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公开(公告)号:CN108315452A
公开(公告)日:2018-07-24
申请号:CN201810396401.1
申请日:2018-04-28
Applicant: 内蒙古农业大学
CPC classification number: C12Q1/689 , C12Q1/686 , C12Q2563/159 , C12Q2545/114
Abstract: 本发明比对目前已经完成全基因组测序的所有双歧杆菌的全基因序列,以其单拷贝核心基因rp1N为目的序列设计引物,通过琼脂糖凝胶电泳进行初筛、微滴式数字PCR进行复筛,筛选出一对特异性较好的双歧杆菌属引物。这对引物可以特异性的“识别”出粪便样品等复杂样品中的双歧杆菌。
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公开(公告)号:CN108315402B
公开(公告)日:2021-02-12
申请号:CN201810396375.2
申请日:2018-04-28
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种用于肠道中双歧杆菌属测序的扩增引物对,包括上游引物Bif‑11F与下游引物Bif‑11R,以其为扩增引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,SMRT高通量测序之后,以所有已知双歧杆菌的序列使用QIIME(V1.7)平台对扩增序列进行物种注释,得到准确的鉴定结果。本发明提供的用于肠道中双歧杆菌属测序的扩增引物是基于双歧杆菌共有核心基因序列设计的,可以在种水平扩增出双歧杆菌,具有较好的特异性和实用性,能较好反映肠道中双歧杆菌的多样性。同时适用于发酵乳制品、粪便和土壤等样品中双歧杆菌的分析。
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公开(公告)号:CN108315402A
公开(公告)日:2018-07-24
申请号:CN201810396375.2
申请日:2018-04-28
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q1/04 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q1/689 , C12Q2535/122 , C12Q2531/113 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明提供了一种用于肠道中双歧杆菌属测序的扩增引物对,包括上游引物Bif-11F与下游引物Bif-11R,以其为扩增引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,SMRT高通量测序之后,以所有已知双歧杆菌的序列使用QIIME(V1.7)平台对扩增序列进行物种注释,得到准确的鉴定结果。本发明提供的用于肠道中双歧杆菌属测序的扩增引物是基于双歧杆菌共有核心基因序列设计的,可以在种水平扩增出双歧杆菌,具有较好的特异性和实用性,能较好反映肠道中双歧杆菌的多样性。同时适用于发酵乳制品、粪便和土壤等样品中双歧杆菌的分析。
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公开(公告)号:CN107937581B
公开(公告)日:2021-09-17
申请号:CN201711456825.4
申请日:2017-12-28
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于肠道中乳酸菌测序的扩增引物对,所述引物对为Lab‑6,包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的Lab‑6F和SEQ ID NO.2所示的Lab‑6R。该扩增引物对可以实现乳酸菌种属鉴定,具有较好的特异性和实用性,能较好反映肠道中乳酸菌的多样性。适用于发酵乳制品、粪便和土壤等复杂样品中乳酸菌的分析。
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公开(公告)号:CN108315452B
公开(公告)日:2021-02-12
申请号:CN201810396401.1
申请日:2018-04-28
Applicant: 内蒙古农业大学
Abstract: 本发明比对目前已经完成全基因组测序的所有双歧杆菌的全基因序列,以其单拷贝核心基因rp1N为目的序列设计引物,通过琼脂糖凝胶电泳进行初筛、微滴式数字PCR进行复筛,筛选出一对特异性较好的双歧杆菌属引物。这对引物可以特异性的“识别”出粪便样品等复杂样品中的双歧杆菌。
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公开(公告)号:CN107937581A
公开(公告)日:2018-04-20
申请号:CN201711456825.4
申请日:2017-12-28
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/689 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种用于肠道中乳酸菌测序的扩增引物对,所述引物对为Lab-6,包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的Lab-6F和SEQ ID NO.2所示的Lab-6R。该扩增引物对可以实现乳酸菌种属鉴定,具有较好的特异性和实用性,能较好反映肠道中乳酸菌的多样性。适用于发酵乳制品、粪便和土壤等复杂样品中乳酸菌的分析。
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