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公开(公告)号：CN116790736A
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN202311049377.1
申请日：2023-08-21
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本发明涉及一种利用单一荧光标签的DNA测序方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种利用单一荧光标签的DNA测序方法，先使用一种荧光标签标记四种含有不同碱基的dNTP分子，并通过控制四种含有不同碱基的dNTP分子在同一DNA测序反应体系中的浓度、机械力、相对分子质量、温度、酶催化、电、声和/或光，调节其在同一DNA测序反应体系中的扩散速率，以调控其参与DNA聚合反应的速率，使其表现出反应速率常数差异，再根据反应速率常数差异，识别出四种碱基，获得待测序DNA链的基因序列。所述DNA测序方法只需要一路激发‑探测光路，不依赖复杂光路系统，这将减小测序设备中光路系统的复杂性。
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公开(公告)号：CN117830518B
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202311798914.2
申请日：2023-12-25
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
摘要： 本发明涉及细胞学技术领域，公开了一种细胞组织三维重构和细胞分析方法、装置及存储介质，本发明通过轮廓提取方法和特征提取算法对第一细胞组织切片图像进行处理，同时，通过初始仿射变换矩阵和特征提取算法对第二细胞组织切片图像进行处理。进一步，在得到的处理后的第一初始特征矩阵和第二初始特征矩阵的基础上，通过寻优算法处理可以确定出最终的目标仿射变换矩。进一步，通过目标仿射变换矩和预设处理方法对第二细胞组织切片图像进行处理，可以实现每个第一细胞组织切片图像和每个第二细胞组织切片图像的配准并得到对应的细胞组织三维重构图像，实现了三维组织层间的精确配准，实现了细胞组织的三维多组学的精准分析。
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公开(公告)号：CN117830518A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202311798914.2
申请日：2023-12-25
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
摘要： 本发明涉及细胞学技术领域，公开了一种细胞组织三维重构和细胞分析方法、装置及存储介质，本发明通过轮廓提取方法和特征提取算法对第一细胞组织切片图像进行处理，同时，通过初始仿射变换矩阵和特征提取算法对第二细胞组织切片图像进行处理。进一步，在得到的处理后的第一初始特征矩阵和第二初始特征矩阵的基础上，通过寻优算法处理可以确定出最终的目标仿射变换矩。进一步，通过目标仿射变换矩和预设处理方法对第二细胞组织切片图像进行处理，可以实现每个第一细胞组织切片图像和每个第二细胞组织切片图像的配准并得到对应的细胞组织三维重构图像，实现了三维组织层间的精确配准，实现了细胞组织的三维多组学的精准分析。
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公开(公告)号：CN116625999A
公开(公告)日：2023-08-22
申请号：CN202310558188.0
申请日：2023-05-17
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： G01N21/64 , C12Q1/6869
摘要： 本发明公开一种评估零模波导孔有效载样的方法，包括：制备酶‑引物‑模板三元复合物；将三元复合物和芯片绑定；对芯片进行荧光淬灭，找到具有单个荧光的孔；对芯片进行荧光累积，找到荧光能够持续累积的孔；确定荧光淬灭阶段具有单个荧光，且荧光累积阶段荧光能够持续累积的孔为有效载样孔。本发明还公开了上述方法的应用。本发明构建了一种评估零模波导孔有效载样的方法，使用一种简单的酶‑引物‑模板三元复合物作为研究模型，利用荧光淬灭和荧光累积的过程进行双重判定，有利于更精准地筛选出单分子实时测序的有效载样孔。同时，还能够用于整个测序体系的优化，通过调整来优化有效载样率。
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公开(公告)号：CN117783068A
公开(公告)日：2024-03-29
申请号：CN202311617804.1
申请日：2023-11-29
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： G01N21/64 , G01N21/01 , G06T3/4038
摘要： 本发明提供的一种荧光成像运动控制装置及图像拼接方法，荧光成像运动控制装置包括基架、集成载物模块、二维位移台、Z轴位移台以及物镜组件，集成载物模块设于基架内；二维位移台与基架连接，且二维位移台驱动端与Z轴位移台连接，以带动Z轴位移台在集成载物模块上侧沿X、Y方向运动；物镜组件被配置为在二维位移台、Z轴位移台带动下在被检测样品上侧的物镜放置空间内进行三维运动，以对检测样品连续扫描成像，其无需在X,Y两个自由度上移动样品，当被检测样品处于复杂的集成载物模块中时，例如样品需要远距离加载，温度加热，气路进样等相关功能，由于无需移动样品，故而其可以兼容大视场和高分辨率。
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公开(公告)号：CN116790736B
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202311049377.1
申请日：2023-08-21
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本发明涉及一种利用单一荧光标签的DNA测序方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种利用单一荧光标签的DNA测序方法，先使用一种荧光标签标记四种含有不同碱基的dNTP分子，并通过控制四种含有不同碱基的dNTP分子在同一DNA测序反应体系中的浓度、机械力、相对分子质量、温度、酶催化、电、声和/或光，调节其在同一DNA测序反应体系中的扩散速率，以调控其参与DNA聚合反应的速率，使其表现出反应速率常数差异，再根据反应速率常数差异，识别出四种碱基，获得待测序DNA链的基因序列。所述DNA测序方法只需要一路激发‑探测光路，不依赖复杂光路系统，这将减小测序设备中光路系统的复杂性。
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公开(公告)号：CN117025375A
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202310348371.8
申请日：2023-04-03
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
摘要： 本发明提供一种微流控芯片、微流控芯片组件和数字核酸检测进样装置。微流控芯片，包括：流道层，流道层设置有用于容纳检测试样的检测流道；流道层还设置有进液口，进液口连通检测流道；试剂孔板，试剂孔板适于预装检测试剂；试剂孔板上设置有从厚度方向贯穿试剂孔板的若干微孔；流道层设置有容纳槽，试剂孔板适于卡设于容纳槽中；检测流道位于容纳槽的槽底，试剂孔板卡设于容纳槽中时，微孔与检测流道直接连通，试剂孔板背向检测流道一侧的表面与流道层的表面齐平；封装膜层，封装膜层适于将试剂孔板封装于容纳槽中，封装膜层贴附并覆盖试剂孔板表面和试剂孔板周围的流道层表面；封装膜层具有透气性。本发明的方案可提高微流控芯片的检测效率。
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公开(公告)号：CN116626011A
公开(公告)日：2023-08-22
申请号：CN202310906330.6
申请日：2023-07-24
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： G01N21/64
摘要： 本发明公开了一种用于单分子动力学检测的纳米光学器件，包括：纳米结构芯片和激光器；激光器用于向纳米结构芯片发射激光；纳米结构芯片包括纳米孔，纳米孔用于检测单分子的结合行为以及在激光照射下的解离行为，纳米孔的直径范围为50nm至200nm。本发明实施例提供的单分子动力学检测的纳米光学器件，通过设置纳米结构芯片中纳米孔的直径为50nm至200nm，该纳米孔能够对入射的激光产生阻挡效应，产生有效激发体积小于典型的零模波导，获得更高的时间分辨率。从而解决目前对于单分子动力学检测时间分辨率较差的技术问题。
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公开(公告)号：CN117089605A
公开(公告)日：2023-11-21
申请号：CN202311061603.8
申请日：2023-08-22
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，先通过splintR DNA连接酶连接分别与野生型RNA和突变型RNA完全匹配的两条锁式探针，形成DNA环状模板，再通过含有两套FQ探针的RCA反应进行实时荧光信号检测。此方法将FQ探针和RCA技术结合，实现了对RCA反应中突变位点的实时检测，并结合了splintR DNA连接酶能够以RNA为夹板高效连接DNA的特性，以及两套锁式探针相互竞争减少非特异性连接的方法，可以直接以RNA为靶标进行SNP基因分型检测，无需逆转录成cDNA。
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公开(公告)号：CN117089605B
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202311061603.8
申请日：2023-08-22
申请人： 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
IPC分类号： C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供了一种基于FQ‑RCA的RNA等温实时基因分型方法，先通过splintR DNA连接酶连接分别与野生型RNA和突变型RNA完全匹配的两条锁式探针，形成DNA环状模板，再通过含有两套FQ探针的RCA反应进行实时荧光信号检测。此方法将FQ探针和RCA技术结合，实现了对RCA反应中突变位点的实时检测，并结合了splintR DNA连接酶能够以RNA为夹板高效连接DNA的特性，以及两套锁式探针相互竞争减少非特异性连接的方法，可以直接以RNA为靶标进行SNP基因分型检测，无需逆转录成cDNA。
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