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公开(公告)号：CN119889483A
公开(公告)日：2025-04-25
申请号：CN202510029908.3
申请日：2025-01-08
Applicant: 内蒙古农业大学
Abstract: 本发明提供了一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌二对二互作预测及筛选方法，属于食品生产技术领域。该方法通过计算两株保加利亚乳杆菌和两株嗜热链球菌的全基因组k‑mer数据，形成各自的特征向量，并计算基因拷贝数以构建KEGG矩阵。通过合并KEGG特征和k‑mer特征频次，生成综合特征向量。利用卡方检验、梯度提升和方差分析，从真实标签样本中筛选出前200个重要特征。接着，通过生成对抗网络（GAN）生成伪标签样本，结合真实标签样本构建机器学习模型，用于预测菌株组合的互作效果。最后，通过发酵试验验证模型预测的准确性，并选出最优模型。本发明能够高效预测菌株组合的互作共生潜力，提高酸奶生产的效率和品质。
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公开(公告)号：CN118755620A
公开(公告)日：2024-10-11
申请号：CN202410957451.8
申请日：2024-07-16
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12N1/20 , A23L33/135 , A61K35/745 , A61P25/00 , C12R1/01
Abstract: 本发明提供一株动物双歧杆菌乳亚种Bbm‑19及其调节神经递质的应用，属于益生菌技术领域；所述动物双歧杆菌乳亚种Bbm‑19分离自健康妇女母乳中，保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物菌种保藏中心，保藏编号为：CGMCC No.25080。本发明的动物双歧杆菌乳亚种Bbm‑19菌体胞外能够合成短链脂肪酸、有机酸及其衍生物、氨基酸及其衍生物以及脑肠轴调节物质等功能活性物质。本发明的动物双歧杆菌乳亚种Bbm‑19具有调节机体血清素和γ‑氨基丁酸（GABA）水平的能力。本发明为开发具有功能活性物质以及改善神经系统紊乱的精神益生菌的深入研究和利用提供了一种全新的思路，具有巨大的研究和应用价值。
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公开(公告)号：CN116832068B
公开(公告)日：2024-04-09
申请号：CN202310694467.X
申请日：2023-06-09
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12N1/20 , A61K35/741 , A61P31/04 , A23L33/135
Abstract: 本发明提供一株分离自酸马奶的副干酪乳酪杆菌PC646，其保藏编号为CGMCC No.23515。通过胃肠液耐受性和胆盐耐受性测试确认该菌株具有良好的益生菌特性，特别是在胆盐浓度0.3％环境下培养，结果表明0.3％胆盐不会抑制该菌株的活性。此外该具备抑菌活性包括，其发酵后的无细胞提取液经脱盐、浓缩和喷雾干燥制备所得的抑菌制剂对于常见致病菌特别是金黄色葡萄球菌具有显著的抑制效果，且可以用于食品防腐保鲜。本发明为该菌株及其抑菌活性制剂的深入研究和开发利用提供了一种全新的思路。
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公开(公告)号：CN115938486B
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202211558598.7
申请日：2022-12-06
Applicant: 内蒙古农业大学
Abstract: 本发明公开了基于图神经网络的抗菌性乳酸菌株筛选方法，包括：S1、通过蛋白质预测方法得到已测序乳酸菌的多个开放阅读框；S2、利用乳酸菌抗菌肽图神经网络模型对开放阅读框进行预测，得到多个可能的乳酸菌抗菌肽片段集合A1；利用乳酸菌抗菌肽数据库对开放阅读框进行多序列比对，得到乳酸菌抗菌肽片段集合A2；利用生物信息软件工具Hmmer对开放阅读框进行结构域预测，得到结构域片段集合A3；S3、若片段集合A1、A2、A3交集不为空，则判断A1、A2、A3对应的乳酸菌具有抗菌性，最后通过溯源找到抗菌肽乳酸菌株。本发明采用上述方法，实现了高通量筛选、准确筛选和快速筛选。
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公开(公告)号：CN114999586B
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202210671757.8
申请日：2022-06-14
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: G16C20/30 , G06N20/00 , G06F18/25 , G06F18/23 , G06F18/214 , G06N3/0464
Abstract: 本发明公开了一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法，步骤如下：S1、数据预处理和特征提取；S2、确定标签；S3、模型的构建与评估，对步骤S2中的正负样本数据集采用机器学习、深度学习方法进行模型构建并对剩余的经过实验验证的50％的互作对和50％的不互作对采用评估指标进行评估；S4、模型的调优；S5、取m株保加利亚乳杆菌和n株嗜热链球菌的代谢通路图特征矩阵，通过对特征矩阵中相同的酶取交集并相加得到融合特征向量，通过降维方法对融合特征向量降维，重复S2到S4。S6、取S4和S5中评估结果较优的模型。本发明采用上述一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法，采用特征提取、聚类、机器学习与深度学习技术，加快了检测速度。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN107937581B
公开(公告)日：2021-09-17
申请号：CN201711456825.4
申请日：2017-12-28
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于肠道中乳酸菌测序的扩增引物对，所述引物对为Lab‑6，包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的Lab‑6F和SEQ ID NO.2所示的Lab‑6R。该扩增引物对可以实现乳酸菌种属鉴定，具有较好的特异性和实用性，能较好反映肠道中乳酸菌的多样性。适用于发酵乳制品、粪便和土壤等复杂样品中乳酸菌的分析。
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公开(公告)号：CN108315452B
公开(公告)日：2021-02-12
申请号：CN201810396401.1
申请日：2018-04-28
Applicant: 内蒙古农业大学
Abstract: 本发明比对目前已经完成全基因组测序的所有双歧杆菌的全基因序列，以其单拷贝核心基因rp1N为目的序列设计引物，通过琼脂糖凝胶电泳进行初筛、微滴式数字PCR进行复筛，筛选出一对特异性较好的双歧杆菌属引物。这对引物可以特异性的“识别”出粪便样品等复杂样品中的双歧杆菌。
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公开(公告)号：CN107937581A
公开(公告)日：2018-04-20
申请号：CN201711456825.4
申请日：2017-12-28
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/689 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种用于肠道中乳酸菌测序的扩增引物对，所述引物对为Lab-6，包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的Lab-6F和SEQ ID NO.2所示的Lab-6R。该扩增引物对可以实现乳酸菌种属鉴定，具有较好的特异性和实用性，能较好反映肠道中乳酸菌的多样性。适用于发酵乳制品、粪便和土壤等复杂样品中乳酸菌的分析。
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公开(公告)号：CN101705235B
公开(公告)日：2012-12-26
申请号：CN200910250671.2
申请日：2009-12-14
Applicant: 内蒙古农业大学
IPC: C12N15/31 , C12N15/10 , C07K14/195 , C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种干酪乳杆菌Zhang中GroEL的蛋白序列，提供了一种新的干酪乳杆菌热休克蛋白GroEL的编码核苷酸序列，该序列是干酪乳杆菌Zhang应激密切相关的基因，该序列的核苷酸序列与已公布的干酪乳杆菌BL23的核酸序列FM177140和干酪乳杆菌ATCC334的核酸序列CP000423有99％的相似性。本发明还提供了干酪乳杆菌Zhang中的GroEL基因的核酸序列，该核酸序列为SEQ ID NO：1，本发明还提供了一种分离出的干酪乳杆菌Zhang热休克蛋白GroEL的氨基酸序列，该序列的氨基酸序列为SEQ ID NO：2。
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