Counting of nucleic acid
    5.
    发明专利

    公开(公告)号:JP2013528061A

    公开(公告)日:2013-07-08

    申请号:JP2013514306

    申请日:2011-06-07

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 核酸の数え上げのための方法およびシステム(例えば、生物学的試料中の稀な事象の検出のための)が開示される。 特定の実施形態では、本方法は、生物学的試料から得られたポリヌクレオチドを配置して、複数の反応部位を形成する工程であって、該反応部位が、平均して1つのポリヌクレオチドを含有する、工程と;複数の反応部位のポリヌクレオチドを増幅する工程と;核酸ハイブリダイゼーションによって、(i)標的核酸配列またはその一部を含有する第1の反応部位の第1の数、および(ii)参照核酸配列またはその一部を含有する第2の反応部位の第2の数を決定する工程と;第1の反応部位の第1の数を第2の反応部位の第2の数と比較して、生物学的試料中の標的核酸の相対量を決定する工程とを含むことができる。

    Method for processing and analyzing gene expression data for searching inside standard gene
    6.
    发明专利
    Method for processing and analyzing gene expression data for searching inside standard gene 有权
    用于处理和分析基因表达数据以搜索标准基因的方法

    公开(公告)号:JP2012228249A

    公开(公告)日:2012-11-22

    申请号:JP2012140384

    申请日:2012-06-22

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/09

    摘要: PROBLEM TO BE SOLVED: To provide method for processing gene expression data for searching novel inside standard genes more excellent conventional genes, which can be universally and usefully used for standardizing gene expression without being limited to a specific organization or a study and the inside standard genes searched by the method.SOLUTION: House keeping genes of 2,087 pieces is found out by searching novel standard genes by integrally analyzing different data sets by introducing the concept of "zero ratio" and coefficients of variation. the method for processing and analyzing the gene expression data for identifying the inside standard genes is also disclosed.

    摘要翻译: 待解决的问题:提供用于处理基因表达数据的方法,用于搜索更优异的常规基因的新颖的内标基因,其可以普遍和有用地用于标准化基因表达而不限于特定的组织或研究, 通过该方法搜索的标准基因内。

    解决方案:通过引入“零比”和变异系数的概念,通过对不同数据集进行整体分析来搜索新的标准基因,找到了2087个家族基因。 还公开了用于鉴定内标基因的基因表达数据的处理和分析方法。 版权所有(C)2013,JPO&INPIT

    光学検出装置の性能確認方法およびそれに用いる標準試薬

    公开(公告)号:JPWO2008084672A1

    公开(公告)日:2010-04-30

    申请号:JP2008524235

    申请日:2007-12-25

    摘要: 光学検出ユニットおよび温度制御ユニットを備える光学検出装置について、光学シグナルの検出および温度制御が正確に行われているか否か、それらの性能を簡易且つ高い信頼性で確認できる方法を提供する。被検体の光学シグナルを検出する光学検出ユニットと、被検体の温度を制御する温度制御ユニットを備える光学検出装置について、下記方法により光学シグナルの検出性能および温度制御性能を確認する。まず、光学シグナル強度とTm値とが既知である核酸配列と相補鎖とを含む標準サンプルを準備し、前記温度制御ユニットにより前記標準サンプルの温度を上昇もしくは下降させ、且つ、前記検出ユニットにより前記標準サンプルの光学シグナル強度を測定する。他方、温度変化に伴う前記光学シグナル強度の変動から、前記標準サンプルの融解温度を決定する。測定した前記標準サンプルの光学シグナル強度と前記標準サンプルの既知の光学シグナル強度、および、決定した前記標準サンプルの融解温度と前記標準サンプルの既知の融解温度とを、それぞれ比較して、前記検出ユニットによる光学シグナルの検出性能および前記温度制御ユニットによる温度制御性能が正確か否かを確認する。