请人: 郑州大学第一附属医院
摘要: 本实用新型公开了一种非小细胞肺癌循环肿瘤DNA早诊试剂盒,包括外壳,所述外壳的内部安装有控制结构,所述控制结构包括方架、横板、槽口和直板,所述方架的外壁与外壳的内壁间隙配合,所述方架的内壁与横板的外壁黏合相连,所述横板的正面等距加工有槽口。进而使方架在外壳的内壁向上移动,在方架移出外壳时,将试剂瓶放在槽口的内部,实现推动式开合,解决了插槽损坏问题,确保正常使用,套环增加试剂瓶的连接稳定,放置试剂盒移动晃动造成上下移动,保证放置稳定,随后将螺栓通过圆环内壁向内侧转动,直到螺栓的内侧将外侧将外壳的外壁抵紧,实现外壳的支撑,放置底部发生变形损坏,保证使用,便于推广使用。
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