公开(公告)号：WO2006046026A1

公开(公告)日：2006-05-04

申请号：PCT/GB2005/004122

申请日：2005-10-25

Applicant: CAMBRIDGE UNIVERSITY TECHNICAL SERVICES LIMITED ,  GRAINGER, David

Inventor： GRAINGER, David

IPC: G01N33/68

CPC classification number: G01N33/92 ,  G01N2510/00

Abstract: This invention relates to methods and means for the stimulation of phagocytosis and in particular to the phagocytosis of apoptotic cells, and discloses a role for the protein product of the apoE gene (apolipoproteinE) as a regular of apoptotic cell clearance. ApoE mimetics and other compounds which stimulate the clearance of apoptotic cells may be useful in the treatment of a range of disorders. One aspect of the invention provides a method of identifying and/or obtaining a compound for the treatment of a condition associated with decreased endogenous apoE activity in an individual comprising: determining the ingestion of apoptic cells by a macrophage in the presence of a test compound. An increase in apoptic cell ingestion in the presence relative to the absence of test compound may be indicative that the compound may be useful in the treatment of a condition associated with decreased endogenous apoE activity.

Abstract translation: 本发明涉及刺激吞噬的方法和手段，特别涉及凋亡细胞的吞噬作用，并且公开了apoE基因（载脂蛋白E）的蛋白质产物作为凋亡细胞清除的规则的作用。 刺激凋亡细胞清除的ApoE模拟物和其它化合物可用于治疗一系列疾病。 本发明的一个方面提供了鉴定和/或获得用于治疗与个体内源性ApoE活性降低相关的病症的化合物的方法，其包括：在测试化合物存在下测定巨噬细胞摄取宿主细胞。 在相对于不存在测试化合物存在的情况下，凋亡细胞摄取的增加可以指示该化合物可用于治疗与内源性apoE活性降低相关的病症。

公开(公告)号：WO2006017531A3

公开(公告)日：2006-04-27

申请号：PCT/US2005027480

申请日：2005-08-03

Applicant: GENENTECH INC ,  WAGNER KLAUS W

Inventor： WAGNER KLAUS W

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: A61K38/1709 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/573 ,  G01N33/57419 ,  G01N33/57438 ,  G01N33/57446 ,  G01N33/6863 ,  G01N33/6893 ,  G01N2333/91091 ,  G01N2510/00 ,  G01N2800/24

Abstract: Methods and assays examining expression of one or more biomarkers in a mammalian tissue or cell sample are provided. According to the disclosed methods and assays, detection of the expression of one or more such biomarkers is predictive or indicative that the tissue or cell sample will be sensitive to apoptosis-inducing agents such as Apo2L/TRAIL and anti-DR5 agonist antibodies. Certain biomarkers which may be examined include fucosyltransferases, in particular fucosyltransferase 3 (FUT3) and/or fucosyltransferase 6 (FUT6), as well as sialyl Lewis A and/or X antigens. Kits and articles of manufacture are also provided.

Abstract translation: 提供检查哺乳动物组织或细胞样品中一种或多种生物标志物的表达的方法和试验。 根据所公开的方法和测定，检测一种或多种此类生物标志物的表达是预测或指示组织或细胞样品对凋亡诱导剂如Apo2L / TRAIL和抗DR5激动剂抗体敏感。 可以检查的某些生物标志物包括岩藻糖基转移酶，特别是岩藻糖基转移酶3（FUT3）和/或岩藻糖基转移酶6（FUT6）以及唾液酸基路易斯A和/或X抗原。 还提供了工具包和制品。

公开(公告)号：WO2005051319A3

公开(公告)日：2006-04-13

申请号：PCT/US2004039549

申请日：2004-11-23

Applicant: EXELIXIS INC ,  FRANCIS-LANG HELEN ,  WINTER CHRISTOPHER G ,  VENTURA RICHARD BENN ABEGANIA ,  BJERKE LYNN MARGARET ,  HEUER TIMOTHY S

Inventor： FRANCIS-LANG HELEN ,  WINTER CHRISTOPHER G ,  VENTURA RICHARD BENN ABEGANIA ,  BJERKE LYNN MARGARET ,  HEUER TIMOTHY S

IPC: A61K20060101 ,  C12N20060101 ,  C12Q1/48 ,  G01N33/573 ,  G01N33/574 ,  G01N33/53

CPC classification number: C12Q1/485 ,  G01N33/573 ,  G01N33/57496 ,  G01N2500/00 ,  G01N2510/00

Abstract: Human PLK genes are identified as modulators of the beta catenin pathway, and thus are therapeutic targets for disorders associated with defective beta catenin function. Methods for identifying modulators of beta catenin, comprising screening for agents that modulate the activity of PLK are provided.

Abstract translation: 人PLK基因被鉴定为β连环蛋白途径的调节剂，因此是与β-连环蛋白失活功能相关的病症的治疗靶点。 提供了用于鉴定β连环蛋白调节剂的方法，包括筛选调节PLK活性的试剂。

公开(公告)号：WO2005099772A3

公开(公告)日：2006-04-06

申请号：PCT/US2005012021

申请日：2005-04-12

Applicant: BOSTON BIOMEDICAL RES INST

Inventor： ERHARDT PETER ,  TOTH AMBRUS

IPC: A61K31/07 ,  A01N43/04 ,  A61K48/00 ,  C07H21/04 ,  C07K14/47 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/74

CPC classification number: A61K48/005 ,  A01K2267/0375 ,  C07K14/4747 ,  G01N33/74 ,  G01N2500/02 ,  G01N2500/10 ,  G01N2510/00

Abstract: Provided herein are methods relating to inhibition of PUMA function for preventing or reducing myocardial cell death. A method for preventing or reducing ischemia/reperfusion induced myocardial cell death in a human is provided as are methods for identifying pharmaceuticals which interfere with PUMA function. Also herein provided is a method for reducing stem cell death in stem cell explants wherein the explants are intended to restore cardiac efficiency following cell death in response to coronary infarct.

Abstract translation: 本文提供了与抑制PUMA功能以预防或减少心肌细胞死亡有关的方法。 提供了用于预防或减少人类中缺血/再灌注诱导的心肌细胞死亡的方法，用于鉴定干扰PUMA功能的药物的方法。 本文还提供了用于减少干细胞移植物中的干细胞死亡的方法，其中外植体旨在在响应于冠状动脉梗塞的细胞死亡后恢复心脏效率。

公开(公告)号：WO2006031273A2

公开(公告)日：2006-03-23

申请号：PCT/US2005/021527

申请日：2005-06-16

Applicant: CYTOKINETICS, INC. ,  ADAMS, Cynthia, Lynn ,  DE LA ROSA, Reginald, Norman ,  RAMCHANDANI, Shyamlal

Inventor： ADAMS, Cynthia, Lynn ,  DE LA ROSA, Reginald, Norman ,  RAMCHANDANI, Shyamlal

IPC: C12N5/00 ,  G01N33/50

CPC classification number: G01N33/502 ,  G01N33/5008 ,  G01N2510/00 ,  G06K9/0014

Abstract: Phenotypes and the cells that exhibit those phenotypes are described. The phenotype may be established as a "snapshot" of the cells at a particular time or it may be established as a variation in features over time, or as some combination of these "static" and "dynamic" characterizations. The phenotype may be characterized by at least the following features: (a) chromosomes that approach metaphase but fail to separate and maintain alignment compared to a control cell or cell population; (b) a bipolar spindle that is at least about 10% longer than a corresponding metaphase mitotic spindle from the control cell or cell population; and (c) during interphase the cell or population of cells exhibits a phenotype that is substantially similar to that of the interphase cells of the control cell or cell population.

Abstract translation: 描述了表型和表现出这些表型的细胞。 表型可以在特定时间被建立为细胞的“快照”，或者可以随时间被确定为特征的变化，或者作为这些“静态”和“动态”表征的某种组合。 表型可以至少具有以下特征：（a）与对照细胞或细胞群相比，进入中期但不能分离和保持比对的染色体; （b）双极纺锤体，其比来自对照细胞或细胞群体的相应中期有丝分裂纺锤体长至少约10％; 和（c）在间期期间，细胞或细胞群表现出与对照细胞或细胞群的间期细胞基本相似的表型。

公开(公告)号：WO2006017859A2

公开(公告)日：2006-02-16

申请号：PCT/US2005029045

申请日：2005-08-03

Applicant: GENENTECH INC ,  WAGNER KLAUS W

Inventor： WAGNER KLAUS W

IPC: G01N33/573

CPC classification number: G01N33/573 ,  C07K16/2878 ,  C07K16/2896 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/57419 ,  G01N33/57438 ,  G01N33/57446 ,  G01N2333/91091 ,  G01N2333/91097 ,  G01N2510/00

Abstract: Methods and assays examining expression of one or more biomarkers in a mammalian tissue or cell sample are provided. According to the disclosed methods and assays, detection of the expression of one or more such biomarkers is predictive or indicative that the tissue or cell sample will be sensitive to apoptosis-inducing agents such as Apo2L/TRAIL and anti-DR5 agonist antibodies. Certain biomarkers which may be examined include fucosyltransferases, in particular fucosyltransferase 3 (FUT3) and/or fucosyltransferase 6 (FUT6), as well as sialyl Lewis A and/or X antigens. Kits and articles of manufacture are also provided.

Abstract translation: 提供了检测哺乳动物组织或细胞样品中一种或多种生物标志物表达的方法和分析。 根据所公开的方法和测定，检测一种或多种此类生物标志物的表达是预测性的或指示组织或细胞样品将对细胞凋亡诱导剂如Apo2L / TRAIL和抗DR5激动剂抗体敏感。 可检测的某些生物标志物包括岩藻糖基转移酶，特别是岩藻糖基转移酶3（FUT3）和/或岩藻糖基转移酶6（FUT6），以及唾液酸化Lewis A和/或X抗原。 还提供了工具包和制造物品。

公开(公告)号：WO2006011273A1

公开(公告)日：2006-02-02

申请号：PCT/JP2005/007479

申请日：2005-04-19

Applicant: 独立行政法人科学技術振興機構 ,  大学共同利用機関法人自然科学研究機構 ,  岡田 泰伸 ,  高橋 信之

Inventor： 岡田 泰伸 ,  高橋 信之

IPC: C12Q1/02

CPC classification number: A61K31/185 ,  A61K31/00 ,  A61K31/198 ,  A61K31/245 ,  A61K31/26 ,  G01N33/5008 ,  G01N33/5038 ,  G01N33/5044 ,  G01N33/5061 ,  G01N33/6872 ,  G01N2510/00

Abstract: 　本発明は、虚血後の再灌流による心筋細胞の再灌流性細胞死（アポトーシス性細胞死）を防御・救済する方法、再灌流性細胞死（心筋アポトーシス性細胞死）抑制剤ならびにその再灌流性細胞死抑制剤を含む再灌流性細胞死（アポトーシス性細胞死）に起因する疾患の治療薬剤・予防薬剤を提供することを目的としている。本発明は、虚血処理を行なった心筋細胞について、再流灌時に、ＶＳＯＲ　Ｃｌ - チャネルブロッカーまたはＲＯＳスカベンジャーを投与することによって、再灌流性細胞死（アポトーシス性細胞死）を有意に抑制することができるというものである。上記ＶＳＯＲ　Ｃｌ - チャネルブロッカーとしては、例えばＤＩＤＳやＮＰＰＢが好ましい。また上記ＲＯＳスカベンジャーとしては、例えばＴｉｒｏｎ，カタラーゼ，ＮＡＣが好ましい。本発明は、再灌流性細胞死に起因する各種疾患の治療・予防に有効である。

Abstract translation: 旨在提供一种预防或缓解由缺血后再灌注导致的心肌细胞再灌注诱导的细胞死亡（凋亡细胞死亡）的方法; 再灌注诱导的细胞死亡（凋亡心肌细胞死亡）抑制剂; 以及含有再灌注诱导的细胞死亡抑制剂的再灌注诱导的细胞死亡（凋亡细胞死亡）引起的疾病的治疗药物或预防药物。 也就是说，在再灌注过程中，通过向经过缺血治疗的心肌细胞施用VSOR Cl通道阻断剂或ROS清除剂，可以显着抑制再灌注诱导的细胞死亡（凋亡细胞死亡）。 作为VSOR C1通道阻断剂，优选使用例如DIDS或NPPB。 作为ROS清除剂，优选使用例如泰隆，过氧化氢酶或NAC。 因此，可以有效地治疗或预防由再灌注诱导的细胞死亡引起的各种疾病。

公开(公告)号：WO2006005740A2

公开(公告)日：2006-01-19

申请号：PCT/EP2005/053304

申请日：2005-07-11

Applicant: JANSSEN PHARMACEUTICA N.V. ,  BRUINZEEL, Wouter, David ,  CIK, Miroslav

Inventor： BRUINZEEL, Wouter, David ,  CIK, Miroslav

IPC: G01N33/50

CPC classification number: G01N33/5008 ,  G01N33/5011 ,  G01N33/5058 ,  G01N2510/00

Abstract: The present invention provides a method to identify a test compounds capability to modulate p75 NTR induced apoptosis, said method comprising: i. Transfecting a suspension of eukaryotic cells with a vector encoding p75 NTR (SEQ ID No.2) or a cell death inducing fragment thereof, ii. Contacting said cells with the compound to be tested, and iii. Determine the apoptotic response in said cells, wherein an alteration in apoptotic response in the presence of said test compound compared to the apoptotic response in the absence of the test compound is an indication of the ability of the test compound to modulate p75 NTR induced apoptosis. In this method according to the invention the suspension of eukaryotic cells consist of Hek293T cells used at a cell density of 0.4-3.0 x 10 4 cells/100 µ1 and transfected in the presence of a lipid-based transfection reagent at ratio of transfection reagent to DNA of 6 - 1, in particular at a ratio of 4. Expressed per 10 ml of final transfection mix the amount of transfection reagent is in range of 8.0 - 12.0 µl and the amount of DNA is in a range of 2.0 - 3.5 µg. The apoptotic response of the cells in the method according to the invention is determined using art known procedures. In particular using annexin V or nuclear staining. In a preferred embodiment the apoptotic response is determined using Annexin-V-Alexa Fluor 488 and Hoechst 33342. The p75 NTR cell death inducing fragment as used hereinbefore comprises the p75 Chopper domain (SEQ ID No.10) and in particular consists of p75_ICD (SEQ ID No.4), p75_CD (SEQ ID No.6) or p75_TNF (SEQ ID No.8).

Abstract translation: 本发明提供了鉴定测试化合物调节p75 NTR诱导的凋亡的能力的方法，所述方法包括：i。 用编码p75 NTR（SEQ ID No.2）的载体或其细胞死亡诱导片段转染真核细胞的悬浮液，ii。 将所述细胞与待测化合物接触，和iii。 确定所述细胞中的细胞凋亡反应，其中在不存在测试化合物的情况下，与所述测试化合物存在下的凋亡反应相比，凋亡反应的改变与测试化合物调节p75 NTR的能力有关 诱导细胞凋亡。 在根据本发明的该方法中，真核细胞的悬浮液由细胞密度为0.4-3.0×10 4个细胞/100μl的Hek293T细胞组成，并在基于脂质的转染 试剂的转染试剂与DNA的比例为6-1，特别是以4的比例表达。每10ml最终转染混合物，转染试剂的量在8.0-12.0μl的范围内，DNA的量在 范围2.0 - 3.5μg。 使用本领域已知的方法测定本发明方法中细胞的细胞凋亡反应。 特别是使用膜联蛋白V或核染色。 在一个优选的实施方案中，使用Annexin-V-Alexa Fluor 488和Hoechst 33342测定凋亡应答。如上文所用的p75 NTR细胞死亡诱导片段包含p75 Chopper结构域（SEQ ID No.10） 特别是由p75_ICD（SEQ ID No.4），p75_CD（SEQ ID No.6）或p75_TNF（SEQ ID No.8）组成。

公开(公告)号：WO2005043119A3

公开(公告)日：2005-12-29

申请号：PCT/US2004035806

申请日：2004-10-27

Applicant: RIGEL PHARMACEUTICALS INC ,  LU HENRY H ,  HUANG JIANING ,  PAYAN DONALD G

Inventor： LU HENRY H ,  HUANG JIANING ,  PAYAN DONALD G

IPC: A01N61/00 ,  A61K39/275 ,  C12P21/00 ,  C12Q1/25 ,  C12Q1/37 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/70 ,  G01N20060101

CPC classification number: C12Q1/25 ,  G01N2333/065 ,  G01N2333/9015 ,  G01N2510/00

Abstract: The invention provides methods for identifying an anti-poxviral agents. In many embodiments, the methods involve contacting a poxviral p28 polypeptide with a candidate agent, and determining an effect of the agent on a ubiquitin ligase activity of the p28 polypeptide. The effect of the agent may be determined using a variety of different cell based or biochemical assays, such as polyubiquitylation assays and cell viability assays. The invention also provides methods for modulating poxvirus pathogenicity in a cell, and methods of treating an individual infected with a poxvirus. The subject methods find use in a variety of drug discovery, research and military applications.

Abstract translation: 本发明提供了鉴定抗痘剂的方法。 在许多实施方案中，所述方法包括使痘病毒p28多肽与候选试剂接触，并确定试剂对p28多肽的泛素连接酶活性的影响。 可以使用多种不同的基于细胞的或生物化学测定来确定试剂的作用，例如多泛素化测定和细胞活力测定。 本发明还提供了调节细胞中痘病毒致病性的方法，以及治疗感染痘病毒的个体的方法。 主题方法可用于各种药物发现，研究和军事应用。

公开(公告)号：WO2005054509A3

公开(公告)日：2005-12-01

申请号：PCT/IB2004004341

申请日：2004-12-01

Applicant: LUDWIG INST CANCER RES

Inventor： LU XIN

IPC: A61K38/16 ,  C07K14/47 ,  C07K16/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/574 ,  G01N33/68

CPC classification number: C07K14/4746 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/136 ,  G01N33/5748 ,  G01N33/6875 ,  G01N2500/02 ,  G01N2510/00

Abstract: We describe screening methods for agents which modulate the interaction of p53 activator/inhibitor binding proteins with polymorphic p53 polypeptide variants, cells expressing combinations of said activator/inhibitor proteins and p53 variants; diagnostic assays to determine the genotype of an individual with respect to said p53 polymorphism; and therapeutic compositions for use in the treatment of conditions which would benefit from a stimulation of apoptosis.

Abstract translation: 我们描述了调节p53激活物/抑制剂结合蛋白与多态p53多肽变体，表达所述激活物/抑制剂蛋白和p53变体组合的细胞的相互作用的试剂的筛选方法; 用于确定个体相对于所述p53多态性的基因型的诊断测定; 和治疗组合物，用于治疗受益于细胞凋亡刺激的病症。