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公开(公告)号:CN101967476A
公开(公告)日:2011-02-09
申请号:CN201010299261.X
申请日:2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C40B40/06 , C12N15/1065 , C40B50/08
Abstract: 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列,并将标签嵌入DNA接头中从而形成DNA PCR-Free标签接头。本发明还提供了通过连接DNA PCR-Free标签接头来导入标签序列,不需要经过PCR反应而成功构建DNA标签文库,并应用于solexa DNA测序。这样将建库方法优化以后,不需要通过PCR反应来构建DNA标签文库。
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公开(公告)号:CN103361406A
公开(公告)日:2013-10-23
申请号:CN201210095970.5
申请日:2012-04-01
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明涉及检测分析领域,特别涉及利用油品中的核酸序列信息对油品进行标识,区分以及质量检测的方法。本发明通过测序至少部分核酸分子或片段的至少部分序列信息,基于该序列信息对油品进行标识,获得标识物。在标识物的基础上实现对油品的标识、区分和质量检测。本发明的方法灵敏度高、适用性强,可以实现高通量。
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公开(公告)号:CN101967476B
公开(公告)日:2012-11-14
申请号:CN201010299261.X
申请日:2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC: C12N15/11
CPC classification number: C40B40/06 , C12N15/1065 , C40B50/08
Abstract: 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列,并将标签嵌入DNA接头中从而形成DNA PCR-Free标签接头。本发明还提供了通过连接DNA PCR-Free标签接头来导入标签序列,不需要经过PCR反应而成功构建DNA标签文库,并应用于solexa DNA测序。这样将建库方法优化以后,不需要通过PCR反应来构建DNA标签文库。
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公开(公告)号:CN102517392A
公开(公告)日:2012-06-27
申请号:CN201110439198.X
申请日:2011-12-26
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置。该方法包括:提取微生物样品中的DNA;对宏基因组16S rDNA的高可变区V3进行扩增,对扩增产物进行Solexa建库,同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头,对每个样品进行标记;将带有标签序列的不同样品进行混合,混合后使用Solexa测序工具进行测序,得到按照标签区分的原始的测序序列reads;利用reads的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列unique reads;对unique reads进行分类分析,以实现对微生物群体的分类。本发明的方法和装置,对微生物群体的分类准确,且大大降低了测序成本。
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公开(公告)号:CN102409048A
公开(公告)日:2012-04-11
申请号:CN201010299271.3
申请日:2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2537/143
Abstract: 本发明提供了长度为7bp独特的标签序列,可以分别通过接头连接和PCR反应分别将标签序列导入DNA标签文库。本发明基于目前illumina公司的solexa测序平台提供了使用所述标签序列构建DNA标签文库的方法,应用于solexa DNA测序,提高了DNA标签文库的制备的效率,增大了DNA样品的测序通量,降低了单个样品的solexa测序费用。
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公开(公告)号:CN103014137A
公开(公告)日:2013-04-03
申请号:CN201110283718.2
申请日:2011-09-22
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6809 , C12Q2525/191 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种分析基因表达定量的方法,所述方法包括:从总RNA中纯化mRNA,制备片段化mRNA;将所述片段化mRNA逆转录制备得到cDNA,将所述cDNA纯化后制备为平末端DNA,纯化所述平末端DNA;将所述平末端DNA片段制备得到末端加“A”碱基的DNA片段;在所述末端加“A”碱基的DNA片段两端加接头序列,得到两端加接头序列的DNA片段并进行纯化,对所述两端加接头序列的DNA片段进行PCR反应,纯化PCR反应产物;对所述PCR反应产物测序;将所述测序得到的数据过滤不合格序列得到干净序列,利用短序列映射程序将所述干净序列与参考序列比对,对所述比对结果进行分析。本发明有效的实现了定量准、可重复性高、费用低、检测阈值宽、信号噪音小等优点。
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公开(公告)号:CN102409044A
公开(公告)日:2012-04-11
申请号:CN201010299248.4
申请日:2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C40B40/06 , C12N15/1065 , C12Q1/6869 , C40B50/02 , C40B50/06 , C12Q2525/119
Abstract: 本发明基于目前illumina公司提供的Solexa Single End测序平台,针对数字基因表达谱文库(DGE)样品建库方法,设计了独特的标签序列(index1-12),通过接头将标签嵌DGE文库的3’接头中,成功的建立了数字基因表达谱标签文库(DGE标签文库)的建库方法,适合任何真核生物RNA样品的DGE标签文库构建,并成功用于solexa测序,不仅增大了DGE样品的测序通量,而且降低了solexa针对DGE测序的费用。
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公开(公告)号:CN102409049A
公开(公告)日:2012-04-11
申请号:CN201010299305.9
申请日:2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12N15/1065 , C12Q1/6869 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q2537/143
Abstract: 本发明设计了长度为8bp独特的161个标签序列,并将标签嵌入DNA PCR引物中从而形成DNA PCR标签引物,从而可以通过PCR反应导入标签序列。本发明成功地建立了DNA标签文库的建库方法,并应用于solexa DNA测序。
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公开(公告)号:CN102409045A
公开(公告)日:2012-04-11
申请号:CN201010299257.3
申请日:2010-09-21
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12N15/1065 , C12Q2525/191 , C12Q2563/179
Abstract: 本发明基于illumina公司的solexa测序平台提供的DNA标签文库制备方法,设计了长度为6bp独特的标签序列,将标签嵌入DNA接头中,通过连接DNA接头连接来导入标签序列,成功的建立了DNA标签文库的建库方法,并应用于solexa DNA测序。
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公开(公告)号:CN108070642A
公开(公告)日:2018-05-25
申请号:CN201710349201.6
申请日:2017-05-17
Applicant: 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种提高DNB双末端测序质量的方法和DNB双末端测序方法和试剂盒。本发明的提高DNB双末端测序质量的方法,包括:对DNA纳米球进行一链合成测序时,使用部分dUTP代替dTTP进行联合探针锚定聚合测序;在所述一链合成测序完成后,使用USER酶消化一链上的尿嘧啶,然后使用变性剂洗脱一链或使用外切酶消化一链。本发明的方法能够实现完全去除一链的目的,降低一链对二链的负面影响,从而提高DNB双末端测序的读长和质量。
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