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公开(公告)号:CN109801677A
公开(公告)日:2019-05-24
申请号:CN201811636702.3
申请日:2018-12-29
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 公开了一种用于染色体异常检测的测序数据自动化分析方法、装置和电子设备。该方法包括:获取原始数据;从用户接收分析指令;基于所述分析指令从所述原始数据获取批次数据;将所述批次数据拆分为样本数据;将拆分后的样本数据进行数据质控;以及,对数据质控成功的每条所述样本数据进行染色体非整倍体及基因微缺失分析以获得分析结果。这样,能够基于用户指令直接从原始数据获得染色体非整倍体及基因微缺失分析结果,从而降低染色体分析的人力和时间成本并提高易用性。
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公开(公告)号:CN109949865A
公开(公告)日:2019-06-28
申请号:CN201910202273.7
申请日:2019-03-18
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
IPC分类号: G16B30/00
摘要: 公开了一种序列截取方法、装置和电子设备。该方法包括:获取参考序列,所述参考序列以遍历方式读取且包括多个段落;获取多个待截取序列的段落信息和位点信息;按照所述参考序列的遍历顺序,基于所述段落信息和所述位点信息对所述多个待截取序列进行排序;以及,在遍历所述参考序列的同时,基于所述段落信息和所述位点信息从所述参考序列中依顺序截取所述多个待截取序列。这样,即使针对无索引的参考序列和存在重叠和嵌套的多个待截取序列,也可以通过遍历该参考序列一次性截取该多个待截取序列,从而显著地提高了截取效率。
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公开(公告)号:CN111383714A
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201910202238.5
申请日:2019-03-18
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
摘要: 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用,其中,该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度,并能准确地模拟出接近真实的捕获测序条件下目标区域的深度波动,从而更加真实地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且,该方法既能模拟全基因组下机数据,也能模拟捕获测序下机数据,适用范围广。同时,该方法运行速度快,能够在较短的时间内生成所需的模拟序列,并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号:CN110607352A
公开(公告)日:2019-12-24
申请号:CN201910740285.5
申请日:2019-08-12
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
摘要: 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中,该构建DNA文库的方法包括:提供嵌合标记物的DNA,其中,所述嵌合标记物的DNA具有三维结构信息;将所述嵌合标记物的DNA进行转座处理,以便得到转座产物;对所述转座产物进行捕获处理,以便得到捕获后的DNA;以及将所述捕获后的DNA进行扩增处理,以便获得所述DNA文库。该建库方法步骤简单,耗时短,尤其适用于痕量DNA样本的文库构建,并且测序的有效数据比例高,噪音单末端悬挂值低。
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公开(公告)号:CN109801677B
公开(公告)日:2023-05-23
申请号:CN201811636702.3
申请日:2018-12-29
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 公开了一种用于染色体异常检测的测序数据自动化分析方法、装置和电子设备。该方法包括:获取原始数据;从用户接收分析指令;基于所述分析指令从所述原始数据获取批次数据;将所述批次数据拆分为样本数据;将拆分后的样本数据进行数据质控;以及,对数据质控成功的每条所述样本数据进行染色体非整倍体及基因微缺失分析以获得分析结果。这样,能够基于用户指令直接从原始数据获得染色体非整倍体及基因微缺失分析结果,从而降低染色体分析的人力和时间成本并提高易用性。
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公开(公告)号:CN110490450A
公开(公告)日:2019-11-22
申请号:CN201910753688.3
申请日:2019-08-15
摘要: 公开了一种基于混合云的生物信息管理系统。该基于混合云的生物信息管理系统包括:基础设施层,包括经由物理链路联通的至少一个本地互联网数据中心和公有云;平台层,包括调度服务平台和容器服务平台;以及,软件层,用于将下层的数据和应用通过生物信息管理服务经由统一接口提供给用户,并接收用户提交的数据。这样,通过混合云向用户提供包括数据和应用的生物信息管理服务,并与用户进行数据交互,可以实现高性能的生物信息管理系统。
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公开(公告)号:CN111383713B
公开(公告)日:2023-08-01
申请号:CN201811642911.9
申请日:2018-12-29
申请人: 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/00 , G16B50/30 , G16H50/20 , G16H70/40 , C12Q1/6886
摘要: 本发明涉及一种ctDNA检测分析装置,其包括:数据处理模块、体细胞变异获取模块、体细胞变异筛选模块。
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公开(公告)号:CN111383714B
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN201910202238.5
申请日:2019-03-18
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
摘要: 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用,其中,该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度,并能准确地模拟出接近真实的捕获测序条件下目标区域的深度波动,从而更加真实地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且,该方法既能模拟全基因组下机数据,也能模拟捕获测序下机数据,适用范围广。同时,该方法运行速度快,能够在较短的时间内生成所需的模拟序列,并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号:CN111383713A
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201811642911.9
申请日:2018-12-29
申请人: 北京安诺优达医学检验实验室有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/00 , G16B50/30 , G16H50/20 , G16H70/40 , C12Q1/6886
摘要: 本发明涉及一种ctDNA检测分析装置,其包括:数据处理模块、体细胞变异获取模块、体细胞变异筛选模块。
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公开(公告)号:CN109949865B
公开(公告)日:2020-03-31
申请号:CN201910202273.7
申请日:2019-03-18
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
IPC分类号: G16B30/00
摘要: 公开了一种序列截取方法、装置和电子设备。该方法包括:获取参考序列,所述参考序列以遍历方式读取且包括多个段落;获取多个待截取序列的段落信息和位点信息;按照所述参考序列的遍历顺序,基于所述段落信息和所述位点信息对所述多个待截取序列进行排序;以及,在遍历所述参考序列的同时,基于所述段落信息和所述位点信息从所述参考序列中依顺序截取所述多个待截取序列。这样,即使针对无索引的参考序列和存在重叠和嵌套的多个待截取序列,也可以通过遍历该参考序列一次性截取该多个待截取序列,从而显著地提高了截取效率。
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