一种醛缩酶及其在果糖-6-磷酸合成中的应用

    公开(公告)号:CN117004595A

    公开(公告)日:2023-11-07

    申请号:CN202310959595.2

    申请日:2023-08-01

    IPC分类号: C12N9/88 C12N15/60 C12P19/02

    摘要: 本发明公开一种醛缩酶及其在果糖‑6‑磷酸生物合成中的应用。本发明通过数据库挖掘、序列保守性分析、晶体结构模拟分析,获得了5条潜在具有催化二羟丙酮和3‑磷酸甘油醛合成果糖‑6‑磷酸的醛缩酶FSA,进一步研究发现得到耐受羟基乙醛,且针对3‑磷酸甘油醛的催化效率是甲醛的10倍的果糖‑6‑磷酸醛缩酶CsFSA。还通过定点突变提升该醛缩酶活性的突变体CsFSAA165G。由此还构建了人工转化一碳合成果糖‑6‑磷酸的高效合成体系,因此具有较大的应用价值。

    一种嗜热内切纤维素酶突变体及制备方法

    公开(公告)号:CN116970591A

    公开(公告)日:2023-10-31

    申请号:CN202311206014.4

    申请日:2023-09-19

    发明人: 吴信 高乐 张兆昆

    摘要: 本发明属于生物技术和微生物领域,具体涉及一种嗜热内切纤维素酶突变体及其制备方法。本发明通过酶蛋白理性改造新策略,借助机器学习和新型B因子分析的交叉策略,在嗜热内切纤维素酶发掘嗜热内切纤维素酶高度保守序列中的潜在突变位点,实现内切纤维素酶活性达到5800 IU/Ml,比改造前酶蛋白相比提升85.2%。本发明通过改造获得嗜热内切纤维素酶突变体,通过里氏木霉菌制备,表明大大提升了酶活力和热稳定性,具有较大应用价值。

    admX基因作为正调控因子在提高桃色欧文氏菌合成安吉菌素产量的应用

    公开(公告)号:CN116790651A

    公开(公告)日:2023-09-22

    申请号:CN202310731643.2

    申请日:2023-06-20

    IPC分类号: C12N15/74 C12N15/31 C12P17/10

    摘要: 本发明公开了提高桃色欧文氏菌合成安吉菌素产量的方法,包括:1)定向敲除桃色欧文氏菌基因组上的admX基因,构建得到admX敲除的桃色欧文氏菌菌株BKOX,admX基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;2)将admX基因过表达质粒转入admX敲除的桃色欧文氏菌菌株BKOX中,构建得到工程菌桃色欧文氏菌BKOX‑XP;3)将工程菌桃色欧文氏菌BKOX‑XP接种于液体培养基中培养,获取发酵液,从发酵液中收集安吉菌素。本发明还公开了桃色欧文氏菌admX基因作为正调控因子在提高桃色欧文氏菌合成安吉菌素产量的应用。本发明安吉菌素产量与野生型相比提高了260%,处于目前现有报道中的高水平行列。

    硝化细菌的高通量检测和分离方法

    公开(公告)号:CN113755366B

    公开(公告)日:2023-09-22

    申请号:CN202110935784.7

    申请日:2021-08-16

    发明人: 涂然 吕彤 王钦宏

    IPC分类号: C12N1/20 C12N1/02 C12Q1/04

    摘要: 本发明公开了一种硝化细菌的高通量检测和分离方法。本发明提供了一种富集和/或分离硝化细菌的方法:将菌液样本依次进行分散处理和稀释;将稀释液分别接种于NOB培养基和AOB培养基进行培养,然后检测培养体系中的氨氮含量、亚硝酸态氮含量和硝酸态氮含量,然后按照如下标准进行评价标准④:采用AOB培养基,氨氮含量下降且亚硝酸态氮含量上升且无硝酸态氮产生,样本中的硝化细菌为AOB纯菌标准⑥:采用AOB培养基,无亚硝酸态氮产生且无硝酸态氮产生;采用NOB培养基,亚硝酸态氮含量下降且硝酸态氮含量上升;同时满足,样本中的硝化细菌为NOB纯菌。本发明可用于解决硝化细菌分离困难的问题。

    一种酶号预测的系统及其应用方法

    公开(公告)号:CN116779024A

    公开(公告)日:2023-09-19

    申请号:CN202310480911.8

    申请日:2023-04-28

    摘要: 本发明提供一种酶号预测的系统及其应用方法,涉及酶号预测技术领域,系统(HDMLF)由嵌入核和学习核组成,嵌入核采用最新的蛋白质语言模型进行蛋白质序列嵌入,学习核进行EC号码预测,HDMLF基于门控循环单元(GRU)框架设计,以多目标层次、多任务的方式执行EC号码预测,另外HDMLF中引入了一个注意力层来优化EC预测,并采用贪心策略集成和微调最终模型,本发明首先引入和评估了最先进的深度学习语言嵌入方法,以进行通用蛋白质序列嵌入,然后,我们提出了一种基于GRU与注意力机制的新型预测方法,以多任务方式解决这三个任务,最后,采用反馈机制选择最合适的嵌入,并引入贪心策略将这些任务集成起来,以最大化EC预测性能。

    由甘油生成1,3-二羟基丙酮的方法及其应用

    公开(公告)号:CN116769845A

    公开(公告)日:2023-09-19

    申请号:CN202210242641.2

    申请日:2022-03-11

    摘要: 本发明公开了由甘油生成1,3‑二羟基丙酮的方法及其应用。本发明提供了一种由甘油生成1,3‑二羟基丙酮的方法,包括如下步骤:在1)大肠杆菌甘油脱氢酶GldA,2)戊糖乳杆菌NADH氧化酶LpNox或化脓性链球菌NADH氧化酶变体SpNox‑K184R,和3)NAD+存在下,底物甘油发生氧化反应生成1,3‑二羟基丙酮;所述SpNox‑K184R为将来源于化脓性链球菌的NADH氧化酶SpNox的第184氨基酸残基由K突变为R后得到的变体。本发明的获得的催化途径及成分配比可大大提高甘油到1,3‑二羟基丙酮的催化效率,并为乳酸和/或乙醇酸的合成提供原料,且可以在温和条件下进行,具有较好的应用前景。