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    Methods for Identification of Modulators of Carm1 Methyl Transferase Activity
    1.
    发明申请
    Methods for Identification of Modulators of Carm1 Methyl Transferase Activity 审中-公开
    Carm1甲基转移酶活性调节剂鉴定方法

    公开(公告)号：US20080312298A1

    公开(公告)日：2008-12-18

    申请号：US12101631

    申请日：2008-04-11

    申请人： Kenneth William Foreman ,  Salam Shaaban ,  Frances E. Park ,  Michael Sauder

    发明人： Kenneth William Foreman ,  Salam Shaaban ,  Frances E. Park ,  Michael Sauder

    IPC分类号： A61K31/4406 ,  C12N9/10 ,  C12Q1/48 ,  C07C215/30 ,  A61P29/00 ,  G06F17/50 ,  G06F19/00 ,  A61P35/00 ,  A61P3/10 ,  C07D213/52 ,  A61K31/138

    CPC分类号： C12N9/1029 ,  C07K2299/00

    摘要： This invention relates to CARM1, CARM1 binding pockets, or CARM1-like binding pockets. The invention relates to a computer comprising a data storage medium encoded with the structure coordinates of such binding pockets. The invention also relates to methods of using the structure coordinates to solve the structure of homologous proteins or protein complexes. The invention relates to methods of using the structure coordinates to screen for and design compounds that bind to CARM1 protein, complexes of CARM1 protein, homologs thereof, or CARM1-like protein or protein complexes. The invention also relates to crystallizable compositions and crystals comprising a CARM1 protein or homologs thereof. The invention also relates to methods of identifying binders of CARM1 proteins. The invention also relates to methods for determining the intracellular activity of CARM1 methyltransferase and methods for identifying an agent that inhibits the intracellular activity of CARM1 methyltransferase.

    摘要翻译： 本发明涉及CARM1，CARM1结合袋或CARM1样结合袋。 本发明涉及一种计算机，包括用这种结合口袋的结构坐标编码的数据存储介质。 本发明还涉及使用结构坐标来解决同源蛋白质或蛋白质复合物的结构的方法。 本发明涉及使用结构坐标筛选和设计结合CARM1蛋白，CARM1蛋白质的复合物，其同系物或CARM1样蛋白或蛋白质复合物的化合物的方法。 本发明还涉及可结晶组合物和包含CARM1蛋白或其同系物的晶体。 本发明还涉及鉴定CARM1蛋白的结合物的方法。 本发明还涉及确定CARM1甲基转移酶的细胞内活性的方法以及鉴定抑制CARM1甲基转移酶细胞内活性的试剂的方法。

    Image reconstruction method
    2.
    发明申请
    Image reconstruction method 有权
    图像重建方法

    公开(公告)号：US20070208533A1

    公开(公告)日：2007-09-06

    申请号：US11605175

    申请日：2006-11-28

    申请人： Gregory Dahlen ,  William Foreman

    发明人： Gregory Dahlen ,  William Foreman

    IPC分类号： G01B15/04

    CPC分类号： G01Q30/06 ,  G01Q40/00

    摘要： A method of extracting the shape of a probe tip of a probe-based instrument from data obtained by the instrument is provided. The method employs algorithms based on the principle that no reconstructed image points can physically occupy the same region as the tip during imaging. Sequential translates of the tip shape or volume sweep out an area or volume that is an “exclusion zone” similar to morphological erosion. The embodiments of the alternative method use either the region defined by the tip boundary or simply the tip boundary.

    摘要翻译： 提供了一种从由仪器获得的数据中提取基于探针的仪器的探针尖端的形状的方法。 该方法采用基于以下原理的算法：在成像期间，重建图像点在物理上不会与尖端物理占据相同的区域。 尖端形状或体积的顺序平移扫出与形态侵蚀类似的“排除区”的区域或体积。 替代方法的实施例使用由尖端边界或简单的尖端边界限定的区域。

    Image reconstruction method
    3.
    发明授权
    Image reconstruction method 有权
    图像重建方法

    公开(公告)号：US07684956B2

    公开(公告)日：2010-03-23

    申请号：US11605175

    申请日：2006-11-28

    申请人： Gregory A. Dahlen ,  William Foreman

    发明人： Gregory A. Dahlen ,  William Foreman

    IPC分类号： G01B7/34 ,  G01B11/30

    CPC分类号： G01Q30/06 ,  G01Q40/00

    摘要： A method of extracting the shape of a probe tip of a probe-based instrument from data obtained by the instrument is provided. The method employs algorithms based on the principle that no reconstructed image points can physically occupy the same region as the tip during imaging. Sequential translates of the tip shape or volume sweep out an area or volume that is an “exclusion zone” similar to morphological erosion. The embodiments of the alternative method use either the region defined by the tip boundary or simply the tip boundary.

    摘要翻译： 提供了一种从由仪器获得的数据中提取基于探针的仪器的探针尖端的形状的方法。 该方法采用基于以下原理的算法：在成像期间，重建图像点在物理上不会与尖端物理占据相同的区域。 尖端形状或体积的顺序平移扫出与形态侵蚀类似的“排除区”的区域或体积。 替代方法的实施例使用由尖端边界或简单的尖端边界限定的区域。

    Image reconstruction method
    4.
    发明授权
    Image reconstruction method 失效
    图像重建方法

    公开(公告)号：US07143005B2

    公开(公告)日：2006-11-28

    申请号：US10944333

    申请日：2004-09-17

    申请人： Gregory A. Dahlen ,  William Foreman

    发明人： Gregory A. Dahlen ,  William Foreman

    IPC分类号： G01B15/04

    CPC分类号： G01Q30/06 ,  G01Q40/00

    摘要： A method of extracting the shape of a probe tip of a probe-based instrument from data obtained by the instrument is provided. The method employs algorithms based on the principle that no reconstructed image points can physically occupy the same region as the tip during imaging. Sequential translates of the tip shape or volume sweep out an area or volume that is an “exclusion zone” similar to morphological erosion. The embodiments of the alternative method use either the region defined by the tip boundary or simply the tip boundary.

    摘要翻译： 提供了一种从由仪器获得的数据中提取基于探针的仪器的探针尖端的形状的方法。 该方法采用基于以下原理的算法：在成像期间，重建图像点在物理上不会与尖端物理占据相同的区域。 尖端形状或体积的顺序平移扫出与形态侵蚀类似的“排除区”的区域或体积。 替代方法的实施例使用由尖端边界或简单的尖端边界限定的区域。

    Crystal Structure of SMYD3 Protein
    5.
    发明申请
    Crystal Structure of SMYD3 Protein 审中-公开
    SMYD3蛋白的晶体结构

    公开(公告)号：US20090062286A1

    公开(公告)日：2009-03-05

    申请号：US12115089

    申请日：2008-05-05

    申请人： Kenneth William Foreman ,  Frances E. Park ,  Lee Arnold

    发明人： Kenneth William Foreman ,  Frances E. Park ,  Lee Arnold

    IPC分类号： A61K31/41 ,  C12N9/10 ,  G06G7/58 ,  G01N33/53 ,  C07D257/04 ,  A61K31/421 ,  A61K31/519 ,  A61P35/00 ,  A61K31/5375 ,  A61K31/433 ,  C07D263/04 ,  C07D285/135 ,  C07D487/04 ,  C07D265/30

    CPC分类号： C12N9/1007 ,  C07K2299/00 ,  G01N2500/04

    摘要： The invention relates to SMYD3 methyltransferase (SMYD3), SMYD3 binding pockets or SMYD3-like binding pockets. The invention relates to a computer comprising a data storage medium encoded with the structure coordinates of such binding pockets. The invention also relates to methods of using the structure coordinates to solve the structure of homologous proteins or protein complexes. The invention relates to methods of using the structure coordinates to screen for and design compounds that bind to SMYD3 methyltransferase protein, complexes of SMYD3 methyltransferase protein, homologues thereof, or SMYD3-like protein or protein complexes.

    摘要翻译： 本发明涉及SMYD3甲基转移酶（SMYD3），SMYD3结合口袋或SMYD3样结合口袋。 本发明涉及一种计算机，包括用这种结合口袋的结构坐标编码的数据存储介质。 本发明还涉及使用结构坐标来解决同源蛋白质或蛋白质复合物的结构的方法。 本发明涉及使用结构坐标来筛选和设计结合SMYD3甲基转移酶蛋白质的化合物，SMYD3甲基转移酶蛋白质的复合物，其同源物或SMYD3样蛋白质或蛋白质复合物的方法。

    Image reconstruction method
    6.
    发明申请
    Image reconstruction method 失效
    图像重建方法

    公开(公告)号：US20050043917A1

    公开(公告)日：2005-02-24

    申请号：US10944333

    申请日：2004-09-17

    申请人： Gregory Dahlen ,  William Foreman

    发明人： Gregory Dahlen ,  William Foreman

    IPC分类号： G01B3/22 ,  G01B15/04 ,  G01Q30/04 ,  G01Q30/06 ,  G01Q60/00 ,  G01Q70/10

    CPC分类号： G01Q30/06 ,  G01Q40/00

    摘要： A method of extracting the shape of a probe tip of a probe-based instrument from data obtained by the instrument is provided. The method employs algorithms based on the principle that no reconstructed image points can physically occupy the same region as the tip during imaging. Sequential translates of the tip shape or volume sweep out an area or volume that is an “exclusion zone” similar to morphological erosion. The embodiments of the alternative method use either the region defined by the tip boundary or simply the tip boundary.

    摘要翻译： 提供了一种从由仪器获得的数据中提取基于探针的仪器的探针尖端的形状的方法。 该方法采用基于以下原理的算法：在成像期间，重建图像点在物理上不会与尖端物理占据相同的区域。 尖端形状或体积的顺序平移扫出与形态侵蚀类似的“排除区”的区域或体积。 替代方法的实施例使用由尖端边界或简单的尖端边界限定的区域。