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公开(公告)号：CN107002130A
公开(公告)日：2017-08-01
申请号：CN201580061261.7
申请日：2015-11-10
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q2525/151 , C12Q2565/631
摘要： 提供了改进的单分子测序方法、组合物和装置。在第一方面，本发明提供使用纳米孔测序对靶序列进行测序的多程方法，所述方法包括：i)提供包含所述靶序列的多个拷贝的非天然存在的多联体核酸分子；ii)对所述多联体中的所述靶序列的至少三个拷贝进行纳米孔测序，由此获得多程序列数据集，其中所述多程序列数据集包含所述靶序列的所述至少三个拷贝的靶序列数据集；以及iii)使用所述多程序列数据集来确定所述靶序列。
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公开(公告)号：CN105714383A
公开(公告)日：2016-06-29
申请号：CN201510971452.9
申请日：2015-12-22
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要： 本发明公开了一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂，该方法包括：用分子反向探针与变性核酸进行退火杂交，分子反向探针包括5’端的锚定序列和3’端的延伸序列以及二者之间的测序接头序列，锚定序列和延伸序列分别与变性核酸中的目标区域两端的序列反向互补；以目标区域为模板，从3’端的延伸序列开始进行聚合反应，生成目标区域的互补序列；将5’端的锚定序列与目标区域的互补序列连接形成环状核酸分子；使用核酸外切酶消化未环化的线性分子，得到含有目标区域的单链环状分子。将得到的单链环状分子进行测序，从而实现对目标区域捕获测序。本发明的方法实现将单链环状文库构建和目标区域捕获融为一体，从而大大缩减建库流程和周期。
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公开(公告)号：CN102517392A
公开(公告)日：2012-06-27
申请号：CN201110439198.X
申请日：2011-12-26
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要： 本发明公开一种基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置。该方法包括：提取微生物样品中的DNA；对宏基因组16S rDNA的高可变区V3进行扩增，对扩增产物进行Solexa建库，同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头，对每个样品进行标记；将带有标签序列的不同样品进行混合，混合后使用Solexa测序工具进行测序，得到按照标签区分的原始的测序序列reads；利用reads的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列unique reads；对unique reads进行分类分析，以实现对微生物群体的分类。本发明的方法和装置，对微生物群体的分类准确，且大大降低了测序成本。
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公开(公告)号：CN102409048A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299271.3
申请日：2010-09-21
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q2537/143
摘要： 本发明提供了长度为7bp独特的标签序列，可以分别通过接头连接和PCR反应分别将标签序列导入DNA标签文库。本发明基于目前illumina公司的solexa测序平台提供了使用所述标签序列构建DNA标签文库的方法，应用于solexa DNA测序，提高了DNA标签文库的制备的效率，增大了DNA样品的测序通量，降低了单个样品的solexa测序费用。
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公开(公告)号：CN102409042A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299246.5
申请日：2010-09-21
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC分类号： C40B40/06 , C12N15/1065 , C40B50/06 , C40B70/00
摘要： 本发明提供一种可以进行大规模MeDIP-seq文库构建和同时多样本混合高通量测序的技术。本发明提供的方法对获得的多个样本的混合文库可以同时进行高通量测序，对测序获得的数据通过各自标签(也称为Index)序列进行区分从而分别进行高通量分析。
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公开(公告)号：CN103361406A
公开(公告)日：2013-10-23
申请号：CN201210095970.5
申请日：2012-04-01
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
摘要： 本发明涉及检测分析领域，特别涉及利用油品中的核酸序列信息对油品进行标识，区分以及质量检测的方法。本发明通过测序至少部分核酸分子或片段的至少部分序列信息，基于该序列信息对油品进行标识，获得标识物。在标识物的基础上实现对油品的标识、区分和质量检测。本发明的方法灵敏度高、适用性强，可以实现高通量。
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公开(公告)号：CN101967476B
公开(公告)日：2012-11-14
申请号：CN201010299261.X
申请日：2010-09-21
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC分类号： C12N15/11
CPC分类号： C40B40/06 , C12N15/1065 , C40B50/08
摘要： 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列，并将标签嵌入DNA接头中从而形成DNA PCR-Free标签接头。本发明还提供了通过连接DNA PCR-Free标签接头来导入标签序列，不需要经过PCR反应而成功构建DNA标签文库，并应用于solexa DNA测序。这样将建库方法优化以后，不需要通过PCR反应来构建DNA标签文库。
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公开(公告)号：CN102643792A
公开(公告)日：2012-08-22
申请号：CN201110040036.9
申请日：2011-02-17
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q2527/119 , C12Q2563/137
摘要： 本发明涉及高通量测序技术，具体提供了一种RNA断裂试剂及其应用。本发明提供的RNA断裂试剂，包括维持pH值在7至9之间的生物缓冲液，一价金属离子和二价金属离子；其中所述生物缓冲液、一价金属离子和二价金属离子均处于有效浓度。本发明还提供了上述试剂在RNA测序文库构建中的应用。利用该试剂的建库方法简化了操作步骤，在节约时间、降低成本的同时，利于自动化批量样品建库，利于自动化仪器的应用。
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公开(公告)号：CN102409046A
公开(公告)日：2012-04-11
申请号：CN201010299265.8
申请日：2010-09-21
申请人： 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC分类号： C12N15/1093
摘要： 本发明基于目前illumina公司提供的Solexa Single End测序平台，针对小分子RNA样品，设计了特定序列作为标签。本发明提供了使用所设计的标签，利用PCR方法构建小分子RNA标签文库的方法。本发明的这些标签及其PCR引物可以应用于任何小分子RNA标签的文库构建。
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公开(公告)号：CN107002130B
公开(公告)日：2022-02-01
申请号：CN201580061261.7
申请日：2015-11-10
申请人： 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869 , G01N33/487
摘要： 提供了改进的单分子测序方法、组合物和装置。在第一方面，本发明提供使用纳米孔测序对靶序列进行测序的多程方法，所述方法包括：i)提供包含所述靶序列的多个拷贝的非天然存在的多联体核酸分子；ii)对所述多联体中的所述靶序列的至少三个拷贝进行纳米孔测序，由此获得多程序列数据集，其中所述多程序列数据集包含所述靶序列的所述至少三个拷贝的靶序列数据集；以及iii)使用所述多程序列数据集来确定所述靶序列。
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