基于磁珠的处理装置及方法

    公开(公告)号:CN103897016A

    公开(公告)日:2014-07-02

    申请号:CN201210575133.2

    申请日:2012-12-26

    Abstract: 本发明公开了一种基于磁珠的处理装置及方法,该装置包括:X个样品区、Y个第一反应区、Z个第二反应区以及连接所述各区的连接通道,其中,所述X、Y以及Z是大于零的自然数,所述Y大于等于所述Z;至少一个所述样品区在所述第一反应区的上游,至少一个所述第二反应区在所述第一反应区的下游;所述样品区用于放置生物样品溶液和磁珠溶液;所述第一反应区用于放置第一溶液;所述第二反应区用于放置第二溶液;所述第一溶液不相溶于所述生物样品溶液,所述第一溶液不相溶于所述第二溶液。通过上述方式,本发明能够同时进行大批量样品的纯化,减少人为操作过程和交叉污染的机会。

    一种分析基因表达定量的方法

    公开(公告)号:CN103014137A

    公开(公告)日:2013-04-03

    申请号:CN201110283718.2

    申请日:2011-09-22

    CPC classification number: C12Q1/6809 C12Q2525/191 C12Q2535/122

    Abstract: 本发明公开了一种分析基因表达定量的方法,所述方法包括:从总RNA中纯化mRNA,制备片段化mRNA;将所述片段化mRNA逆转录制备得到cDNA,将所述cDNA纯化后制备为平末端DNA,纯化所述平末端DNA;将所述平末端DNA片段制备得到末端加“A”碱基的DNA片段;在所述末端加“A”碱基的DNA片段两端加接头序列,得到两端加接头序列的DNA片段并进行纯化,对所述两端加接头序列的DNA片段进行PCR反应,纯化PCR反应产物;对所述PCR反应产物测序;将所述测序得到的数据过滤不合格序列得到干净序列,利用短序列映射程序将所述干净序列与参考序列比对,对所述比对结果进行分析。本发明有效的实现了定量准、可重复性高、费用低、检测阈值宽、信号噪音小等优点。

    一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统

    公开(公告)号:CN101561845A

    公开(公告)日:2009-10-21

    申请号:CN200810218339.3

    申请日:2008-12-12

    Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的所有参考基因定位到目标基因组上,构成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。

    基于磁珠的处理装置
    49.
    实用新型

    公开(公告)号:CN203174083U

    公开(公告)日:2013-09-04

    申请号:CN201220730314.3

    申请日:2012-12-26

    Abstract: 本实用新型公开了一种基于磁珠的处理装置及方法,该装置包括:X个样品区、Y个第一反应区、Z个第二反应区以及连接所述各区的连接通道,其中,所述X、Y以及Z是大于零的自然数,所述Y大于等于所述Z;至少一个所述样品区在所述第一反应区的上游,至少一个所述第二反应区在所述第一反应区的下游。通过上述方式,本实用新型能够同时进行大批量样品的纯化,减少人为操作过程和交叉污染的机会。

    一种测序序列纠错方法、系统及设备

    公开(公告)号:CN101457253B

    公开(公告)日:2011-08-31

    申请号:CN200810218340.6

    申请日:2008-12-12

    CPC classification number: G06F19/24 C12Q1/6874 G06F19/22

    Abstract: 本发明适用于基因工程技术领域,提供了一种测序序列纠错方法、系统及设备,所述方法包括下述步骤:接收测序序列,根据预设的高频阀值构造高频短串表;遍历接收到的各测序序列,结合所述高频短串表在各测序序列上查找连续为高频短串最多的区域;根据相应接收到的测序序列和所述高频短串表,在查找到的所述区域左侧和/或右侧构造全是高频短串的左序列和/或右序列;根据构造的所述左序列和/或右序列,以及查找到的所述区域还原相应测序序列。在本发明中,根据预设的高频阀值构造高频短串表,结合构建的高频短串表将各测序序列中非连续高频短串区域的序列恢复为连续高频短串区域的序列,提高后续对测序序列进行分析、处理的准确性。

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