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    Human kinesins and methods of producing and purifying human kinesins
    1.
    发明授权
    Human kinesins and methods of producing and purifying human kinesins 失效
    人类运动蛋白和人驱动蛋白的生产和纯化方法

    公开(公告)号：US06544766B1

    公开(公告)日：2003-04-08

    申请号：US09595684

    申请日：2000-06-16

    申请人： Christophe Beraud ,  Cara Ohashi ,  Roman Sakowicz ,  Eugeni Vaisberg ,  Ken Wood ,  Ming Yu

    发明人： Christophe Beraud ,  Cara Ohashi ,  Roman Sakowicz ,  Eugeni Vaisberg ,  Ken Wood ,  Ming Yu

    IPC分类号： C12N916

    CPC分类号： C12N9/14 ,  Y10S977/914

    摘要： Described herein are methods of producing kinesins. In a preferred embodiment, the kinesins are produced from a prokaryote, most preferably, a bacterial cell. Bacterial expression offers several advantages over systems previously utilized, such as, for example, Bacculovirus. The yield of protein is higher, the cost of the expression setup is lower, and creation of alternative expression vectors is easier. The concern of copurifying a contaminating activity from the expression host is also eliminated since bacteria, in contrast to the bacculovirus expression system, do not have kinesin like proteins. Also described herein are purified kinesins, preferably unglycosylated and methods of use.

    摘要翻译： 本文描述了生产驱动蛋白的方法。 在优选的实施方案中，驱动蛋白是由原核生物，最优选细菌细胞产生的。 细菌表达与先前使用的系统相比具有若干优点，例如Bacculovirus。 蛋白质的产量较高，表达设置的成本较低，替代表达载体的产生更容易。 由于与杆状病毒表达系统相比，细菌不具有驱动蛋白样蛋白质，所以从表达宿主中引起污染活性的担忧也被消除。 本文还描述了纯化的驱动蛋白，优选未糖基化和使用方法。

    Granularity analysis in cellular phenotypes
    3.
    发明申请
    Granularity analysis in cellular phenotypes 审中-公开
    细胞表型的粒度分析

    公开(公告)号：US20070206845A1

    公开(公告)日：2007-09-06

    申请号：US11651912

    申请日：2007-01-09

    申请人： Aibing Rao ,  Eugeni Vaisberg

    发明人： Aibing Rao ,  Eugeni Vaisberg

    IPC分类号： G06K9/00

    CPC分类号： G06T7/0012 ,  G06K9/00127 ,  G06K9/0014 ,  G06T7/13 ,  G06T7/155 ,  G06T2207/20036 ,  G06T2207/30024

    摘要： Methods and apparatus, including computer program products, implementing and using techniques for analyzing images of cells and extraction of biologically significant features from the cell images, such as from granules representing intercellular organelles or other features in the images. In various embodiments, the extracted features can include the number of granules, the total surface area of the granules, the mean or maximum intensities of the granules, etc. These features can be determined on a cell-by cell basis, or for particular regions within a single cell, or for various groups of cells.

    摘要翻译： 方法和装置，包括计算机程序产品，用于分析细胞图像的实施和使用技术以及从细胞图像提取生物学显着特征，例如来自代表细胞间细胞器的颗粒或图像中的其他特征。 在各种实施方案中，提取的特征可以包括颗粒的数量，颗粒的总表面积，颗粒的平均或最大强度等。这些特征可以基于逐个细胞或特定区域来确定 在单个细胞内，或用于各种细胞群。

    Database system including computer code for predictive cellular bioinformatics
    4.
    发明申请
    Database system including computer code for predictive cellular bioinformatics 审中-公开
    数据库系统包括用于预测细胞生物信息学的计算机代码

    公开(公告)号：US20070005263A1

    公开(公告)日：2007-01-04

    申请号：US11436977

    申请日：2006-05-19

    申请人： Eugeni Vaisberg ,  Cynthia Adams ,  James Sabry ,  Anne Crompton

    发明人： Eugeni Vaisberg ,  Cynthia Adams ,  James Sabry ,  Anne Crompton

    IPC分类号： G06F19/00

    CPC分类号： G16B50/00

    摘要： According to the present invention, computer based techniques for using information technology in therapeutics or drug discovery. In an exemplary embodiment, computer based techniques for determining information about the properties of substances based upon information about structure of living or non-living cells exposed to substances are provided. Computer software according to the present invention enables researchers and/or scientists to identify promising candidates in the search for new and better medicines or treatments using, for example, a cellular informatics database.

    摘要翻译： 根据本发明，用于在治疗或药物发现中使用信息技术的基于计算机的技术。 在一个示例性实施例中，提供了基于基于关于暴露于物质的生物体或非活细胞结构的信息来确定关于物质属性的信息的基于计算机的技术。 根据本发明的计算机软件使研究人员和/或科学家能够使用例如蜂窝信息学数据库来识别有希望的候选人寻找新的和更好的药物或治疗。

    Normalizing cell assay data for models
    6.
    发明申请
    Normalizing cell assay data for models 审中-公开
    规范模型的细胞测定数据

    公开(公告)号：US20070250301A1

    公开(公告)日：2007-10-25

    申请号：US11715665

    申请日：2007-03-07

    申请人： Eugeni Vaisberg ,  Vadim Kutsyy ,  Ke Yang

    发明人： Eugeni Vaisberg ,  Vadim Kutsyy ,  Ke Yang

    IPC分类号： G06G7/48

    CPC分类号： G01N33/5067 ,  G01N15/1475 ,  G01N33/5014 ,  G01N2015/1477 ,  G01N2015/1488 ,  G06K9/00147 ,  G06T7/0012 ,  G06T2207/30024 ,  G16H50/50

    摘要： Methods for generating models for predicting biological activity of a stimulus test population of cells are provided. The models may be used to classify or predict the effect of stimuli on cells. In certain embodiments, the methods involve receiving data comprising values for dependent variables associated with stimuli as applied to cell populations; preparing a set of cell populations based on the data received; identifying a subset of the cell populations to be used in generating a model from data associated with the subset, wherein the model is provided to predict activity of a test population.

    摘要翻译： 提供了用于产生用于预测细胞的刺激试验群体的生物活性的模型的方法。 这些模型可用于分类或预测刺激对细胞的影响。 在某些实施方案中，所述方法包括接收包含与应用于细胞群体的刺激相关的因变量的值的数据; 根据收到的数据准备一组细胞群; 识别要用于从与所述子集相关联的数据生成模型的所述细胞群体的子集，其中提供所述模型以预测测试群体的活动。

    Assay for distinguishing live and dead cells
    7.
    发明申请
    Assay for distinguishing live and dead cells 审中-公开
    用于区分活细胞和死细胞的分析

    公开(公告)号：US20070031818A1

    公开(公告)日：2007-02-08

    申请号：US11355258

    申请日：2006-02-14

    申请人： Vadim Kutsyy ,  Jinhong Fan ,  Eugeni Vaisberg

    发明人： Vadim Kutsyy ,  Jinhong Fan ,  Eugeni Vaisberg

    IPC分类号： C12Q1/00 ,  C12Q1/68 ,  G06K9/00

    CPC分类号： G06T7/0012 ,  G06K9/00147 ,  G06T2207/10056 ,  G06T2207/20081 ,  G06T2207/30024

    摘要： Image analysis methods and apparatus are used for distinguishing live and dead cells. The methods may involve segmenting an image to identify the region(s) occupied by one or more cells and determining the presence of a particular live-dead indicator feature within the region(s). In certain embodiments, the indicator feature is a cytoskeletal component such as tubulin. In certain embodiments, the methods may involve determining the value of an indicator expression that is based on cellular components such as DNA and/or cellular protein. Prior to producing an image for analysis, cells may be treated with a marker that highlights the live-dead indicator in the image.

    摘要翻译： 图像分析方法和装置用于区分活细胞和死细胞。 所述方法可以包括分割图像以识别由一个或多个单元占用的区域，并确定该区域内特定的活死人指示器特征的存在。 在某些实施方案中，指示剂特征是细胞骨架成分如微管蛋白。 在某些实施方案中，所述方法可以涉及确定基于诸如DNA和/或细胞蛋白质的细胞组分的指示物表达的值。 在生成用于分析的图像之前，可以使用突出显示图像中活死人指示符的标记来处理细胞。

    Ploidy classification method
    8.
    发明申请
    Ploidy classification method 失效
    倍性分类法

    公开(公告)号：US20050272073A1

    公开(公告)日：2005-12-08

    申请号：US11097451

    申请日：2005-04-01

    申请人： Eugeni Vaisberg ,  Daniel Coleman

    发明人： Eugeni Vaisberg ,  Daniel Coleman

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/48 ,  G01N33/50 ,  G06F19/00

    CPC分类号： G01N33/5005

    摘要： Image analysis methods and apparatus are used for determination of the ploidy of cells. The methods may involve segmenting an image to identify one or more discrete regions occupied by cells or nuclei, determining the presence of a particular ploidy indicator feature within the region(s), and providing a value of the indicator feature to a model that classifies cells' ploidy on the basis of the indicator feature. In some embodiments, the indicator feature is a level of DNA in a cell. In certain embodiments, the method further comprises treating one or more cells with a marker that highlights the ploidy indicator feature. In certain embodiments, the cells are treated prior to producing one or more images of the one or more cells. In certain embodiments, the ploidy indicator feature comprises DNA and the marker co-locates with DNA and provides a signal that is captured in the image. In certain embodiments, the signal comprises a fluorescent emission.

    摘要翻译： 图像分析方法和装置用于确定细胞的倍性。 所述方法可以包括分割图像以识别由单元或核占据的一个或多个离散区域，确定区域内特定倍性指示符特征的存在，以及将指示符特征的值提供给将细胞分类的模型 在指标特征的基础上进行倍性。 在一些实施方案中，指示剂特征是细胞中的DNA水平。 在某些实施方案中，所述方法还包括用突出所述倍性指示物特征的标记物处理一个或多个细胞。 在某些实施方案中，在产生一个或多个细胞的一个或多个图像之前处理细胞。 在某些实施方案中，倍性指示物特征包括DNA，并且标记物与DNA共定位并提供在图像中捕获的信号。 在某些实施例中，信号包括荧光发射。

    Domain segmentation and analysis
    10.
    发明申请
    Domain segmentation and analysis 审中-公开
    域分割和分析

    公开(公告)号：US20070202519A1

    公开(公告)日：2007-08-30

    申请号：US11651885

    申请日：2007-01-09

    申请人： Aibing Rao ,  Eugeni Vaisberg

    发明人： Aibing Rao ,  Eugeni Vaisberg

    IPC分类号： C12Q1/68 ,  G06F19/00

    CPC分类号： G06K9/00127 ,  G06T7/0012 ,  G06T7/12 ,  G06T7/155 ,  G06T2207/10056 ,  G06T2207/10064 ,  G06T2207/20152 ,  G06T2207/30024

    摘要： Methods and apparatus, including computer program products, implementing and using techniques for analysis of images of cells and extraction of biologically significant features from the cell images, such as features located in cell boundary regions and cell-cell junctions. The extracted features may be correlated with particular conditions induced by biologically-active agents with which cells have been treated, thereby enabling the automated analysis of cells based on features that can be discovered in the cell boundary regions and cell-cell junctions of the images.

    摘要翻译： 方法和装置，包括计算机程序产品，用于分析细胞图像的实施和使用技术，以及从细胞图像（诸如位于细胞边界区域和细胞 - 细胞连接处）的特征提取生物学显着特征。 提取的特征可以与由细胞已经被处理的生物活性剂诱导的特定条件相关，从而能够基于可以在图像的细胞边界区域和细胞 - 细胞连接处发现的特征来自动分析细胞。