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公开(公告)号：CN115894710A
公开(公告)日：2023-04-04
申请号：CN202211075360.9
申请日：2022-09-04
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域，具体为一种靶向新冠病毒刺突S蛋白的纳米抗体同源三聚体及其获得方法和应用。本发明设计的纳米抗体三聚体是将靶向新冠病毒S蛋白的纳米抗体Nb6用18个氨基酸长的肽段连接在具有自组装能力的15型胶原蛋白三聚化结构域上而得，称之为Tribody。用分子动力学模拟技术评估Tribody，表明其三聚化结构域异常稳定；用生物膜层干涉实验检测Tribody与S蛋白的结合亲和性，结果说明三聚体与S蛋白的结合亲和性很高；采用假病毒中和实验检测三聚体的新冠病毒中和能力，结果表明Tribody具有很强的病毒中和能力。故本发明的高亲和性纳米抗体三聚体具有开发成抗新冠病毒的中和抗体药物的巨大潜力和应用价值。
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公开(公告)号：CN119438596A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411511029.6
申请日：2024-10-28
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种结合短时抗生素刺激后的细菌代谢指纹图谱与机器学习的细菌耐药性快速检测方法。通过将细菌在含有折点浓度抗生素的液体培养基中进行短时间孵育，细菌的代谢途径会发生变化，进而影响下游代谢物的生成。由于耐药菌具备特殊的耐药机制，其代谢状态的变化与敏感菌不同。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对抗生素短时刺激后细菌的代谢物指纹图谱进行分析；数据获取后通过机器学习进行分类分析，从而实现细菌抗生素耐药性的快速检测。与现有方法相比，本方法能够在2小时内完成细菌耐药性检测，具备较高的实用性和可操作性，同时具有高通量和低实验成本的特点。
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公开(公告)号：CN118255898A
公开(公告)日：2024-06-28
申请号：CN202311286132.0
申请日：2023-10-07
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域，具体为一种靶向新冠病毒S蛋白的自组装型三价纳米抗体及其应用。本发明的三价纳米抗体由一段25个氨基酸的柔性连接子将靶向新冠病毒(Omicron BA.1)Spike蛋白的纳米抗体Nb67连接在T4噬菌体纤维蛋白C‑末端的Foldon三聚化结构域所得，记为Tr67；实验结果显示，与Nb67相比，Tr67与S蛋白受体结合域(RBD)的亲和力提高约20倍，对Omicron假病毒的中和活性提高约10倍，且能中和多种全球流行的Omicron亚型，包括Nb67无法中和的亚型，中和能力显著高于Nb67。结构解析表明，Tr67能够同时结合S蛋白上的3个RBD，发挥协同效应。因此，Tr67具有开发成为广谱抗新冠病毒蛋白药物的潜力。
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公开(公告)号：CN115819523B
公开(公告)日：2023-12-05
申请号：CN202211218440.5
申请日：2022-10-05
Applicant: 复旦大学
IPC: C07K14/165 , C12N15/50 , C12N15/70 , C07K1/26 , C07K1/22 , C07K1/34 , C07K1/36 , C12N1/21 , A61K39/215 , A61P31/14 , C12R1/19
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域，具体为一种靶向新冠病毒S蛋白受体结合域的三价蛋白的优化设计方法。本发明采用竞争性结合RBD的抗新冠病毒小蛋白miniACE2作为单价药效蛋白，选择天然存在且低免疫原性的T4噬菌体纤维蛋白C‑末端foldon结构域作为三聚化支架；基于S蛋白的结构信息设计长度和柔性不同的接头序列，构建出多个候选三价重组蛋白，通过分子动力学模拟探究其结构特性如构象稳定性、构象异质性以及自组装效率，最后用实验方法验证其相关理化性质及功能。经实验验证，本发明设计得到的三价蛋白MP‑5ff具有很高的S蛋白结合亲和性和极佳的构象稳定性和自组装效率，是潜在的抗新冠病毒蛋白药物。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114606227A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210163391.3
申请日：2022-02-22
Applicant: 复旦大学
IPC: C12N15/11 , C12N15/63 , C12N15/113 , C12N1/21 , C12N5/10
Abstract: 本发明公开了一种高精度腺嘌呤碱基编辑器及其应用。本发明的腺嘌呤碱基编辑器是将野生型腺嘌呤碱基编辑器ABE8e的SpCas9(D10A)和脱氨酶TadA*之间的linker从头设计并替换后所得。这些高精度腺嘌呤碱基编辑器不仅大大缩短了linker的长度，而且在靶位点具有与野生型ABE8e相当甚至更高的基因编辑活性。并且这些腺嘌呤碱基编辑器大大缩小了野生型ABE8e的编辑窗口，有效提高了ABE8e的编辑精度，使之编辑更加准确。因而这六个高精度腺嘌呤碱基编辑器在生物医药的精准基因编辑方面具有更大的应用潜力。
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公开(公告)号：CN115894710B
公开(公告)日：2023-09-15
申请号：CN202211075360.9
申请日：2022-09-04
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域，具体为一种靶向SARS‑CoV‑2刺突S蛋白的纳米抗体同源三聚体及其获得方法和应用。本发明设计的纳米抗体三聚体是将靶向SARS‑CoV‑2的S蛋白的纳米抗体Nb6用18个氨基酸长的肽段连接在具有自组装能力的15型胶原蛋白三聚化结构域上而得，称之为Tribody。用分子动力学模拟技术评估Tribody，表明其三聚化结构域异常稳定；用生物膜层干涉实验检测Tribody与S蛋白的结合亲和性，结果说明三聚体与S蛋白的结合亲和性很高；采用假病毒中和实验检测三聚体的SARS‑CoV‑2中和能力，结果表明Tribody具有很强的病毒中和能力。故本发明的高亲和性纳米抗体三聚体具有开发成抗SARS‑CoV‑2的中和抗体药物的巨大潜力和应用价值。
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公开(公告)号：CN109541011A
公开(公告)日：2019-03-29
申请号：CN201811316615.X
申请日：2018-11-07
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多孔材料和质谱技术检测尿液中本周蛋白的方法。该方法利用纳米孔材料吸附尿液中的本周蛋白，通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术检测纳米孔材料吸附的本周蛋白。本发明构建的检测本周蛋白方法，能够准确地检测临床尿液样本中的本周蛋白，具有较强的可操作性和实用性。
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公开(公告)号：CN115819523A
公开(公告)日：2023-03-21
申请号：CN202211218440.5
申请日：2022-10-05
Applicant: 复旦大学
IPC: C07K14/165 , C12N15/50 , C12N15/70 , C07K1/26 , C07K1/22 , C07K1/34 , C07K1/36 , C12N1/21 , A61K39/215 , A61P31/14 , C12R1/19
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域，具体为一种靶向新冠病毒S蛋白受体结合域的三价蛋白的优化设计方法。本发明采用竞争性结合RBD的抗新冠病毒小蛋白miniACE2作为单价药效蛋白，选择天然存在且低免疫原性的T4噬菌体纤维蛋白C‑末端foldon结构域作为三聚化支架；基于S蛋白的结构信息设计长度和柔性不同的接头序列，构建出多个候选三价重组蛋白，通过分子动力学模拟探究其结构特性如构象稳定性、构象异质性以及自组装效率，最后用实验方法验证其相关理化性质及功能。经实验验证，本发明设计得到的三价蛋白MP‑5ff具有很高的S蛋白结合亲和性和极佳的构象稳定性和自组装效率，是潜在的抗新冠病毒蛋白药物。
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