公开(公告)号：US20090192047A1

公开(公告)日：2009-07-30

申请号：US11975390

申请日：2007-10-18

申请人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Maki ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Mark Birch-Machin

发明人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Maki ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Mark Birch-Machin

IPC分类号： C40B30/04 ,  C12Q1/68 ,  C40B40/08 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/156

摘要： Mitochondrial DNA deletions useful for the detection of cancers and sun exposure are provided. In particular, methods and kits for detecting mitochondrial DNA deletions for the early detection, diagnosis and progression of prostate cancer, sun exposure and non-melonoma skin cancer are provided.

摘要翻译： 提供了可用于检测癌症和阳光暴露的线粒体DNA缺失。 特别地，提供了用于检测用于前列腺癌的早期检测，诊断和进展的线粒体DNA缺失的方法和试剂盒，阳光暴露和非合成皮肤癌。

公开(公告)号：US20120058483A1

公开(公告)日：2012-03-08

申请号：US13221618

申请日：2011-08-30

申请人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Maki ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Mark Birch-Machin

发明人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Maki ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Mark Birch-Machin

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/156

摘要： Mitochondrial DNA deletions useful for the detection of cancers and sun exposure are provided. In particular, methods and kits for detecting mitochondrial DNA deletions for the early detection, diagnosis and progression of prostate cancer, sun exposure and non-melonoma skin cancer are provided.

摘要翻译： 提供了可用于检测癌症和阳光暴露的线粒体DNA缺失。 特别地，提供了用于检测用于前列腺癌的早期检测，诊断和进展的线粒体DNA缺失的方法和试剂盒，阳光暴露和非合成皮肤癌。

公开(公告)号：US08008008B2

公开(公告)日：2011-08-30

申请号：US11975390

申请日：2007-10-18

申请人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Maki ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Mark Birch-Machin

发明人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Maki ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Mark Birch-Machin

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/156

摘要： Mitochondrial DNA deletions useful for the detection of cancers and sun exposure are provided. In particular, methods and kits for detecting mitochondrial DNA deletions for the early detection, diagnosis and progression of prostate cancer, sun exposure and non-melanoma skin cancer are provided.

摘要翻译： 提供了可用于检测癌症和阳光暴露的线粒体DNA缺失。 特别地，提供了用于检测线粒体DNA缺失以用于前列腺癌的早期检测，诊断和进展，阳光暴露和非黑素瘤皮肤癌的方法和试剂盒。

公开(公告)号：US20110045471A1

公开(公告)日：2011-02-24

申请号：US12682338

申请日：2008-09-14

申请人： Ryan Parr ,  Mark Birch-Machin ,  Andrew Harbottle ,  Robert Thayer ,  Jennifer Creed ,  Andrea Maggrah ,  Kerry Robinson ,  Gabriel Dakubo ,  Brian Reguly ,  Katrina Maki

发明人： Ryan Parr ,  Mark Birch-Machin ,  Andrew Harbottle ,  Robert Thayer ,  Jennifer Creed ,  Andrea Maggrah ,  Kerry Robinson ,  Gabriel Dakubo ,  Brian Reguly ,  Katrina Maki

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q2600/136 ,  C12Q2600/156

摘要： The present invention relates to methods for predicting, diagnosing and monitoring skin states and skin diseases. The methods combine the use of non-invasive skin collecting techniques with one or more assays for determining mitochondrial DNA (mtDNA) aberrations and Melanocortin 1 Receptor (MC1R) variants, thereby providing a comprehensive tool for identifying, predicting and/or monitoring photoageing, ultraviolet radiation (UVR) damage or skin disease. The methods of the invention may also be effective in screening for new therapeutic agents, skin care products and treatment regimes, and may also be useful for monitoring the response of a subject to a preventative or therapeutic treatment.

摘要翻译： 本发明涉及用于预测，诊断和监测皮肤状态和皮肤疾病的方法。 这些方法将非侵入性皮肤收集技术与一种或多种用于确定线粒体DNA（mtDNA）畸变和黑皮质素1受体（MC1R）变体的测定结合使用，从而提供用于鉴定，预测和/或监测光老化，紫外线 辐射（UVR）损伤或皮肤病。 本发明的方法还可以有效地筛选新的治疗剂，护肤产品和治疗方案，并且还可用于监测受试者对预防或治疗性治疗的反应。

公开(公告)号：US20100311057A1

公开(公告)日：2010-12-09

申请号：US12742032

申请日：2008-11-10

申请人： Ryan Parr ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Katrina Maki ,  Gabriel Dakubo ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Jude Alexander

发明人： Ryan Parr ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Katrina Maki ,  Gabriel Dakubo ,  Brian Reguly ,  Andrew Harbottle ,  Jude Alexander

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention relates to methods for predicting, diagnosing and monitoring cancer. The methods comprise obtaining biological samples, extracting mitochondrial DNA (mtDNA) from the samples, quantifying mitochondrial DNA mutation in the sample and comparing the level of mtDNA mutation with a reference value. The methods of the invention may also be effective in screening for new therapeutic agents and treatment regimes, and may also be useful for monitoring the response of a subject to a preventative or therapeutic treatment.

摘要翻译： 本发明涉及预测，诊断和监测癌症的方法。 方法包括获取生物样品，从样品中提取线粒体DNA（mtDNA），定量样品中的线粒体DNA突变，并将mtDNA突变水平与参考值进行比较。 本发明的方法还可以有效地筛选新的治疗剂和治疗方案，并且还可用于监测受试者对预防或治疗性治疗的反应。

公开(公告)号：US20130022979A1

公开(公告)日：2013-01-24

申请号：US12748120

申请日：2010-03-26

申请人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly

发明人： Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson ,  Andrea Maggrah ,  Brian Reguly

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/156 ,  G01N33/57415 ,  G01N33/57434

摘要： The present invention broadly claims a method for detecting cancer in an individual. The method comprises detecting a deletion in the nucleic acid sequence between residues 10743 and 12125 in mitochondrial DNA. The method comprises obtaining a biological sample from the individual; extracting the mitochondrial DNA (mtDNA) from the sample; quantifying the amount of mtDNA in the sample having a deletion in the nucleic acid sequence between residues 10743 and 14125 of the mtDNA genome; and comparing the amount of mtDNA in the sample having the deletion to at least one known reference sample.

摘要翻译： 本发明广泛地要求用于检测个体癌症的方法。 该方法包括检测线粒体DNA中残基10743和12125之间的核酸序列中的缺失。 该方法包括从个体获得生物样品; 从样品中提取线粒体DNA（mtDNA）; 定量在mtDNA基因组的残基10743和14125之间的核酸序列中具有缺失的样品中的mtDNA的量; 并将具有缺失的样品中的mtDNA的量与至少一个已知参考样品进行比较。

公开(公告)号：US08715960B2

公开(公告)日：2014-05-06

申请号：US13260497

申请日：2010-03-29

申请人： Ryan Parr ,  Gabriel Dakubo ,  Andrew Harbottle ,  Brian Reguly ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson ,  Daniel Klein

发明人： Ryan Parr ,  Gabriel Dakubo ,  Andrew Harbottle ,  Brian Reguly ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson ,  Daniel Klein

IPC分类号： C12P21/06 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/00

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C07K14/4748 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides novel mitochondrial fusion transcripts, the parent mutated mtDNA molecules, and the resulting translation products (proteins) for predicting, diagnosing and/or monitoring cancer. Hybridization probes complementary thereto for use in the methods of the invention are also provided.

摘要翻译： 本发明提供新的线粒体融合转录物，亲本突变的mtDNA分子，以及用于预测，诊断和/或监测癌症的所得翻译产物（蛋白质）。 还提供了用于本发明方法的互补的杂交探针。

公开(公告)号：US20050026167A1

公开(公告)日：2005-02-03

申请号：US10732374

申请日：2003-12-11

申请人： Mark Birch-Machin ,  Gabriel Dakubo ,  Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Alioune Ngom ,  John Th'ng

发明人： Mark Birch-Machin ,  Gabriel Dakubo ,  Ryan Parr ,  Robert Thayer ,  Alioune Ngom ,  John Th'ng

IPC分类号： C07H21/04 ,  C12Q1/68 ,  G06F19/18 ,  C12P19/34

CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2600/158 ,  G16B20/00

摘要： The examination of mutations in the mitochondrial genome is used as a diagnostic system for diseases such as prostate cancer, and non melanoma skin cancer. Characteristic mutations and rearrangements including, point mutations (transitions, transversions), deletions, inversions, duplications, recombinations, insertions or combinations thereof in the mitochondrial genome are used as early indicators of prostate cancer, and non melanoma skin cancer. Moreover, the 4977 bp, or “common deletion” as well as other associated mutations and/or deletions are used as a measure of aging.

摘要翻译： 线粒体基因组中突变的检测用作前列腺癌和非黑色素瘤皮肤癌等疾病的诊断系统。 线粒体基因组中的特征突变和重排，包括点突变（转换，转换），缺失，逆转，重复，重组，插入或其组合用作前列腺癌和非黑色素瘤皮肤癌的早期指标。 此外，使用4977bp或“常见缺失”以及其他相关突变和/或缺失作为衰老的量度。

公开(公告)号：US20070190534A1

公开(公告)日：2007-08-16

申请号：US11339751

申请日：2006-01-26

申请人： Mark Birch-Machin ,  Gabriel Dakubo ,  Robert Thayer ,  Ryan Parr

发明人： Mark Birch-Machin ,  Gabriel Dakubo ,  Robert Thayer ,  Ryan Parr

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G06F19/00 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112

摘要： A cluster analysis of mutations in the mitochondrial genomes from malignant, adjacent benign and distant benign tissues from a sample of men having prostate cancer has determined that mutations in ND1, ND2, COX1 and CytB are indicative of prostate cancer. 97% (30/31) of the samples contained synonymous and non-synonymous mutations in these genes. 65% (20/31) of the samples contained non-synonymous mutations in these genes.

摘要翻译： 来自前列腺癌男性样本的恶性，相邻的良性和远端良性组织的线粒体基因组的突变的聚类分析已经确定ND1，ND2，COX1和CytB中的突变指示前列腺癌。 97％（30/31）的样品含有这些基因中的同义和非同义突变。 65％（20/31）的样品含有这些基因中的非同义突变。

公开(公告)号：US20110172113A1

公开(公告)日：2011-07-14

申请号：US12935181

申请日：2009-03-27

申请人： Ryan Parr ,  Brian Reguly ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson

发明人： Ryan Parr ,  Brian Reguly ,  Gabriel Dakubo ,  Jennifer Creed ,  Kerry Robinson

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C07K14/00 ,  C12N15/00 ,  C07H21/00 ,  C40B30/04 ,  C40B40/10 ,  C40B40/06

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C07K14/4748 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides novel mitochondrial fusion transcripts and the parent mutated mtDNA molecules that are useful for predicting, diagnosing and/or monitoring cancer. Hybridization probes complementary thereto for use in the methods of the invention are also provided.

摘要翻译： 本发明提供了可用于预测，诊断和/或监测癌症的新型线粒体融合转录物和亲本突变的mtDNA分子。 还提供了用于本发明方法的互补的杂交探针。