一种基于多聚单核苷酸多态性的猪50K液相芯片及其应用

    公开(公告)号:CN116287168B

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202310552851.6

    申请日:2023-05-17

    摘要: 本发明涉及基因分子育种领域,具体涉及基于多聚单核苷酸多态性的猪50K液相芯片及其应用。本发明芯片的探针设计考虑了捕获的SNP位点在全基因组的分布情况、位点多态性、mSNP标记质量等问题,有效避免了标记密度不均匀和多态性较差等问题。还考虑了mSNP标记质量及mSNP标记间连锁不平衡问题,在保持液相芯片设计基本原则下,挑选标记间连锁不平衡程度中等的基因组区域,产生更多分型质量高、在探针区域内与靶位点连锁不平衡中等的SNP标记。本发明的mSNP液相芯片使可检测的SNP数目扩大到靶位点数的1.5‑2倍以上,解决了传统液相芯片高质量mSNP标记较少的问题,且成本没有增加。

    一种基于多聚单核苷酸多态性的猪50K液相芯片及其应用

    公开(公告)号:CN116287168A

    公开(公告)日:2023-06-23

    申请号:CN202310552851.6

    申请日:2023-05-17

    摘要: 本发明涉及基因分子育种领域,具体涉及基于多聚单核苷酸多态性的猪50K液相芯片及其应用。本发明芯片的探针设计考虑了捕获的SNP位点在全基因组的分布情况、位点多态性、mSNP标记质量等问题,有效避免了标记密度不均匀和多态性较差等问题。还考虑了mSNP标记质量及mSNP标记间连锁不平衡问题,在保持液相芯片设计基本原则下,挑选标记间连锁不平衡程度中等的基因组区域,产生更多分型质量高、在探针区域内与靶位点连锁不平衡中等的SNP标记。本发明的mSNP液相芯片使可检测的SNP数目扩大到靶位点数的1.5‑2倍以上,解决了传统液相芯片高质量mSNP标记较少的问题,且成本没有增加。

    一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN103045727B

    公开(公告)日:2014-04-02

    申请号:CN201210480570.6

    申请日:2012-11-22

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记的位点位于中国荷斯坦奶牛HAL基因如SEQ ID NO.1所示序列的197bp位点处,此处位点的碱基为G或A,此处碱基为G的中国荷斯坦奶牛的乳蛋白含量显著高于此处碱基为A的中国荷斯坦奶牛,而体细胞评分前者显著低于后者。本发明还提供了用于检测所述SNP标记的引物及含有该引物的试剂盒。本发明还提供了所述SNP标记在鉴定乳蛋白量高、体细胞评分低的中国荷斯坦奶牛优势品种中的应用。本发明还提供了所述SNP标记在中国荷斯坦奶牛分子标记辅助育种中的应用。本发明的SNP标记为中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分的标记辅助选择提供了科学依据。

    与中国荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN102676514B

    公开(公告)日:2013-07-17

    申请号:CN201210175477.4

    申请日:2012-05-30

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68

    摘要: 本发明提供了一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记及其应用,其位于中国荷斯坦奶牛PTK2基因如SEQ ID NO.1所示序列的227bp处,此处碱基为T的中国荷斯坦奶牛的产奶量、乳蛋白含量显著高于此处碱基为G的中国荷斯坦奶牛,而乳脂率前者显著低于后者。本发明采用聚合酶链式反应(PCR)和测序技术筛选到与中国荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记,并通过限制片段多态性(RFLP)方法来检测待测中国荷斯坦奶牛的基因型,根据基因型进行产奶量高的中国荷斯坦奶牛优势品种的选育,从而加快中国荷斯坦奶牛的育种进程。

    与中国荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN102676514A

    公开(公告)日:2012-09-19

    申请号:CN201210175477.4

    申请日:2012-05-30

    IPC分类号: C12N15/11 C12Q1/68

    摘要: 本发明提供了一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记及其应用,其位于中国荷斯坦奶牛PTK2基因如SEQ ID NO.1所示序列的227bp处,此处碱基为T的中国荷斯坦奶牛的产奶量、乳蛋白含量显著高于此处碱基为G的中国荷斯坦奶牛,而乳脂率前者显著低于后者。本发明采用聚合酶链式反应(PCR)和测序技术筛选到与中国荷斯坦奶牛产奶性状相关的SNP标记,并通过限制片段多态性(RFLP)方法来检测待测中国荷斯坦奶牛的基因型,根据基因型进行产奶量高的中国荷斯坦奶牛优势品种的选育,从而加快中国荷斯坦奶牛的育种进程。

    猪只体温智能采集系统及方法

    公开(公告)号:CN104698925A

    公开(公告)日:2015-06-10

    申请号:CN201510065152.4

    申请日:2015-02-06

    IPC分类号: G05B19/042

    CPC分类号: G05B19/0428 G05B2219/2612

    摘要: 本发明公开了一种猪只体温智能采集系统及方法,涉及农业工程信息化技术领域,本发明通过RFID模块在获取待测猪只的ID号后,由RFID模块向所述数据监控模块发送所述待测猪只的ID号,再由红外测温模块采集所述待测猪只的体表温度,能够自动分辨不同的猪只,并同步实现对所述待测猪只进行准确地体表温度采集,实现了在大群饲养中快速方便的测定每个猪只的体表温度。

    一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分相关的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN103045727A

    公开(公告)日:2013-04-17

    申请号:CN201210480570.6

    申请日:2012-11-22

    IPC分类号: C12Q1/68 C12N15/11

    摘要: 本发明涉及一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记的位点位于中国荷斯坦奶牛HAL基因如SEQ ID NO.1所示序列的197bp位点处,此处位点的碱基为G或A,此处碱基为G的中国荷斯坦奶牛的乳蛋白含量显著高于此处碱基为A的中国荷斯坦奶牛,而体细胞评分前者显著低于后者。本发明还提供了用于检测所述SNP标记的引物及含有该引物的试剂盒。本发明还提供了所述SNP标记在鉴定乳蛋白量高、体细胞评分低的中国荷斯坦奶牛优势品种中的应用。本发明还提供了所述SNP标记在中国荷斯坦奶牛分子标记辅助育种中的应用。本发明的SNP标记为中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分的标记辅助选择提供了科学依据。

    一种鉴定奶牛的乳脂量和乳蛋白率的方法及其使用的引物对

    公开(公告)号:CN117187239A

    公开(公告)日:2023-12-08

    申请号:CN202311185468.8

    申请日:2023-09-14

    发明人: 姜力 张勤 张心怡

    摘要: 本发明公开了一种鉴定奶牛的乳脂量和乳蛋白率的方法及其使用的引物对。该方法为检测待测奶牛基于C655T SNP位点的基因型,基于C655T SNP位点的基因型为CC纯合型的奶牛的乳脂量 基于C655T SNP位点的基因型为TT纯合型或CT杂合型的奶牛的乳蛋白率,C655T SNP位点为奶牛基因组中SEQ ID NO:1自5’末端起第655位的核苷酸。实验证明,根据奶牛基于C655T SNP位点的基因型可以鉴定乳脂量和乳蛋白率。本发明具有重要应用价值。